Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN42510
GGGAAAACAGATAAACAGTGAGGGAGAAAGAAGGATGCAGAATCAGAGGCTGAAACAACAACAAGCAATGATGCAGCAAGCAATGATGCAGCAA
CAACGTCACTCTCTCTATCATCCTAGCCTCATGGCTCCTCCTCCTCCTCAGATGGAGCCTCTGCCAAGTGGAAACCTTCCTCCTGGTTTTGATC
CCAGCACTTGCCGTAGTGTGTATGCTGGAAACATCCGTACGCAGGTCACTGAGGTTCTTCTTCAAGAGATTTTTGCTAGCACCGGCCCTGTTGA
AAGCTGTAAACTCATCCGAAAGGATAAGTCATCATATGGATTTGTCCACTACTTTGATCAGAGATCTGCTGGTTTGGCTATCATGTCTCTTAAC
GGAAGGCATCTATTTGGACAGCCTCAAACCCACTTCCACCACCAGCGCCGGTTCCAGTCCCTGGTTTGTCCCCAATGGACCTCTTAGCGTATGA
GAGGCAACTGGCTCTAGCCAAGATGCATCCTCAGGCTCAACATTTTTTGAGGCATGTAAATGCAGCTGGAGCAAGTGCAGCTATGTACGATGGT
GGGTTTCAGAATGTAGCTGCGGCGCATCAGCAGCTCATGTACTACCAGTAATATACTCTGGTCTCTTGGATCCGATGAGATGCTTTTTTCTATC
TATTTTTCTTCTTTTTTCTCTTCCTACTTAATTTTATCACTTTCTTACTTTTTTTTCTAGACCTTGTTCAGAGTCTTATGTATGTGTGTCTGTC
ATTTGAAGTCGTTGATTCTATATATGCCTAGAATGACATGAAATAAAAGGGAT

Primers for UN42510 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 ACAAGCAATGATGCAGCAAG 60.019 20 AGAACCTCAGTGACCTGCGT 59.907 20 186 61 246
2 ACAAGCAATGATGCAGCAAG 60.019 20 CCGGTGCTAGCAAAAATCTC 59.845 20 213 61 273
3 GGCTGAAACAACAACAAGCA 59.888 20 AGAACCTCAGTGACCTGCGT 59.907 20 199 48 246