 |
Simple sequence repeat (SSR)
>UN39594
TTTACTTTTCTAGCTCGCTCTTTGAAAATTCTCACATCTCTCTCTCTCTATATATCACTTTACATAAACCACTATCCAACACACACCCCTTTTC
TCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTTCTTCACAAGATCTCCTTTTGCTCACACTGTCTATGGTGTTAATCCCCTTCTCTTTAGCTCAATCTC
CCATGATGGCCCCTTCCGGCTCAATGTCCATGCCACCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAGTGATGACTCCACCACCTATGCCTATGAT
GACTCCACCACCTATGCCTATGGCGCCACCACCTATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCGCCACCACCTATGCCCATGACTCCACCACCT
ATGCCTATGGCTCCACCACCAATGTCCATGGCTACACCACCAATGATGCCAATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTACTCCTA
TGAGCCCAGGCCCTAGCCCAACAACTGTCCCCGATATGACTTCGCCACCGATGCCAGCAATGGAATCTTCTCCTTCTCCGGGACCAGGACCCAT
GCCACCGGCTACGGCCTCGCCGGGGGATTCCGGAGCTTTCAATGTAAGAATCGACGTCATGGCACTTTCTTTCCTCTTTGCAGCCCATTTGCTC
CTCGTTTGAGATTATTACTGAGCGTCGTTTTCGTGTAATTTACTTTAATTATTCTTCGAGCCATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGA
TTCAGACATTTGTTTGCTTTATCAATCTATCGTTGACTCTAGTTGGTGTATGTGATGTAAACTTATATTGTCTATCC |
Primers for UN39594 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TTTTCTAGCTCGCTCTTTGAA |
57.241 |
21 |
AGCCATCATGGGAGATTGAG |
60.034 |
20 |
116 |
6 |
121 |
| 2 |
CTTTTCTAGCTCGCTCTTTGAA |
58.237 |
22 |
AGCCATCATGGGAGATTGAG |
60.034 |
20 |
117 |
5 |
121 |
| 3 |
TTTTCTAGCTCGCTCTTTGAA |
57.241 |
21 |
GAAGAAGCCATCATGGGAGA |
60.158 |
20 |
121 |
6 |
126 |
|
|
