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Simple sequence repeat (SSR)
>UN48021
TTTTTTGAAGGTCAACCCCATAGACGAACGCGTGAAGACATCGTCTCTTTCATCTCGCTCTGGCCGTGACGGCGCTTGCGTCGATTACGGCTCC
GTTGCTCTTTGTTTTTTTGCCCCTGACAGATCTCCTCTCTTCAGTGATATGCTTGTTGCCCTGGTGACGAAAGAAGACAGAGTCATTCAGATCT
GGTCGTCGGATCTCGATTTGAAGCTTTTCTCTTTTAATCTGGAGTGAAGGTGAGCTGTAGGAACTTTGGAGTATCTGTAGGGGGTCGGATTTAG
TTGGCTTAGGTTTTGGTTGTCCCAATTTTCTCTGTTTGGTGAGGCCCAAAACCTAACATAGTCTCTGTCAGTGGCCGTTGTGGAGGGTGCGTGA
GGTTTAGCTGCGTTTGTGGTTTGGCGTATTGGTTGGTCTTGGGAGTGCCGTCTCTGCTCACTGGAATCATCTCCGGTGGTTGTTGAGCTTTGAT
GGTCAGAGCCTGCGAGCCTGTGAGAAGAACGGAAGGTGTTAGCTGGTTTGCGGAACGTATGCTTCATAGTTGCTCGATTGCCGGCGAGGTGATC
GTGTTAGTTCTGGATTTGGAGTGGTTTTTATCTAGCTACCGGCTGTGTGAATAAGTAGTGTTCGGGAAGCTTTTAGAGGCTTCGCCGAGAGGTG
TTGGTGCGTATGAGGCGCGGGGAGAGCCTACTCAAGGTCCAATGGCGAGTTTTAGTTGGGATTGTAAGGTGTTTACAGTGACGGTTAAGGATTC
TAACCCCTCTCGATTCAGTTATGTTTTGGTGGTGTTCAAGTGCTTCCAGTTTCCTTCTTTGCTCTTCTTAATCTGTATTAATTGTTGGTGAGTT
CTCGGTAGTTCTATGTGTGGCGTTGGAGCGGATTTCTCGGATGGAAGTGCTCGTGGATATTATCTAGCAACTCAACTTATTAGGTGTGCATTGC
TCTCTCTCTCTCGTATCCAGTCAGCTTCACCAGTGTTGCAGTCTCACCTATCTCCACCATCCTCCTCATCTTTGTTTTCAATTTTAGTCTAGTT
TCTGGTTTCAGTGTTAGTATCAATCTGTGTTTCTGGATGGTGTCCATCACCACCAGCTTATGGCTCCAGAAAGGTTTGATCACCTTTGCTGGCT
TTGTGTACTTCCATTTTCAAGATTAATATAAATCCATCAGATGACAAAAAAAAAAAACCTGTTAAATGTCAAAACAATGATGAAGATAATTTTG
TGTTAAAACACTACCATTCC |
Primers for UN48021 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TGGTGTTCAAGTGCTTCCAG |
59.873 |
20 |
GATGAGGAGGATGGTGGAGA |
60.008 |
20 |
229 |
782 |
1010 |
| 2 |
TGGTGGTGTTCAAGTGCTTC |
59.726 |
20 |
GATGAGGAGGATGGTGGAGA |
60.008 |
20 |
232 |
779 |
1010 |
| 3 |
GTGGTGTTCAAGTGCTTCCA |
59.726 |
20 |
GATGAGGAGGATGGTGGAGA |
60.008 |
20 |
230 |
781 |
1010 |
|
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