|
Simple sequence repeat (SSR)
>UN43069
GGATAGCAAAACAAGATTTAGAAGTAAAAGAACATATATAAAAAACGTACCAACAAAATTAGAAAATGATCAAAGGGCTCTTGTTGATTTTGTT
CTTTTTAATTACTGTCAAGACTTCCGTTTCTCGTCCATTAGCATGGTCAAAAGGTAACATGTCACTAGGCCAAAACACCCAAGGGGAAAGTGGG
TCGGGTCGTGGGCCTAACTGGGAGTACAACTGGGGGTTGGGGAAGAGGATCCGGATATGGGTATGGGTATGGGTATGGTTATGGAAGCGGAAAT
GGTCGGTCTGGAGGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTGATAATGGTGAAGTTGCCGCTTTGGGCCACGGTGGTAAGTCTCATCCGTGATGATAAG
CCTGTAATTCTCCCAACTTAAAAGGTTTTGGGAGTAGTTTAAGTGTTTGAAATATCAAGGTTATTAGGCTTGGTACCCCTTTTACATGTAACTT
CCTTTGTCTTGTATGCTTAAAATATGGTATGGATTATGTGGTCGACATATCTTATGAATGTCTTTGCATGTGTGATATCCTTTAGTGTATTTGT
ATGTATCCAGACGGTTGTTTAGATAATCAAAAGAAAACAAATTCTAGGTTAG |
Primers for UN43069 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
1 |
TTATGGAAGCGGAAATGGTC |
59.901 |
20 |
ACGGATGAGACTTACCACCG |
59.989 |
20 |
101 |
267 |
367 |
2 |
TTATGGAAGCGGAAATGGTC |
59.901 |
20 |
CGGATGAGACTTACCACCGT |
59.989 |
20 |
100 |
267 |
366 |
3 |
ATCCGGATATGGGTATGGGT |
60.117 |
20 |
CGGATGAGACTTACCACCGT |
59.989 |
20 |
130 |
237 |
366 |
|
|