Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN44701
AATCGGAATTTTTTCACTAATTAAGTAATAATATTTGACGTTACACATACTACGAGTCTGACCATAACCGCTAGAAGTAGTAGCTATTAGCTAA
GGCCTTTCTCGATTAAAACATTGAAGTTGAAATAAAAGATGTAAATGTGATTAAATCACTCTAAATTTATTATGACAATGGAAATGACTTGAGT
AGCATAATAAGCTGTGAATGAGCTCACACACACACAAACACTTGACTATACGTTCAAGGAAAGCCACCACCACCAAGTCCACCGGCACCTCCGC
CTAAACCACCTCCGCCTAAACCACCTCCACCTAAACCACCTCCGCCTAAACCATCTCCGCCTAAATCACCTCCACCGAGGAGTCCACCACCACC
GCCAAGTCCACCACCTAGTCCTAATCCAGCTCCAACATTGATATTAGCTCCAATCCCTAGCCCACCAAGGCCACCACCGGCTCCACCGCCGCCA
AGGAATTTTTCATCTTTGAATTGGGTATCTCCGGAAATAAGTTTCCTAGCACCGACATTTACACAAACAAGTGCAATGAAGAGAAGCACAAGCA
AGTTAGTGAAAGTGGCTCTCATGTTTTGCTTTGATGGTAGAGATTATTTTGTTGTCTATGATGGAGGTGTGTCC

Primers for UN44701 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 ACGAGTCTGACCATAACCGC 60.142 20 GGTGGCTTTCCTTGAACGTA 60.11 20 205 52 256
2 CGAGTCTGACCATAACCGCT 60.277 20 GGTGGCTTTCCTTGAACGTA 60.11 20 204 53 256
3 ACGAGTCTGACCATAACCGC 60.142 20 GGAGGTGGTTTAGGTGGAGG 60.736 20 274 52 325