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Simple sequence repeat (SSR)
>UN44861
ATAGTAATAGAATCAGCAGGAAATAACAGTAGAGTTTAATTTAATGGTTTCTGGAAATATTCATGTTTTCCAATTTCCACAGTTGATGGATCTT
TTGCTTAAATGTTTATGTGACCTTATATTGAGCTGATGGGTTTATCTTTCTTGTGTTTAGAGCTGGCCAGAGATGCATTGCACTCAGAGGGATT
TCATGTTCTTGGAGGCTATATGTCCCCTGTTAACGATGCTTACAAGAAGAAGGTAATAATACTCTTCCAGTAATGACTCTAATTTGATTGCTAA
TTTCCCTTTGTAAATTCTGTTTACTATTTAGGTCTCCTTTAGAAAAAATAAATAAATAAATAGTCATCAGTTTCTCTTCTAGGGACTTTTATCT
GCAGAGCATCGTTTAGAGATGTGTAATCTAGCCTGCAGAACCTCCGACTTTATTATGGTTGATCCTTGGGAGGTACTCTCTCTCTCTCTCCCCC
TCAAAATGCTTTCTATAAGTTTTGTGTCCTTAAAAAACTGTGTGAAAGCTGTTTCTTTAGGCATCCCAAGACAGCTACCAACGAAGTTTGATGG
TTTTATCAAGGGTCAAGACTTTTCTTACAACAAATAGACTTGTACCCGAGGGTAAGATAACTGCAATCTTTTTTTATCATTTTTCCATTTTTCT
GGATCGTCTCACGCCATGTATCACATCATACGTGTTAGTTATTCACGCAACTGGCAAACTCAAATTTATAATGTATGTGTTTCTAATGCTAGAA
TCTCTCAAAGCCATGCTACTGTC |
Primers for UN44861 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TATGGTTGATCCTTGGGAGG |
59.744 |
20 |
GTGATACATGGCGTGAGACG |
60.144 |
20 |
253 |
430 |
682 |
| 2 |
TATGGTTGATCCTTGGGAGG |
59.744 |
20 |
TGATGTGATACATGGCGTGA |
59.495 |
20 |
257 |
430 |
686 |
| 3 |
TATGGTTGATCCTTGGGAGG |
59.744 |
20 |
GTAGCTGTCTTGGGATGCCT |
59.313 |
20 |
119 |
430 |
548 |
|
|
