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Simple sequence repeat (SSR)
>UN48222
CGTTTATATCAAATCAATAATATGTAAACTTCAAGTATGTTTGATGTATTCAATTAATAGAGAGAGGTTAGGTATGATATTTCTAAAATGTACT
AAAACTTACATTTCTCTAAAGCTAAACTAAAACATACAACTTCAGTTACATTTGATGAATTCAGTTAGATATTATATTTTTAAATTTGTGGACT
GTGGAATATTAAAAATGCAACTTGAAATGTGAGGGATTTTATTTGAGTATGATGTATCGGCATTGATTTTAAGGACAAATAACCACGTAGTTCT
ATCAATATGGACTCACACTCTGCAATAAGACGAAAATCGTCAAAAAAAATTTGGATAAATCAAATAGTTTTCTTAATTAAGTTGGTAGAAGAAC
ATACATGATTTGCTGCTCCAAAATACAGGGGTGGTTAGTTAAATATTTCAGATTAGACTCAAGGAGACTGTTCAATTTACAACGGAATAAACTA
TAATTAATTATTAAGGAGCTCTTAACACGTAAAAATTATGATTAACAAAAGCAGACTTACCCTTTCTCGTTATTCTCTTCCTCATCATCGAGTT
GAGAAGCTACGAGTTTAATGAATCTGAGGATGTTTTTGAAGGAGAGATGAACACTTAGACGCCGAGTTACGAAGATAACAGGGATGATAAGAAG
AGCAAGACAAGTGCAAACAACAGAGACTATATACACCATTTGTTCCATTTCTTCTCCTTTTTCCCGAATTGAAGCACTCGGCTATGTACTTAAA
GAGCTTCGCGTTCAAAGACGCTCATGATCAATGTAATGCTTTCTCTCTCTCTCAGCTCTCTGGCTCCTCTAGATGCTACGCAAAAACAGGTCAT
ACGTATTTAAGGTTAATAAGATCTTACGACACTTGAAAAACGCTAAATGGTTTCTCACGTGATTAGTAAAAGGATTGGCATCCCAAGTAGGGAA
AAGAAGATGTTTTATAAAAA |
Primers for UN48222 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TTTTTCCCGAATTGAAGCAC |
60.053 |
20 |
TGGGATGCCAATCCTTTTAC |
59.762 |
20 |
216 |
716 |
931 |
| 2 |
TTTTTCCCGAATTGAAGCAC |
60.053 |
20 |
TTGGGATGCCAATCCTTTTA |
60.26 |
20 |
217 |
716 |
932 |
| 3 |
CTTTTTCCCGAATTGAAGCA |
60.181 |
20 |
TGGGATGCCAATCCTTTTAC |
59.762 |
20 |
217 |
715 |
931 |
|
|
