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Simple sequence repeat (SSR)
>UN39332
GGGAAAACATAAAACATAAAGCTTCTATCTTGTTTTCCTTTTACCACATATTCTCAAATAATTTCAGTTTACCACATTTATTTTCCAAATTCAC
ATTTCTTGCTTCTCACTTTCTTAAATGGCATCTTCTTCTTCTTCTAATAATATTGAAGACATGATGGATGAACAATTCGACCAATTTTTCGATG
AAAAATTTGATCAACTTTTCGATCAACAATTCGAAAATCTTTTTAATCGTCATGGTGATCATCAAAAAGCTGATTTGGTTGAAAATATATGGCA
AAAGTTTAATACAAATCAAGATTACAACTAATCTGTTTTTTCTCGCTTATGCATTTCTTTCATGTTTATTTAAAATTTCTAATTATAAATTTGT
ATTTCTATTTTTCTATGTTTTTATGTAATATTTGTCTAAATGTTATAAAATCCAATAATTGATAAGTTTTGTAATATTTAAATTTAATAATTCA
ATTTAAAAAAGTTTAAGAACCTCATAGGGGTTGTGAACTTCATTAAGTACACAATTTAATATTAATATTTATATCTGAATTGTGAAATATTGTT
CTTTATAAAAAGTAAAAAATATTTAATCCCAACTTTTTTTTAAAAAAAAACACAAATTTATCTTTTTAATTATGAACATACTTTTTTATATCAT
TAAATAAAAATAAATTAATTATATAGGAGAGTAGGTAAGCGGCACCAAAACTGTTAAAACTGGATTTTTAATTGGGCCAAAATATCTTTGAGCA
CATTCATGGGTTGCGTTGTTACTACGAACTCAATATAATAAACGAGCAGCTAGAGATTCTATCGCATACTCACAGCAGGTCCATCGTCTGAAAC
TTAAATTTTCCCCAATTCTCAGATCAGCATCAAACCCTAGGGCTCGAGGAACCAGCCATGTCGTCCAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAACCTTTGA
AGCAGCCAAAAGCTGATAAGAAGGAATACGATGAGCACGATATGGCCAACCTTCAGAAGAAGAAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACTAAG
AGCCAAGGCATCGCAGAAGGGATCTTTTGGAGGATCTGGTCTTAAGAAGAGTGGCAAGAAATAATCCCGTTTTGTATCCATGAAGCCTGTCTTT
GACAGAGTGCTTATTTATCAACTTATAATGTTGTGTAACTTCCTATCATATCTGTAGGGGAGTGACTTTTCCTTATCCCATAACATAACATATG
TTTTGCTTTCGCCACTTTTTCATTTCAAAAGATTGTTTCTATCTAAAAGCCAAGTGATGCCGTAGTTCTCCATCTCCTGGTTCAAGATTCAGTT
TGGTCCAATCTTAGATACTGTTGTTTGTCACAATTTGAAGACAAGAACATATGTTGCATTGAT |
Primers for UN39332 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TTTCCAAATTCACATTTCTTGC |
59.101 |
22 |
TTTTTGATGATCACCATGACG |
59.385 |
21 |
175 |
82 |
256 |
| 2 |
TTCCAAATTCACATTTCTTGCTT |
59.997 |
23 |
TTTTTGATGATCACCATGACG |
59.385 |
21 |
174 |
83 |
256 |
| 3 |
TTTCCAAATTCACATTTCTTGCT |
59.997 |
23 |
TTTTTGATGATCACCATGACG |
59.385 |
21 |
175 |
82 |
256 |
|
|
