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Simple sequence repeat (SSR)
>UN33790
GTAAAGTTTCTATTTTTGGAGATTTTGTAGTTGTCTGGAATGCTTTTCCCACTACTTGGAATTGGTGGCTTATGCAGAAAAAGGACGAAGCTTA
TTTCAAGACCCTGTTACAGGCACTTGAGACTACTCCAGGATTGTATTTTTCATATGAGACTGATCTTACTGTCAAGTAAGTTTCGCTATCTGAT
TATATCGTAGTTAAACAGTGTCATTCTCTAAATGTGTGTGTGACCCTTTGACTATGAAGTTCCACATATTTAAGAATATTATGTTTAATCCAAT
GTTGCAGCTTGCAAAGAAGGTGCAAGCTAGCTGTTGGTTGGACGAGTAAGCCCATGTGGAAGCAGGTTGGTTATTCATCTCATCCTTGTGCAAC
TTTTGTTTTTTCTATTACTATTTTTTTGTCTGATTTTAGTTGGTAGGCTGAAGGTTAACTTGCGTGTCAGGCTGACCCTCGATATGTTTGGAAC
TGGCATCTTTTGGAGGAACTGATTGAATGCAAAGTAAGTTGTCTCTTTCTAAGTTTGATTTTTCTCATTCCATGTCAAACTTCACAGATCTAAT
CTTCTCTTGGTGTTGTAGCTGGATGGTTTTATTACCCCTCTGCTTCAAGGAAATATCCTTTATTTATCTTCTGATTCGCTTCTTCTTCTTCGAC
TGTCTTTATATATATATATGCAATGTTGTCTCTTTCAACGTGTTTGTTTAAAAATTAACCAACGGTTAAGCTACCAAGTTGCTGAGCTACAGCT
GAAGAATTCTCCTTCCGTGATATCTTTAATTTCCAGGCGCTGTACACGTCGTCTAGGTGTGTTTTAGTGCTGTTGGAAAATTCAGTTAAATGCC
TGTTTGATACTCATGTTGGAATTGCCATTCCAGGTACACGTATGTGGAGAAGAGGAGCCAATCTTGAGGGAGACACTGCTAATTTTGTGGAATC
TGAACAAATAATGGAGATTAATGGTTTCAAGTTCTCTTTACTGCAGGTATTGCTCTTCTTTTTCTCAGTTTAAAGGTTTCCTTTTATTTCTTGT
GGATTATAACCGTCTTGCTTTCACTTGCTAGGTTCGAGGTTCAATTCCACTTCTTTGGGAGCAAATCGTTGATTTGAGCTATAAACCACAGCTT
AAGATAAATAAGAATGAAGACACGGTAGTTTATTATGACCATGTTACATATTTTACATTCACTGTCCAGCCCCTCAACCTTGATTAGTTATTTT
TCTGCCTCCAGCCGAAG |
Primers for UN33790 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TACCCCTCTGCTTCAAGGAA |
59.807 |
20 |
CAGCGCCTGGAAATTAAAGA |
60.335 |
20 |
198 |
597 |
794 |
| 2 |
TTGGTGTTGTAGCTGGATGG |
59.566 |
20 |
CAGCGCCTGGAAATTAAAGA |
60.335 |
20 |
224 |
571 |
794 |
| 3 |
TACCCCTCTGCTTCAAGGAA |
59.807 |
20 |
ACAGCGCCTGGAAATTAAAG |
59.361 |
20 |
199 |
597 |
795 |
|
|
