Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN47142
GGAACTTCCAAAATCTCCAGTCCCGTCTGCGAGAGCTAGCAGCAGCGATCGAGGATTAAAACAAAAACAAAAAAAAGTTGCTGGAGAGATGGCT
GATCCAAAGAAGGGGCGTGTACAATGGGATGAAGCTAATATAGTGGAAATTGGATCTAACAAACCTGTTAGGCAGAAGATCACTGAACCTAAGA
CTCCCTACCACCCCATGATTCATGATGATGATGATGATGTTGATGTTGGTGATGGTACTTTGTCTCCAAGAGGAGGAAGATCCTTCAACGAATG
CGTTGATGATATGCAACGTGCGGAAGAACTAAAGAACGCTCTGAATGGTGAATCAGCTTCTTCCAGTAGAAATGCTAGCCAGGGCTCTGGTTCT
GGTGGTGGCTGGAGCTCCGCTGAGGATGATGAAGCAGATCCAATGGATCAAGATGGTTTGGAAGGTGAGAAAAATGAGAGGTTCAGTGAACACA
GAAGAGTGCATTACAATGAGTTCCACAAGGTGAAGGAACTTAGGTCCTTGGGGTCCTTCTATGATGATGAAGAAGAGGACGAGGATGATGATGG
CTCCAAAGGAAGTGAAGCTGAGACAACAACCTCACCACACAGTAAAGGCGTTAACAAAGAGGGGAAGTCATCTTCATCCTCCAGTTGATGATAT
GATATGATACCTCTGTTCAATCAAGCGTGTACTCTTGTCCACGTTTTATAGATCTCTCTCTCTCAATCTTTAAACCTTTTTGAAAGGAAGAGGA
ACAAGAAAACAAAAATCAAGATTCTGAAACTAAGTTATGCTGTTACGGCATTTTAATGCAATTGCTTACAATCACTACTCC

Primers for UN47142 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 GATGGCTCCAAAGGAAGTGA 60.195 20 TTGCATTAAAATGCCGTAACA 59.121 21 254 560 813
2 ATGGCTCCAAAGGAAGTGAA 59.67 20 TTGCATTAAAATGCCGTAACA 59.121 21 253 561 813
3 GATGGCTCCAAAGGAAGTGA 60.195 20 TTGCATTAAAATGCCGTAACAG 60.023 22 254 560 813