 |
Simple sequence repeat (SSR)
>UN45424
GGAACTCATAATCCTCTTGTTAGCTGCAGACGTAACACATATATCAGCTCCTCCGCTTTGAAATTCTCGACGACTGAGAATCCATCAGAAGGGG
GTTAGTTAATGGAAGGAGAGAATGTGATAGAAGAAGGTGGCTTTTTGGCCGCGCCTCTGAAGAAGGTAATAACTAATAATAATTAACAAAACGT
TTCTGCTGTTTCTCATGAGTAAAAAAAACTTGTGATAATTTTTAAGCAGAAAGGGTCGAATGATAGTAATAATAGCAAGGAAAGCAGAGCTGCG
ATCCGAAATTAAGCAGCTTTTGAGAGAGGCCACTGCGTTGTCTCAGCCAGCCACGTTTGCGTAAGCTGCTAAACTTTGGAGGTCAGCAGCTACT
AAAGAGAAAGAACTTGCACACTGTGAGTATTGCTTTCAGTCTCTATGGTGATCTTGAGGTTTTGATAGTATGATGCAATAGGGTTGTTAGATTT
AGAAATGCATTGCAATCTTTTTGGTCTTGTATTAGGTGTGTGTGTGTGTGTATCTGTTAATAGTCTTTTGTGAAATTCAGATGTGGAGCAGCAT
AACAAAGAACTGTCATACGATCTGTATGGAAACGTTCTGATTGCTTCAAAGGTAATCTTCTAAGTTGTGTGTGTTGAAGCTTTTTTCTTTTCTT
TCAGAAACTACTTATGTGAGAAGATGTTGCTAAGAACTTTGTCTCTAGGTTGTGATGTACTTAATCTTGGTATTTTGGTTCTTGAGGACTCCAA
TTGCCATGATTGCTAAGCAACTTGTTCAACCCTTTGGGAGGTTGTTATCTTGGGGAACAGGAGGTCACTTGACAGGCCATGCGATGGTAGATTC
CTTCTTCTCTTGCTTGCTTCTCAATTCATTTGTTTTGGTATGCTGTTGTGGGAATGAGATTGTTGTTTGGTTGTGTGAAAAATGCAGGTTGGGA
TCATACCGTGGCTGATACTCTCAACCAGAGTGAGCAAATATGTGTGGAAGTTCGTTGAGTTCTAAAAATCACATTCCTCAAGAAAATTAATGTT
TTTTTCAGTCTTGAAGTTGTAGCCCTTTTTAGGAGACACTTGTGCCATAATTGTTCTTTTCCTAATCTAACTTGGCATTTTTGTACATTATATG
GATCCCTGTTTTCCAGTTTATGCTGGATTTTTACCAATAACAATGGCAATGATAGC |
Primers for UN45424 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CACGTTTGCGTAAGCTGCTA |
60.213 |
20 |
GAAGCAATCAGAACGTTTCCA |
60.242 |
21 |
278 |
334 |
611 |
| 2 |
CACGTTTGCGTAAGCTGCTA |
60.213 |
20 |
TGAAGCAATCAGAACGTTTCC |
60.242 |
21 |
279 |
334 |
612 |
| 3 |
CACGTTTGCGTAAGCTGCTA |
60.213 |
20 |
TCTTTGTTATGCTGCTCCACA |
59.478 |
21 |
239 |
334 |
572 |
|
|
