 |
Simple sequence repeat (SSR)
>UN38823
GAGAGTTTTAAGCGTACTGAGCAAGATGGGCTCGAGTCCAAACGTGATTTCTTACACCGCTCTCATGGAGTCTTACGGAAGAGGAGGCAAATGC
AACAACGCTGAAGCCATATTCAGGAGGATGCAGTCCTCAGGACCAGAGCCATCTGCTGTGACTTATCAGATCATACTCAAGACTTTCGTAGAAG
GGAACAAGTTTAAGGAAGCCGAAGAGGTTTTCGAGACTCTTTTAGATGAGAAGAGATCGCCGTTGAAGCCTGATCAGAAGATGTATCACATGAT
GATATATATGTACAAGAAGGCTGGAAACTATGAGAAGGCTAGAAAAGTATTTGCTCGATGGCTGAGAAAGGAGTTCCACAGTCTACTGTCACTT
ACAATAGCCTTATGTCCTTTGAAACTAACTATAAAGAAGTTTCTAAGATCTATGACCAGATGCAAAGATCTGGTATTCAACCTGATGTTGTAAG
TTATGCTTTGCTTATCAAAGCATATGGAAGAGCGAGAAGAGAGGAGGAAGCTCTATCTGTGTTTGAAGAGATGCTTGATGCTGGTGTAAGGCCG
ACGCATAAAGCTTATAACATTTTGCTTGATGCATTTGCTATTTCTGGAATGGTGGAGCAAGCAAAGACCGTGTTTAAAAGCATGAGACGAGACA
GATTTTATCCGGATCTGTGCTCTTACACAACAATGCTATCAGCGTATGTCAATGCTTCAGACATGGAGGGTGCCGAGAAATTCTTCAAGAGGAT
AAAAGTAGATGGTTTTGAACCGAATGTAGTAACCTATGGGACGATGATAAAAGGTTATGCGAAAGCAAACGATCTTGATAAGGTTATGGAGGTA
TACGAGAAAATGAGGTTAAGTGGCATCAAAGCGAATCAAACCATCTTGACAACTATCATGGATGCGTCTGGGAGGTGTAAGGATTTCGGGAGCG
CTCTTAGTTGGTACAAGGAGATGGAGAGCTGTGGAGTGCCACCTGATCAGAAAGCTAATAATGTGCTCTTGTCATTGGCTTCGACTCAAGATGA
GCTGGAGGAAGCTAAGGAAGTTACTGGTCTCGTAGATGAGAAGACAGCGAGCCTTGCTGGAGTCTATCGAACTGATGATGATGATGATGAAGAC
AATTATATCACTAGTAGTGATGAGGATGAGGATGAGGATGAAGATGAGGATGACAATGAAGAAGAAGATGATGATGTTGATGGTGCAAAAGAAA
CTGTGTTGTGTGATAACGAACAAGAAGAGTCTTTGGCTTATGTTGGCTCACAGACGGAAGAACTTGTTGGGTTATGAAAACTACTACTATATGT
GTTGTAATCATCGAATGCTAAAAGAAAGATTTTGCAGAAGAGGACTTGGTAGGTTGTGTCCATTATTTGTGTCTGTAGTTTACAAGATGAAATA
TGTTACTCATTTGTAAGAAACATCTTTTGATTCTC |
Primers for UN38823 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CAAGATGAGCTGGAGGAAGC |
60.096 |
20 |
CTGTGAGCCAACATAAGCCA |
59.864 |
20 |
249 |
1027 |
1275 |
| 2 |
GGCTTCGACTCAAGATGAGC |
60.104 |
20 |
CTGTGAGCCAACATAAGCCA |
59.864 |
20 |
259 |
1017 |
1275 |
| 3 |
CAAGATGAGCTGGAGGAAGC |
60.096 |
20 |
TGTGAGCCAACATAAGCCAA |
60.257 |
20 |
248 |
1027 |
1274 |
|
|
