 |
Simple sequence repeat (SSR)
>UN27013
GGGCTCCCAACTCTGTCTTCTCTTTCTCTCTAACTCGATTTCACAAACCCAAACCCTAATTTCTCTTCTTCACCGGGGGGATTAGTTCAAATCT
AGGGTTCTCTGGGTACCAAATCAATGGAATCAGATCAGGGGAAGCTCTTCATCGGCGGGATTTCATGGGACACGGACGAGAATCTCCTGAGAGA
GTACTTCACCAACTACGGCGAGGTTTCTCAGGTCACAGTCATGCGAGAGAAAGCCACGAGCCGTCCCAGGGGATTCGGATTCGTCTCCTTCTCC
GATCCCGCCGTCATCGATAGGGTTCTTCAGACCAAACACCACATCGATAATAGAGATGTTGATGTGAAGAGGGCAATGTCTAGAGAAGAGCAGA
GTCCTGGTGGTGGTAGTAGAGGAGGGAGTTTTAATGGTGCTTCTAGGAGTTTTGATAGTGGAGCTAACGTTCGTACCAAGAAGATATTCGTGGG
AGGTTTGCCTCCTGCTTTGACGTCTGATGAGTTCAGGGCCTACTTCGAGAGTTACGGCCCTGTGAGCGATGCGGTGATTATGATTGACCAGACC
ACGCAGCGGCCTAGAGGGTTTGGGTTTGTTTCGTTTGACTCTGAAGATTCGGTTGACCTTGTTTTGCACAAGACTTTCCATGATTTGAGTGGGA
AGCAAGTAGAGGTTAAGAGAGCCCTTCCTAAAGATGCTAATCCTGGAGTAGCCGGCGGTGGTGGTGGTGGTCGTGGTTTCCCGGGCTATGGTGA
GGGTCGTGTTGATTCCAGTAGTAGATACATGCCGTCTCAAAACGCTGGAGGAAGCGGTTATCCTCCTTATGGTGGTTCTGGGTATGGTGCTGGT
TATGGTTATGGCAGCAACGGTGTAGGTTATGGGGGTTTTGGAGGGTATGGGAATCCATCTGGTGCGCCTTATGGGAACCCTGGTGTGACTGTCC
CTGGAGCTGGGTTTGGAAGTGGTCCAAGAAGTTCGTGGGGAGGTCAAGCACCGTCTGGTTACGGTAACGTGGGATATGGAAATGCTGCTGCTGC
TCCGTGGGGTGGTTCTGGTCCCGGTTCAGCAGTGATGGGTCAAGGAGGTGCATCTGCAGGTTATGGCGGTCAAGGTTATGGATATGGTGGGAAT
GATTCCTCTTATGGGACTCCATCTGGTTATGGTGCAGTCGGTGGGCGGCCTAACAGCCTTGGCGGTGGCTATGCTGATGGTTTAGATGGCTATG
GGAATCACCAAGGGAGCGGGCAAGCTGGTTATGGCGGTGGTTATGGAAGCGGGAATCAAGCTTTACAACAGTGATTGGAGGAAGAAAGACTACT
ACATTGTGGTCTTATCTTTGACCTTGAATATCCTCCTCTCTTGGATCCTTATGGATGCCGCCCTTTGACCTGGATTATCTCTTTTGTTAGTTTC
TTAATAAGTTGTTGGTCAGGCACTTCTTGATGCTGAGTCGTACTTAGTATTTCATATGAAAGTTGTAGTGTGCTTATTTATTTTTTTGTTGCTT
TGGAATGTTTTGTTTTCTTTTCTCTATGCTAGTATCTGTGTTAACAATAACTTATCACCG |
Primers for UN27013 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CGATGCGGTGATTATGATTG |
59.914 |
20 |
AACACGACCCTCACCATAGC |
59.997 |
20 |
226 |
537 |
762 |
| 2 |
CGATGCGGTGATTATGATTG |
59.914 |
20 |
TCAACACGACCCTCACCATA |
59.96 |
20 |
228 |
537 |
764 |
| 3 |
GAGAGTTACGGCCCTGTGAG |
59.867 |
20 |
TCAACACGACCCTCACCATA |
59.96 |
20 |
248 |
517 |
764 |
|
|
