|
Simple sequence repeat (SSR)
>UN28488
GATCTGTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTCTCTCCGCGCTTGAGGTAAGGCGTCGGAGATTAATCACCAAAAGCTCTCGGATCCTCTTCGTCATGG
CGACATCAGGTGGAAGTCCTCCTAAGCCATGGGAACAAGAAGGGAACAACAACGCATCTGCTGGGCCTAAGCCTTTCAGGCCTCCTTCCAATAC
CAGCACTGCTGATTCCGTTGAGGCTTCTGGGACAGCGAATCCTGGTGAGCTAGTTTCGTCTGTTAACAGGACTAATACAGCTGCTGGTACAATG
AATGGACTGAGTAGGCCTGTGCCGAGTAGGCCTTGGGAGCAACAGCAAACCTATGGAAGCACTTACGGTGGTGGTTATGGTTCAAACCTAGGTA
TGACCTCTGGGTATGGGTCTGGTACATATGGTTCAGGACTAGGTGGGTATGGTTCGTCGTATGGGGGTGGGATGTATGGTGGTAGCAGCATGTA
TAATAGAGGAGGTTATGGTGGTGGTGGTCTCTATGGGAGTTCAGGTATGTATGGTGGTGGTGGTGGGATGTACGGCAGCAGTTTTGGTGGTGGT
TATGGTATGGGTATGGGGACAGGGATGGGTATGGGTATGGGGATGGGAATGGGGATGAGTCCTTATGGTGGTCAAGATCCAAATGATCCTTTTA
ATCAGCCTCCATCTCCACCAGGCTTCTGGATATCATTTCTCCGTGTGATGCAAGGTGCTGTGAATTTCTTTGGCCGTGTAGCGATGCTGATAGA
CCAGAACACACAGGCTTTTCATATGTTCATGTCTGCCCTTCTTCAGCTATTTGATCGTGGTGGTATGTTATATGGAGAATTGGCGAGATTTGTA
TTGTGTATGCTTGGGGTGAGAACAAAGCCTAGAAAGATGCAGCAACAGCAGCAGCAGCTAGGGCCTAATGGACTCCCTTTACCACACCAGCCAC
ATGGAAACCAGAACTACATCGAGGGTCCTAAAGCCGGGGCTGCACCAGGTGGTGGCGGTGGTGGTTGGGATAATGTATGGGGTAACTAAGTTGC
TTCGTTTCTTTAAGCCAAGTCCTTCAACGTTACTCTGAATACACAAATGGTAATCAGTTTGGATATGAGTAGATTGTGCAGCGGCCTCCTAAGC
AGATTGGGTTGTTGTTGTACTAAGGCCTGATGTTTGTTTACAAATCGAGTCTCTTTTTTTGAGTGTTCTGGTTATGTGATAAACAAGTTGCAGA
TATTTATGTCGAACTCAGTAAAATGGAAAGTGAAGTTGTAAAAGAGTTTCTAAAAGACATATCTGTTGTGTATTCATTTAATATTATTGGATTC
TTTTCTTCTTTTTACTGGATTT |
Primers for UN28488 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
1 |
GAAGCACTTACGGTGGTGGT |
60.035 |
20 |
ATCCCCATACCCATACCCAT |
59.981 |
20 |
271 |
338 |
608 |
2 |
GAAGCACTTACGGTGGTGGT |
60.035 |
20 |
CATACCCATACCCATCCCTG |
59.887 |
20 |
266 |
338 |
603 |
3 |
GTATGGTTCGTCGTATGGGG |
60.074 |
20 |
CATACCCATACCCATCCCTG |
59.887 |
20 |
181 |
423 |
603 |
|
|