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Simple sequence repeat (SSR)
>UN42356
GGGGTTCGTGAAGGGAACAGTCCCATTGGTCCCACTCCGCATACCTTGCAGGAGCTTCAGGACACGACTCTGGGTTCACTTCTGTCGGCGTTGA
TGCAGCACTGTGACCCTCCTCAGAGACGGTTTCCTTTGGAGAAAGGCGTGCCGCCTCCGTGGTGGCCTAACGGGAAGGAGGACTGGTGGCCTCA
GCTTGGTTTGCCTAAGGATCAAGGCCCTGCTCCTTACAAGAAGCCTCATGATCTGAAGAAGGCGTGGAAGGTCGGCGTGTTGACGGTGGTTATC
AAGCATATGTTTCCTGATATTGCTAAGATCAGGAAGCTTGTGAGGCAGTCTAAGTGTTTGCAGGATAAGATGACTGCTAAAGAGAGTGCTACTT
GGCTTGCGATTATTAACCAGGAGGAGTCCTTGGCTCGGGAGCTTTATCCTGAGTCTTGCCCTCCTGTTTCTTTGTCCGGTGGGGGAAGCTGCTC
GCTTCTGATGAATGATTGTAGTCAGTACGATGTTGAGGGTTTGGAGAAGGAGACTACTCACTATGAAGTGGAGGAGCTCAAGCCGGAGAAAGGG
ATGAATCCTTCCAACTTTGGGATGGCTGCTGCTAACTTCCCTGTGAAGGAAGAAGTTCCATCAGGGAACTTGGAGTTCATGAGGAAGAGGAAGC
CAAACAGAGATCTCAACACTCTAATGGACAGAACGATCTTCACCTGCGAGAACACTGGGTGTGCGCATGGCGATGTCAGCCGTGGTTTTCTGGA
TAGGAACTCGAGAGACAACCATCAGTTTGTTTGTCCACATCGAGACACCTGCTTACCCTATGGAGCAGCAGTAGCGGCAGCACCGTCCAGGTTC
CATGTTAACGAAGTTAAACCTGTCGTTGGCTTCTCTCAGCCAAGGCCAGTGAACTCGGTTTCCCAGCCAATTGACTTAACCGGTATTGGAGTTC
CTGAAGATGGACAGAAGATGATCTCAGAGCTCATGTCCATGTACGACAGAAACGTCCAGAGCAACCAAAACCAAACTGTCATGGAGAATCATGG
CGTGTCGCTGCTTCAACCAACGGTTCAGAATCATCAAGAACATCTTCAGTTCCAAGGAAACATGGTGGAAGGAAGCTTCTTTGAAGACTTGAAC
ATACCAAACAGAGTCAACAACAACAACAACGGTAGCAACCAAGCGTTCTTCCAAGGGAACAACAACACTAGCAACCACCAAACGTTTTTCCAAG
GGAACAACAACAATGGGTTCAAGTACGACACTGCACACACCAACAACAGCTTCGAAGCTGCGCATAACAACAGTAGCAGCAACAGGTTTCAGCT
TGTGTTTGATTCTCCACCGTTTGATATGGCCTCATTCGATTACAGAGATGATATGTCAATGCCGGGAACGATGGATGCTATGCAGCAGCAGAAG
CAGCAAGATGTATCCATATGGTTTTAAGTCTTGGGGGAATAGATTTCAACTCCTCTTTATTTTTATCTCTTGTGTTCTTCTTACATTCACTCTC
TACAATGTAATATTTTTCTGGGTCTGTCTCTCTGTCTCCTCGCTTGTAATGTGTTTGTAAGAGTCTCTGAAACTCTGTTACTGTGTGTGTCTTG
TTCTCGCCCTGGCGAAACTCTCTTGTCGTCGGCTTCTTTTAGTTTATACACCCCATACTCGGGGGACGAACATAATGTAAGTTTTCATATTTTA
TAAATATAATTTGGAGTTTCTCTTAATTATATTTTGTTGTGTTTTTATTTGTATTTTTTGATGTGGCTGGGAACATTGTTTATTGCAAGATGGT
AGTTTGAATTTACTTGAAAATAACCGTGTGTGTTGAAGTGGCTCGTTGGTGATAGAGCATGGGTCAGTGCTCCTATTAACCAGCGATCGAAGCA
CAAACACATCATGTTAGACAAAGCCAACGGGAAAAAAATTTATTTCCAGATAAAAGGTATTCTCAAAATACCTTCTTTTTCATTTACTTAATAA
CTGAAAAAAAACCCGAGTAACATAACATTGAACAAACCTAAAAAAAAAAAAAAACATTGAACAAACCTTTGTTAATCACTTAAACCACATTGAT
ATTTGAGCATGCGTCAGTACTCCCACCGACTACGGAACACGAGCAAACACACAAACTTCTAAAAGAAGAGAAAAAAAGTTACTCCAGGTATAAG
ATTGGATTAATTGTTATTACAAGAAGGTTATTGTAACGTTGTACTTGAAAGCAAACGTGTTTATTGCAAGTGGCTCGTTCGGTAATGGAGCATG
GGTCAGTGTTCCCATTGACAAGCGATCGAACACACAAACACACC |
Primers for UN42356 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
ACGTCCAGAGCAACCAAAAC |
60.156 |
20 |
TTGGTGTGTGCAGTGTCGTA |
59.778 |
20 |
274 |
992 |
1265 |
| 2 |
GTTCCAAGGAAACATGGTGG |
60.21 |
20 |
AAGCTGTTGTTGGTGTGTGC |
59.801 |
20 |
192 |
1083 |
1274 |
| 3 |
GTTCCAAGGAAACATGGTGG |
60.21 |
20 |
CGAAGCTGTTGTTGGTGTGT |
59.794 |
20 |
194 |
1083 |
1276 |
|
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