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Simple sequence repeat (SSR)
>UN45568
GCTCTACTTGTCTAACAATAAGCTCTCAGGTAACCGATATTTTTTAGTTTCCTAATTATAACTTTCGGTTAAAATGTTGGACCTACAAAACGGA
TCGATTAAAGGGATGTAACCACTAAATTATTATTATTATTGAAAATTTAATAAATCATAGTATTCAATAACGTTGCCCTGACAGGAAAAATACC
GGAGTCGTTGTCAAAGAACGACTTTAACGGAGTATTTCTGTCGAAAAACAGATTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTCGGACGGAACAAAACA
ACAATATCAATGGATCTATCGAGGAATTTGTTTGAATTCGATCTCTCCAAGGTTAAGTTCGCTAGGAGCATAGTTGATTTGGATTTGAGCCATA
ACCGAATCTTCGGGAACCTTCCTAGGGAACTGATCGAGCTACGCGATCCCAAGCTTTTCAACGTTAGTTACAATCGTCTCTGCGGAAAAGTCCC
ACGTGGTGGTCTCCTTCAGACCTTCAAATCATATGAGTTCGCTCACAACCGCTGTCTTTGTGGAACTCCTCTCAAGGCTTGTTAAATGGTCTGA
GAACAAATAATTATGTCTTTATCTGTATGATGATGATCAGGTGTTAATTTCAGTCAAATGAATTGTTGC |
Primers for UN45568 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TGGACCTACAAAACGGATCG |
60.883 |
20 |
CCTGTCAGGGCAACGTTATT |
59.993 |
20 |
102 |
78 |
179 |
| 2 |
TGTTGGACCTACAAAACGGA |
59.021 |
20 |
CCTGTCAGGGCAACGTTATT |
59.993 |
20 |
105 |
75 |
179 |
| 3 |
TGGACCTACAAAACGGATCG |
60.883 |
20 |
TGTCAGGGCAACGTTATTGA |
60.111 |
20 |
100 |
78 |
177 |
|
|
