Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

Simple sequence repeat (SSR)

>UN49088
GATCGTCGACGTGCCTGTCTTCGGGAGGCTGACGTTACCCTTGGAGAAGCGCGGGGAGATTCCTATACCTAAGAAGCCTGATGTAGACATTGAG
AAGATCAAGTTCCAGAAGTTTTCTCTGGAAGAGACTGTTGCGATACTCCACGTGAGGCTTGAGAACATGAATGATTTTGACTTGGGGCTTAACG
ACTTGGACTGTGAGGTTTGGTTGAGTGATGTGAGCATTGGGAAAGCTGAGATAGCGGATTCTATTAAGCTTGATAAGAACGGGAGCGGGTTGGT
TAACGTGCCGATCACGTTTAGGCCCAAGGATTTTGGGTCTGCGCTTTGGGATATGATTCGTGGTAAAGGGACGGGGTATACTATTAAATGGAAT
GTGGATGTTGATACGCCGTTTGGTGCTATAAAGCTTCCTATTGTTAAGGAAGGTGGTGAGACTCGTTTGAAGAAGGAAGATAATGATGATGATG
ATGATG
ACGAATGAGGAGTAAGGGAAAGAGCTCAAGAGAATGAGTGTGGTTTTAAGTAATGAATCTTCCATCTTTAAAAAATAATGTTTTTTTT
AAGTTAAACTGGGGACTTGTGTTTGGTGTGTGTTGTTGATGACTGATGGATCAGACTTTTCAGTAGTGCTGTCTTTTGTTTGGACTTCC

Primers for UN49088 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1 GATACGCCGTTTGGTGCTAT 59.988 20 CCAAACACAAGTCCCCAGTT 59.861 20 205 386 590
2 CTGCGCTTTGGGATATGATT 60.06 20 CCAAACACAAGTCCCCAGTT 59.861 20 270 321 590
3 GTGGTAAAGGGACGGGGTAT 59.94 20 CCAAACACAAGTCCCCAGTT 59.861 20 249 342 590