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Simple sequence repeat (SSR)
>UN27149
GCAAACGTCATCGTTTTGGGAGATTCCGTTTGTATAAGACCAGATCAGGAGATTCAGAAAACCTCTGTTAACCAGAGTGTTTAGGAGGTTCCCA
AGTGTTTGAGGTGTGGTGATAAACAGAGCAACAGGTTCTTCAGAGACCCAAAACAAAAACATCGTTTGGATTTACTTAAGTCAAGAACCTGATA
CCAAAACCTAAAATGAAATTCTAAAGAGAGAGAGAGTTGTAGTATTTGCTAACAAGTCCTTGTGGGGGTATTAGGACAATGAGAGTGGAAAACT
TGATCGAAAGGATCATTCGTGGGTTGTGTTTTAAGTGGAGAGACTAGAGTTTTCTCGTTCAAGATCTTAACCAAAATTGGGTTTTTGGGATGGG
TTTATTGACTTAATTAGTGTTAATTTCTGTGTGTTTTTGAGTGCTAATTCTATGTTTTCAAAGTGCTAATTATGTCCGAAATAAGGTGATGGAG
GTCTTGTTTTACCCAGACGTTTTCTGTTTTTGTCTTTTTCCTTTTGTGTCTGATCAGGTAACAAAAACCATCGAAGGGTTGCTTCCATTGCCCA
AGGTTTGTAGCCCAAATGACCCAAGAATGATCGAGTTGAAAGAGCTCGAAGCAGCCAAGGCAGCGATCGATGTGAAAGCACACTCTTTGGTGCG
GAGAGAGCTCTGGGCTGGTCTGGGTTACTTGATCCTACAGACCGCGGGGTTCATGAGGCTAACGTTTTGGGAACTCTCGTGGGATGTGATGGAA
CCGATATGTTTTTATGTCACGTCTATATACTTTATGGCTGGGTATGGTTTCTTCCTCAAGACATCGAAAGAGCCTTCCTTTGAAGGGTTCTATC
AAAGCAGGTTCGAAGCGAAACAGAAGAAGCTTATGAATGTTCATGAGTTTGATGTTGAGAGGTATGATGAGCTCAAGAAGCTGTTTTGCCCTAA
AGCTTCAGATCGTGTTTCCAAGATTCTTTGTTGTGTTTGATTTTTCCTAACTAGAGAATTCTACCGGCCCAAAAGAAAAGAAATGAATAGGTAG
GAAGTTCTCAAGTTTTCGGTTTTCCAAAGAAAAAAATTGTTCGAATTATTGCGGCTTGTGTAACATCAGGGAAGAGTTGTGTTTTTCGTTTTCA
AAGTTTTTCTTTTATGAGATTAATCTAAAATGTAAGAGAACCATGTAAATATAAAATATGTAAATGTTTGAATTGTT |
Primers for UN27149 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
GGAGGTTCCCAAGTGTTTGA |
59.943 |
20 |
ACACAACCCACGAATGATCC |
60.645 |
20 |
228 |
84 |
311 |
| 2 |
GGAGGTTCCCAAGTGTTTGA |
59.943 |
20 |
TCCTAATACCCCCACAAGGA |
59.24 |
20 |
181 |
84 |
264 |
| 3 |
TCCCAAGTGTTTGAGGTGTG |
59.565 |
20 |
ACACAACCCACGAATGATCC |
60.645 |
20 |
222 |
90 |
311 |
|
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