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Simple sequence repeat (SSR)
>UN47187
AATCGAGTGGGAGTCCGAAGACGCAGATTCCGATGACACAGAAGAAGAAGAAGAGTATACCTCGCCGTCGCAACCACCGTCTTCGGCGAACTTC
GATAAAGATCGACACTTGGTGTATTTGCAGATGATGTACGAGCTGCTTCCGTACCATTACCAATCGCAGGAGATCAATCGACTTACCCTCGCTC
ACTTTATAATCTCCGGACTTCACTTTCTCGGCGCAACAGACCGTGTTGACAAAGATGTAGTTGCGAACTGGGTTCTGTCCTTCCAGGCCTTCCC
TAGGAACAGAGCTTCACTCAAAGAAGGTGAATTCTACGGGTTCTACGGTTCAAGGAGCTCTCAGTTTCCTATAGATGTTAATGGGTCTGTGCTG
CAGGATCTAACTCATAACAACAGTCACCTGGCAAGTACATACTGTGCCTTGGCTATTCTTAAGGTGATTGGGCATGATCTCTCGACCATTGACT
CTGAATCACTGTTGTTATCCATGAATAATCTTCAGCAAGATGATGGAAGCTTCATGCCTATCCATACTGGAGGCGAGACGGATCTTCGGTTTGT
ATATTGTGCTGCTGCAATCTCTGACATGCTGGGTGATTGGAGTGGAATGGACAAGGAGAAGGCTAAGAATTACATATTAAATTGTCAGTCATAT
GATGGTGGCTTTGGGTTGATCCCTGGTTCTGAATCTCATGGTGGTGGTACTTACTGTGCTATTGCATCCCTTAGATTGATGGGGTTTATTGGAG
CTGATCTGCTGTCAAATGATCCATCCAGTTCAATTCTAGACCCTTCATTGCTTCTCAACTGGAGCCTACAGAGACAAGCCAGTGATGGTGGTTT
TTCAGGTAGGACTAACAAACAGAGCGACACATGCTATGCATTTTGGATTGGAGCTGTCCTTAAACTCATAGGAGGCGATGCATTCATTGACAAA
ATTGCTTTCCGCCAATTTTTACTGAGCTGCCAGTCCAAGTATGGTGGGTTCAGTAAATTTCCTGGAGCGTTACCAGATCTGTATCATTCATACT
ATGGCTACACTGCGTTTAGCTTCTTGGAGGAACCGGGATTGAGTCCTCTATGCCCTGAGCTAGGGTTACCTCTTCTTACATCCTTGGGAATCTG
ATTCCCCCTCAAAGTCCCCCACATTCTTTTTTATCAACCCAACTGTAACTTTTATTTGGTATTTGATTATTGGTTTATGTATTTTAATTGATTT
AGAAATCGAAACTAAATCCAGAATTCTAGTGTCATATATTTACCTATGATTTTATAAATTTTAATTTGATATTTCAT |
Primers for UN47187 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
GAGTCCGAAGACGCAGATTC |
59.957 |
20 |
CTCCTGCGATTGGTAATGGT |
59.955 |
20 |
156 |
11 |
166 |
| 2 |
GAGTCCGAAGACGCAGATTC |
59.957 |
20 |
GAGCGAGGGTAAGTCGATTG |
59.836 |
20 |
178 |
11 |
188 |
| 3 |
AAGACGCAGATTCCGATGAC |
60.226 |
20 |
CTCCTGCGATTGGTAATGGT |
59.955 |
20 |
149 |
18 |
166 |
|
|
