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Simple sequence repeat (SSR)
>UN50701
GGTTGACTTTTGTCTAGTCAAGTGTGAGAGCAATGCATACAACAGTTGAACTCAAGAGCGTGAAATTAAACAAACGTAGTACATCTAAGATATA
TATAAAAAAGGATAAACAAAAGGGTTTTTCAAGGAGAAGAGAGACACGAGACAGTTAGTGTAGAAGTCTGCCTCCACAAGTGAATGTGACGATG
CATGAGTCGTCCACAAAGACTGTATAGTTATGAGCAGGTTTTGATAGCAATGGCGGAAGCGTAACCAGAAGGTCGCACACGCACTCGTTGTCTA
TTTGCCTCAACCACTTGCAGCAATCTTGTTGACCATACGTCTCATCTCCGTGTCGGTGATGATGGTGATGGTGGTGGTGGTGGTCGTCGTCATT
ATCGTGGTGGTCGTGGTCATCGTGATCATGGTCATCATGATCGTGGTCGTGGTCATCGTCATCATGGCCGTGGTCATCGTCATCATGGTGGTGG
TGGTGGTCATCGTCATCATGGTCGTGATCATCGTCATCATCGTGGTCATGGTCGTCATCATCATCATGGTCGTGGTCATCGTCATCATCATGGT
CATGGTCGTCATCATCATGGTCATGGTCATCGTCATCATCATGGTCGTGGTCATGGTCATCATCATCATCATCATGGTCGTGGTCATGGTGGTC
ATGATGATCATCGTCATGGGGATGGTGGTCATGGTCATGGTCATGGTCATGGTCATCATCATGATCATGGTCAGGAGAAGGTGGGACAGTGGGG
GAAGAAGGTAGGACAGTGGTCACTGGGACACGTGCGCAGGCGTAGTTAGCCAGAGCGTACTGAGAGACGCATAATGGACGTGGCGGTGGAATCT
GTATGATTCTCTGGCCTCGTGTGAAAGAGGAAGAGGAGAGAGCCAAAAGTAGAACAGCTACAATAAAAAGAGTTTCCATTATGAGTATGTGTGT
GTGTGTGTCCC |
Primers for UN50701 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
GATCATCGTCATCATCGTGG |
59.882 |
20 |
CTGTCCTACCTTCTTCCCCC |
59.928 |
20 |
273 |
496 |
768 |
| 2 |
GATCATCGTCATCATCGTGG |
59.882 |
20 |
TCCTACCTTCTTCCCCCACT |
59.928 |
20 |
270 |
496 |
765 |
| 3 |
TGGTCATGGTCGTCATCATC |
60.349 |
20 |
GTCCCAGTGACCACTGTCCT |
60.006 |
20 |
221 |
561 |
781 |
|
|
