|
Simple sequence repeat (SSR)
>UN44440
GGATGGTGTCTAGGCCTGCGGATTCGGGTTTGTCTCATGAGAAGGCTTTGGAGCGTTGCGTGGAGCATGCTAAGCTCTGGTTGGCTAACTCTGA
TCAGAAGATTGCGTCTAACTGTGACGTTTCGTATGCTGCGTTGAGAGAGAAAGTGAAGAAGATTATGGGGTCTAATTACTTCACTATTACACCG
GAGATGGTTGTGGCACCGGTTGAAGCAGCGGCGGAAGCTGGTCACTTCGGTGGTTCGTTCCAAGTTGCTGGTGACAGTGAGCAAAAGGAAGGAG
ACGCATCAAACTTCAAAGAACAAGAATCTGTTGGTAATGATCAATATGAGCAACCAAAGGATGAGTCAGTAGTGACGGAAGGAGAGGTGGTACA
GGGGCAGCAGGAACAAGGCTATACTCAGGTGGAAGGAGGGAGGTCAAAGAGAGATTATCAACAACAACAACAGTATGTGCCTCGTGGAACACAC
CAGAACCAGAGAGGTCATAGAGGTGCTAGAATAGGCCATTCCAATGCCCCCCGGGGAGGTCGAGGTGGTGGTGGTGGATACTCGAATGGGAGGT
TTGAATCTTATGATAATGCCGGTGGAAACGGTTACCAAAGGAGTTACTACAACAACAGAGGAAGAGGACGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGAGGGA
ATGGCCATTCATACAACAACAACAACCACCAAGACTCTAATGTTAGTGCTGCGTCTTAGCTTTTGCTGCCTCTTTATGGCTTTTGAGTGCGTGC
GGTCTCTCCTTGTTTTCCGCTATAACTCAGCCTTATCTCGGAGTTTGGAACTTTTGTGAATTGCTCTTTTGCTATGTATGAACTTTTGCGGCCA
TCAGT |
Primers for UN44440 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
1 |
GGTGGTGGTGGTGGATACTC |
60.096 |
20 |
AGCCATAAAGAGGCAGCAAA |
59.982 |
20 |
206 |
534 |
739 |
2 |
GAGGTGGTGGTGGTGGATAC |
60.096 |
20 |
AGCCATAAAGAGGCAGCAAA |
59.982 |
20 |
208 |
532 |
739 |
3 |
GGTGGTGGTGGTGGATACTC |
60.096 |
20 |
AAGCCATAAAGAGGCAGCAA |
59.982 |
20 |
207 |
534 |
740 |
|
|