Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN45539
GGATCACACAAATCTCAAAACACTCTTTCACTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCTCTCTTTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAACAAAA
AAGGGACATAACATAATGGAGTGGGAGGAACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTTCGGCTC
TAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTTGAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGA
TGCAGAGGAAGGCAATGGAAACAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGAAGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGGTGATGCAGAAGAA
GTAAAGGAGACCAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGGTGAAGCTGGAGATGATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACG
GTGATGATGATGATGACAATGGGAACAATGATGATGATGAGGAGGAAGTAGAGGAGGATATGGAGGTTCGGGACGATACCATCCTTATGGAAGG
TAGAAAGTTCCATAAAAGCTTTCAATCTTGTTTTACTTGTTTGTTTCTGTCATGTATTGGTTATCAAAGAATGATAGCTAGAGAGTAATACTGT
ATGGTGAGAGAAGAGGCTTATAGGGTTTGATTCCCAGAGATTAGTTTTAATACATTCATAGATAATTGCC

Primers for UN45539 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 TGATGATGAAGGAGGGGAAG 60.003 20 GTCCCGAACCTCCATATCCT 60.154 20 220 325 544
2 AGTGGTCCTGGTGAGAATGG 59.962 20 GTCCCGAACCTCCATATCCT 60.154 20 141 404 544
3 GAGGAAGGCAATGGAAACAA 60.051 20 GTCCCGAACCTCCATATCCT 60.154 20 258 287 544