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Simple sequence repeat (SSR)
>UN04508
GAACAAACGTACGTTCTACTTCTTTGTACATCTTTTGGCTAAAAAGACAAAGGACAAGTCTAATAACATAATTGATTGTGTTTCAATCACTTTA
TGTTCAATCCTTTTCATGTTTCAGTCACCATGTGTGATTGTGTTTTATTAGATTGCCCACCTTCACTATTTTTTTTTTAATTTTCGGAAATGGT
ATCTTTCCCTTATGTGCACAGATGAAAAGAACTTTCATAGGTATGAATTAAAAAGTGTATACCTCTCATGTTTCTCTCCTTTTTTCTAAAAATA
TTTTCATTCGAATAATTAAAGTATTCATTGTTTGAGTGAGATCTTTAAGCAAGTGAATTCAATTATCAGCCATCTCAATTTAGAATAAAATATC
CAAATTTGGTTTATTAAAAAGGGTGAAAAGAAAGAGGAACTAATGCGAATTAATGATCATCATCTATATGGGAAAAGCACTAACTCAATGGAAG
AAAGCTTGCCGAAGAAAATGACTCTTTAGAACAATTTGCATTTTGCATTATCATTTTTGTTTTGTTGGGAAATTTTATAGTATAATTTTACCGA
ATATGAAACGTTTATTTACATGAGTTTCTTCGGTATGAAATCATCATACTATACATGACCGATCGGTAAATTAATCGTCATATCTACTTTTACC
ATTGAAACAGGACTCCAACGCACCGGTAAAAGCTGTAGGCTACGGTGGTTAAACTATCTCCGCCCTGATGTCCGCCGTGGAAACATTACCCTCG
AAGAACAACTCTTGATCCTCGAACTTCATTCCCGCTGGGGCAATCGGTATGTTCAAAATTTTAACCTAATATTTTTTTGTATCGTTTTAAGTTC
TTTTTTTTGCTAAAATCGTTTTAAGTTCTTTTCTTCCACAAAATAAAGTTTAAATCTCTAAAAAATAACCATTTGTTAATACAACTTTGTTTTC
CAAATAATATTATTTACTATTTTCACTATACGTACGTGAAACGCAAGCAATAGAATAACGATATAATTCTTTTGCAACGGAGAAAATAACGGTA
TATATCGATGTTAGTGGATATATACAAAAAGAATTACATGCATGATTGAGATATTAATGAATAGAACGTAGTAAATATGAGCATAATAAAAAAA
AATATGAGCATAATAGCTTATCAGTATATAATATGTCTTAAACAGTTGATTTAATGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTTTGATGAATAGATGATC
AAAAATCGCACAATACCTACCGGGAAGAACAGACAATGAGATCAAAAACTACTGGAGAACCCGAGTGCAAAAACATGCGAAGCAGCTTAAATGC
GACGTGAACAGTCAGCAATTCAAAGACACAATGAAGTACTTGTGGATGCCACGGCTCGTC |
Primers for UN04508 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TACGTACGTGAAACGCAAGC |
59.94 |
20 |
CCGGTAGGTATTGTGCGATT |
59.845 |
20 |
277 |
969 |
1245 |
| 2 |
CGTGAAACGCAAGCAATAGA |
60.014 |
20 |
CTTCCCGGTAGGTATTGTGC |
59.452 |
20 |
275 |
975 |
1249 |
| 3 |
GCAACGGAGAAAATAACGGT |
59.091 |
20 |
CATTGTCTGTTCTTCCCGGT |
59.966 |
20 |
247 |
1014 |
1260 |
|
|
