Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN42708
CACCATGGTCGGAATTCTCCTGGGTTTGCCTGGACAGTGGGCAGAAGATGAGCTCGAGTCTTCTGATCACTACACAACTAAAATCGGAGGTCTT
CCGGATTGGCCGCCAGTACCAGATGATGTAATGAGAGCAGAGCTACTCAATTGTACTTCATGTGGAAGTAAACTCTCTCTCGTAGCTCAGGTTT
ATGCCCCAATCTCAGCTGAAAACTCGGAACGTACTCTCTATATATTCGGTTGCTTGATGATGCCTAAATGTGGAGCTTCTGAACAAAGCTGGAG
AGCTTTAAGCGTTCAGAAAGCTGTAAAGGAGAAAGAATCTATTGAAACAGAGGATCTTCCTGTTGCTTCACCTAAGGATACACCTTCTAAACCT
CATTGGCTAGACGATGGTGATGGTGATGATGATGATGATGAAGATTTTGATTTTGAGAGTTTAGCTAAAGCCATTGCTGAAGCTGCTACTACCG
TTGCATCCAACTCTAAGAAACCAAAGAGCAAACCAAGTGGTAATACTAGCTCATGGACTAAAGCAAAGCCTTCGCCTTTGAAATCCGAAACAAG
AGATTTGGATCAGGTTAAAGCTGAGACTGGCGCGGTTCTTCCCTGTTTCTACATCTATACAAAGGAGGAGAAAGTCTCAATAAAAGAAGATGTG
GATCGTGTCTCCGTGAGTTATTCGTCTATGTCGGTTAAGGATAAAGAAACCAGCGAGAAGAGCGACGAGAGTGAAGCTGAAGAAGCTTGGGAGG
ATGAGAAGTATGAATATGACAAAGCTTTGAATGCAGATAGGACTTACCTTAAGTTCCAAAAACGATTAGATGCTAACTCTGAGCAATGTT

Primers for UN42708 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 CATTGGCTAGACGATGGTGA 59.673 20 CGCCAGTCTCAGCTTTAACC 60.015 20 220 377 596
2 TCATTGGCTAGACGATGGTG 59.673 20 CGCCAGTCTCAGCTTTAACC 60.015 20 221 376 596
3 CATTGGCTAGACGATGGTGA 59.673 20 TTGTTTCGGATTTCAAAGGC 60.053 20 187 377 563