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Simple sequence repeat (SSR)
>UN34704
GGCGACAATATTTCAAACGTTCTTTTTAAAGACAATATTTCAAATGTTCGCGCTTAATTCATAAATAGCCTTGGGGAAATTTGAAAGAGGACCA
TATGGATGATGCATATCACAAAGTCAAAACCGACTTATATTCTTGATCCGATTAAATTAAGCGACACTATCTTTCTTGAAGTTTTTTAATCATC
TACGGAATATATCTCTTTCAAAAATTTTACCAGAAAAAATATATATATATTTCAAAAACGATTAAACGAACATCAACATCACAAAATCAAATTT
GACTTATACTGTATCTTGATACGATTTAATTATGCGATACTATTTGCTTGAAGTTTTCTCATCTTCTGTGGAGTATAACTCCTTCTAAACGAAC
AACAACATCACAACTCACAAATTCAAATCTGAACTTATGTAATATGAGTTGCAAAAAAAAACTTATGCAATATGAAACATATACTGTATCTCGT
ATTATTAAGCGAGAAAACATATTTGAATATTAAAAAAACTTTTACTTTTGTAAAAATAGCATTTAATGCATAAATTCAGCCAATAATAAATAGG
TATGAATTATTTGATTGGTCACACAACGTGTAATAAATGTAAAAGGTGCTTTGAATTATGAAAACATCTTACATTGTGAAACAAACATTTTTTG
CTAAAACTACTTACATATAAAAACAGAGGGAGTATCTAGTAGTTACCTATAAAACTTAGTATAAAACTAGATATTGAATTTAAAGGGTGTTAAA
TTAGGTTAACTTTATGAACCTCCAAATTTGACCACAATCTTTTGTATGTTTATGATCAAGTGGTACATATAAACACAACACGAATTGTATGCGA
GAAAAACACGTTTTTGTTGTTTGTCATGAACATATAGACACACACACACACACGAAAACAAACAGGAGCATGTAAAACAAGGTTTACCTCC |
Primers for UN34704 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TAGCCTTGGGGAAATTTGAA |
59.52 |
20 |
TTTTGTGATGTTGATGTTCGTTT |
59.415 |
23 |
209 |
66 |
274 |
| 2 |
TGGGGAAATTTGAAAGAGGA |
59.476 |
20 |
TTTTGTGATGTTGATGTTCGTTT |
59.415 |
23 |
203 |
72 |
274 |
| 3 |
TAGCCTTGGGGAAATTTGAA |
59.52 |
20 |
TGATTTTGTGATGTTGATGTTCG |
60.777 |
23 |
212 |
66 |
277 |
|
|
