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Simple sequence repeat (SSR)
>UN48459
CAAGGAATTTTTGTTTGTATTACAGCTAAAGAAAAGACGTAAACAAAAGGATATTTGAAGAAAAAAAAAACAATGAGAGTGAAAGTGTATGATC
AGTGAATGAGTCTGCCTCCACAGGTGAAAGTGACAATGCAGGACTCATCCACAAAGACTGTATAGTTATGAGCAGGTTTCGCTAGCAATGGCGG
CAGCCTAACCAGAAGGTCGCACACGCACTCGTTGTCCATTTGCTTCAACCACTTGCAGCACTCTTGCTCTGCATACGTCTCCTCTCTGTGTCTG
TGATGATGATGGTGGTGGTGTCGGCGCCGATGGTGGCGTCTGTGGCTGTTGTCGTTATTGTTGTGGTGTTCATGGTCATCGTCATCGTGATCAT
GATCATGGTTGTTGTGATCATGACCATGGTTGTTGTGATCATGGTCGTGGTCGCGGTTATGATCATGATCATGGTCATGGTCGCGGTTGCGATG
ATGGTCATGGTCATCGTGATCATGGTCGTGGTCATTGTCGTCATGGTCATGGTGATCATTGTCATGGTCGTGATCATGGTGGTCATGGTCGTGA
TCATGGTGGTCATCATCATCGTCGTGGTCATCATCATCATCATCATCATCGCGTGGTCATCATCATGGTCATGGTCATGGTCAGGAGGAGGAGG
AAAGATGGGAGGAGGAGGTGGGGCAATGGGGGAAGGAGGTGGGACGGTGTTCATAGGGAGACGAGAGCAGGCGTAGTTAGCCAGCGCGTATTGA
GAGGCGCATAATGGACGCGGTGGTGGAATCTGTACGATTCTTTGCCCTCGTGTGAAAGAGGAAGAGGAGAGAGCCAGAATTAGGAGACTAGCTA
CAAGAAAAAGAGTTTCCATGGAATGTGTATATGTGTGTGAAGAGAGATCTTCGGTTATATTTATATATATATTCAAAGGTGAATAGAGGCACCC
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Primers for UN48459 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
TGATCATGGTCGTGGTCATT |
59.769 |
20 |
CGTCTCCCTATGAACACCGT |
59.989 |
20 |
235 |
487 |
721 |
| 2 |
TGATCATGGTCGTGGTCATT |
59.769 |
20 |
CCTGCTCTCGTCTCCCTATG |
59.966 |
20 |
243 |
487 |
729 |
| 3 |
GGTGATCATTGTCATGGTCG |
59.769 |
20 |
CCTGCTCTCGTCTCCCTATG |
59.966 |
20 |
209 |
521 |
729 |
|
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