Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN46801
GGATTCTCGTCTTCCTCTCGCTGCTACCGTCTCTCACGATGCCGAGGTATTACTGTGACCATTGTGACACTTATCTCACCCACGACTCCCCATC
CGTGAGGAAGCAGCACAATTCTGGTTACAAACACAAGGCGAATGTAAGAACATACTATCAGCAATTTGAGGAACAACAAACCCAAAGTCTGATT
GATCAGAGAATTAAAGAGCATCTTGGCCAAACTGCAGCGTACAATCAGGTTGGTGCTGTATTTAATCAGCATATGCTCGCTAGACCTCGCCTTC
CTATGATGCCTATGCCTATGGGGATGCGACCTCCTATTCTGCCTAGACCCATGATGCCTGGTCAAGGTTACATGCCTCCTCCAGGAGTACCACA
GATGATGGCACCACCTGGCGGTCCTCTACCACCACCACCTCCACAAAATGGTATTTTTAGGCCACCAGGATTGGCTCCAATACCAGGTCAAGGT
GGTGCGCCACCTCCCAATTACAGTGGACTTCCTCCTCCTCCTCCTTATCATACAAATCCAGCTGCTGCTCCACCAAGTGTTGGCTTCAACAATC
CGAACCCTGGTGCTGAATCTCCTGAAACCAATTAGTAGAGTTTAGGTTTGATGAGTTATTCTTCTCCTGCCAAAAAAAATTTTGAGGACTCATT
TTTTAACAGAGTTTTTTTTTTTACCTTTTTTAATGTAATCCATGCGAAGAGGTTTAGAAGTATTGTATGTGAATTGCATAATTTATGTACTAGA
TTTTTATTTCCATAGAATGATGAAAGGTCTCTTATAACAAACAGTCAGGTTTAT

Primers for UN46801 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 TCCTCTACCACCACCACCTC 59.962 20 CAGGGTTCGGATTGTTGAAG 60.486 20 176 398 573
2 CTAGACCCATGATGCCTGGT 59.95 20 CAGGGTTCGGATTGTTGAAG 60.486 20 249 325 573
3 TTTTTAGGCCACCAGGATTG 59.931 20 CAGGGTTCGGATTGTTGAAG 60.486 20 144 430 573