|
Simple sequence repeat (SSR)
>UN40534
GAACAGGGGAAAGTCACTGTCACAGGAAATGGTCACACAATGCAATTGACTCCTCAGCAGATTCAACAATTGATGATGATGAAGGCTGCTCACG
GTGGTGGAGGTGGCGGGAAGGATATGAAGATGATGATGCCTCCTGTGGCATCTAAGGATCAGAAGAAGTCTGTTAAGTTTGAGGAAGAGGAGGA
TGACGATGAGTTTAGTGATGATGATGATTATGATGATGATGATGATGAGTTCAGTGGAGATGATTATGATGATGATGAGTTCGACGAGGATGAT
GAAGATGATGGTGATGATGATGATGAATTGGGAGGACATGGTCATGGAGGTGGAGGAGGAGGTAATCATCACATCCCTCCTAACAAGATGCCTC
AAATGGGTGGTGGAGCTAAGGGACCTAATGAGATTATGACGATGATGAATGGTCTCAAAGCCGGTGGTGGTTGCGGTGGCGGAGGAGGTGGGTT
TGAGATTCCGGTGAAAATGAAGGGAATGGATGAGGGTAAAATGGGAAAAGAGGGCAAGAAAGAAGGGAAAGAGAGTGAAGGAGGTGAGGGTAAA
AAGGGAAAAGCAGATGCCAAAAGTGGTGGTGGCCTTCTAGGATTTTTCAAAAAGGGTAAAAGTGAAAAGGGAGGTGAGAAGAAGGGAGGTGGTA
AGAAAGAAGACGGTGGAGGTGATAAGGTGAAGGCCTCCGGTGGTGGGGAAGGAGATAATGGGCCTAAAAAGGGAGGAGGTAAGTCGAAAGGAGG
AGCCCATGGGGCCCATGATATCGATGAGATCATGAAACATGTCAAAGCAGGTGGAGGAGGTAACAAGGTGAAGGGGATGGGTGGCCCAATTGGT
CAAGGAGGTCCTATGGGTATGATGGCTCCAATGGGACACCAAGGCGGTGGGGCATTCCCGGCGGTTCAAGGCTTACCGATGAGTGGAGGCGGAG
GATATTATCCACCGCCGTCTCAGGCAATGAACCAACAACAGTATATGCAAATGATGATGCAACAACAACATCAACAACAACAGGCTGCATTTCA
TGGGGGATATGGTGGTGGTGGTCATGGTGGAGACATGTACCATCCAATGATGTATGCTCGACCTTATCCGGCAGTGAATTATGCTCATCCACCT
CCAATGCCGCCTCCACACTCAGGTCGTTATACTGATGTGTTCAGCGATGAGAATCCAGCTGGTTGTAGTATCATGTGATCTTTTGATAATGGTA
ATTATAAAACGAATATGAATATGTTTGTCTAAGAAGTCTTATGTTTTTTTCTGGGGCTGTCTTTTTCTTTTGTGAACTCAATCGAGGAATGGCA
ACAATATGTGCTTTAATTTGGTTAGTGGGAATGATGTTTATAATATCTCTATTTCTGAAAAGATATGGTTACAAAATAAGATATTCGTTCAGTT
AC |
Primers for UN40534 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
1 |
TGATGATGAAGGCTGCTCAC |
59.95 |
20 |
ACCTCCATGACCATGTCCTC |
59.774 |
20 |
260 |
74 |
333 |
2 |
TGAGGAAGAGGAGGATGACG |
60.34 |
20 |
CCCATTTGAGGCATCTTGTT |
59.933 |
20 |
210 |
174 |
383 |
3 |
GGAAGAGGAGGATGACGATG |
59.612 |
20 |
CCCATTTGAGGCATCTTGTT |
59.933 |
20 |
207 |
177 |
383 |
|
|