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Simple sequence repeat (SSR)
>UN31015
GAGAAAATATACATGAATTTTTGATAATTTCAAATGATGTCTGATGTTTATTTTATTGTGAAATCATATACCAATCACAACATCACCTTCCATG
TCACTTAATTTTGATGATGTGGTTGTTACATCAACTAATTTTATTGACGAAGATGTCACGTGTACAGTTTTTCGTAGAAAGTATATAGTCATTT
TATAAAAATAACTTTGTAAAGATATAAATTTATGAATTTTTATCTTTTAGTAAAATTAAGAAAAAGTAATTAAATTTCAATCTTATATTAAAGA
TATATTCCTAAATGTTTTGATCATATCGTAATACCATCCTTAGAAGAATTATATATGCGTTACACATTTTAATGATTCAAATTCAATGCTAGTT
TCACAATCTTGTTATTCTTTATTAATCATAGTATGTTATTTACATTTAAAGATTTTATATTAACATATCGTAGTTTTTTTAATTTATAACATAA
CCTGATTACTCGAGAGTAGCACGACTGTGACACTAACATTGAATTTGTAATAACCTGATTACTCGAGAGTAGCACGACTGTGACACTAACATTG
AATTTGAATCATTACAACACATATATAACTTTTTAAATTATGATTTGTGATAGGATCAAAACATTTACGAATAAATTTCTCATATAAGATTAAA
ACTTAATTAATTTACTAATATTTTTTCATTTTAATAAATAATAAAATTTATATTTTCTAAAAAGTTATATTTGTAAAACGACCATTTAGTTTTC
TCAAAATATATATATATGGTATTTTCGTCAGCAAAATTAACTGATGTAGCATTCACGTCATCAAAATTAGAAACATGGTAGATGATGTGGTGAC
TGGCTCTATATGTATATTTTGAAAGTTTGTATACTATTAAATTAGAACTTGATCCGTGACACCGCGTGAATTTTGATTTTGATTTTTGTTTTTA
TAAATTGTTTAATGTTCTTCTTAAATATATAGGTTATTTAGATATTTTTATGTTTATGCGAACCTATCCAGACCCGGAAGGATCAATTTAAACC
TCATCTAGAAATATATAATATCTGCATGTC |
Primers for UN31015 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CTCGAGAGTAGCACGACTGTG |
58.843 |
21 |
CATCAGTTAATTTTGCTGACGAA |
59.307 |
23 |
267 |
532 |
798 |
| 2 |
ACTCGAGAGTAGCACGACTGTG |
59.735 |
22 |
CATCAGTTAATTTTGCTGACGAA |
59.307 |
23 |
268 |
531 |
798 |
| 3 |
CGAGAGTAGCACGACTGTGA |
57.705 |
20 |
TGACGTGAATGCTACATCAGTT |
58.31 |
22 |
279 |
534 |
812 |
|
|
