Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN47142
GGAACTTCCAAAATCTCCAGTCCCGTCTGCGAGAGCTAGCAGCAGCGATCGAGGATTAAAACAAAAACAAAAAAAAGTTGCTGGAGAGATGGCT
GATCCAAAGAAGGGGCGTGTACAATGGGATGAAGCTAATATAGTGGAAATTGGATCTAACAAACCTGTTAGGCAGAAGATCACTGAACCTAAGA
CTCCCTACCACCCCATGATTCATGATGATGATGATGATGTTGATGTTGGTGATGGTACTTTGTCTCCAAGAGGAGGAAGATCCTTCAACGAATG
CGTTGATGATATGCAACGTGCGGAAGAACTAAAGAACGCTCTGAATGGTGAATCAGCTTCTTCCAGTAGAAATGCTAGCCAGGGCTCTGGTTCT
GGTGGTGGCTGGAGCTCCGCTGAGGATGATGAAGCAGATCCAATGGATCAAGATGGTTTGGAAGGTGAGAAAAATGAGAGGTTCAGTGAACACA
GAAGAGTGCATTACAATGAGTTCCACAAGGTGAAGGAACTTAGGTCCTTGGGGTCCTTCTATGATGATGAAGAAGAGGACGAGGATGATGATGG
CTCCAAAGGAAGTGAAGCTGAGACAACAACCTCACCACACAGTAAAGGCGTTAACAAAGAGGGGAAGTCATCTTCATCCTCCAGTTGATGATAT
GATATGATACCTCTGTTCAATCAAGCGTGTACTCTTGTCCACGTTTTATAGATCTCTCTCTCTCAATCTTTAAACCTTTTTGAAAGGAAGAGGA
ACAAGAAAACAAAAATCAAGATTCTGAAACTAAGTTATGCTGTTACGGCATTTTAATGCAATTGCTTACAATCACTACTCC

Primers for UN47142 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 AAGAAGGGGCGTGTACAATG 59.993 20 ACGCATTCGTTGAAGGATCT 59.7 20 185 101 285
2 AGCAGCGATCGAGGATTAAA 59.945 20 ACGCATTCGTTGAAGGATCT 59.7 20 245 41 285
3 GGAGAGATGGCTGATCCAAA 60.158 20 ACGCATTCGTTGAAGGATCT 59.7 20 203 83 285