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Simple sequence repeat (SSR)
>UN45827
GGCAATTGGTGGGTGATTGCAAGTTGTGTGGGTATTGAACACACTTGAATGAGATTAGTCTGTGTCGGTGATTAGTTATATAACTAGGGATTAG
ATGGATGATGGTTATGCAACTATTATGATATGCAAACCATTCTTTTTTTTGGCAAAAGAGTTAAGAGAATTACAAGACTATGGATGTTAGCATC
TACTCTACTTGGATTGCATGAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGACTGGCTTATAAAGCTTGACGTAACTGACGTTTTTTTAATGTTTTTTGCAGT
GAGAGAGACATTCCATCACCAAACATGGATCTGCATCGTGTACATTGTGCCCGGAATCTCGAAAAATGTAACATCTGTGGTGATATGGTTCCCA
AAAAACATGTCGACGAACACTTGTTGAACACACATGCTCCGGTACGATGGTTTTTCTATTTATCACCAGTTTTTAAGTTGTATTCTTTGCTTTG
AGGAACCTCTCCTTCGTTAGGCTCTATATGATTATGAACTCGTTTTTGGTGTTGTTTGTTGATTCAAAAGGATCTCCCTAGTTTCATATTGTTG
TGTTGTGGTGTCGGTATTTGCGTTATTGGATATTTTAAAAATCTAATCCACGTATATTTTGTTTTCGTTAATGAATTTTAACCATGAAAAACCA
AATGCCCTGGTTCTTGAATCATTTTCTGATGATCTAAATCCCCTTTTCAAAGGCTTTTAACCCTTTTGGCTAAACTCAGGCCGTGGAATGGATT
CTGAACACAAGAGGAGCAGCACAAGGAGATGGAAATGGGAGGAGGCGGAGAGGTGTGAACGGTATTGCTAACAAAAGGTTTTTCTTCACTGTGG
CAC |
Primers for UN45827 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
AGATGGATGATGGTTATGCAA |
57.9 |
21 |
CCATGTTTGGTGATGGAATG |
59.623 |
20 |
218 |
93 |
310 |
| 2 |
TGATTGCAAGTTGTGTGGGT |
60.008 |
20 |
AAAAACGTCAGTTACGTCAAGC |
58.5 |
22 |
252 |
14 |
265 |
| 3 |
GTGATTGCAAGTTGTGTGGG |
60.008 |
20 |
AAAAACGTCAGTTACGTCAAGC |
58.5 |
22 |
253 |
13 |
265 |
|
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