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Simple sequence repeat (SSR)
>UN28053
TTTTTGTAAGAGAGAAGAAGAGAGAGAGAAGGCTATGGAAAGATAGATAAAACTCAGTTTATTTTGAAAATACACAGAGGAGAGAGATAGAGAG
AGAAGGAGATGGGGGATTCAAGCGGTTCTGTCTCCATTGATATGGAGGCAATGTCTCTTGGAGGACAGGAACACCTTGTGGAGACTACCTATGG
CCCGGTATGTGTTGCCGTTTGTGGAGATCCTGATAAACCTGCTCTTATCACATATCCTGATGTTGCTCTTAATTATATGTTTTCTTTTCAAGGG
TTGTTGTTTTGTCCAGAAGCTAGTTCCTTGTTACTCCACAACTTTTGCATTTATCACATCAGTCCTATTGGCCATGAGTTAGGAGCTCCAGTGA
TCGGTGTTGATGCTCCTTTGCTCTCAGCTGATGACTTAGCTGACCAGATAGTCGAGGTTCTTAACTATTTCGGACTTGGTGCAGTAATGTGTAT
GGGAGTCACAGCAGGAGCTTACATTCTGACCTTATTTGCTATGAAGTACAGAGAGTTCTGGGATTAATACTCGTCTCTCCACTGTGCCAAGCTC
CTTCTTGGTCAGAATGGTTGTGCAATAAGGTTATGTCTAATCTTCTTTATTACTATGGCATGTGCGGAGTGGTTAAAGAATTGCTACTAAAACG
GTACTTCAGCAAGGAAGTTCGTGGTAATGCTCAAGTTCCAGAATCAGATATTGTTCAAGAATGCAGAAGATTACTTTGCGAGCGGCAGAGTACA
AATGTATGGAGATACCTTGAGGCAATCAACGGGAGAGTGGACCTTAGCGAAGAGTTAAGGAAACTGCAATGCAGAACTTTAATATTCATCGGCG
AAAATTCAGCTTACCACTCAGAGGCCGTTCACATGACCACAAAACTAGACAGACGATACGGCGCACTAGTCGAGGTACAAGGAAGCGGGTCGTT
GGTGACAGAATAGCAGCCACAGGCGATGGTAATACCGATGGAATACTTTTTGATGGGGTACGGATTGTATCGTCCAGCACAGAGCGTGAGCCCG
AGAAGTCCTTTGAGCCCAACGAGGATCTCGCCTGAGCTTCTCTCCCCTGAAAACATGGGGTTGAAGCTCAAGCCCATTAAGACAAGACTCGCGC
TATGACACACAACTCTGCCTCCTCCTCTTTGTGCTATAGAAATTATTGCAACATATATATATATTTATATACGTTACATAAAAAAAATCGACAT
TGGTTTGTGGAGTTTGAGATGCTCTTTTGTGTTATGATTAAAGCTGTAGATATAGACAGGGACACAGATGTTTTATGTTTTTTGGAAATTTTGT
GGTAGCTGTTATTGTTATGTTTGTACATTTTGTTGAATAAATCATTTAAGGAAAATTTCCC |
Primers for UN28053 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CACAACTCTGCCTCCTCCTC |
59.986 |
20 |
AAACTCCACAAACCAATGTCG |
59.883 |
21 |
102 |
1136 |
1237 |
| 2 |
TGTATCGTCCAGCACAGAGC |
60.016 |
20 |
AAACTCCACAAACCAATGTCG |
59.883 |
21 |
232 |
1006 |
1237 |
| 3 |
TCTCTCCCCTGAAAACATGG |
60.042 |
20 |
AAACTCCACAAACCAATGTCG |
59.883 |
21 |
165 |
1073 |
1237 |
|
|
