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Simple sequence repeat (SSR)
>UN51171
GGGCAGTTACTTCAATATATGCATAGGAATGTTGCCTAATGAATGCAAATAATGTTGCAAGTTTGGTAGATGAAGTTAAAATACAAGTTAAAGG
AATCACTTGGACTCGTTAAGCAATGTGTTCATGCTGCTGAACTAGTTGGCCTTTCAAAAAAAAAGCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAA
CAGTTTTCTCTCGAGCGTCTCTCCCACCAACACCTTCAAACCCTAATTCTCAGAAATCAATTCTTGTTTGAGGGGATCGTGGGCTTCTGTCGCC
TCCAGTCTCCTCCCCCATCTGTGTTTGCTCTTCTTAGCCACTATCACCGACCCATCAACCGCCATTAAACCTTCTTTGTCGTGTACTCTGGATC
TCTGCTTTGGTGGATCTAATCGGAAGCTAGAGGCGTGTGTCTCTCTTCTCTGGAATACAGACGAGGGTGTAATGTGTGGCGTGATACTCGGTGG
CCTTGATTCTCTTTCTCCTCTGATTGTTGGCGTAAGATCTGGGTCAGATCTTAATTCAAGTTTGGTGATTTTTCGGGAGTGTAGCTACCTCTCT
TCTCATCGCCGCCTTGCCTTCCAACAGTTCAAGGGTCTTGCAGCTTCAAGGTTCAATAGAGCCTCTCCTCTGGAATTTGTTTTCTGAGAGCGGC
GGAGCCGTGGTTCTCCGCTGAGAGCCTCTTCTCTTAGCCTCAAGTGTCAGCTTCCATGGTATTATCTGTTGATGCTCTGTTTCTCTCCGTTGTG
TTTTGATGGTTGATGCTCAGGGTCCTTGAGGACAGACCCAATGTGTCTCTAAAAGTCACGTTGGAAGATACTTGCTTTTGATGGATTTCACCTG
TTTTTGAGAAGTTGTATGGCTTCTCCTGATCTTCAACTCCGTCTACAAGCTCCGATTTGCTCCTCTTTTGAGTGTGAGCTTCCCGAGAAGCTTC
TGGTTTTGGTTTCAACAGAGCACCTCAGCCTGCACTGGAGTGGAATGCTTGGCCCTCCGTCGTCGCGGCCGAGAGAATCTGTGGAGTCTTCCTA
AGCCTGCACCGGAGTGGTAGCTGTCCCTCCGTCGTCGCGGCAAAGAAACTCTTTGGATTTCCTCTACGTAAACCAACTCTGTATAGCCTTCTCC
TCGTCACCTTCCTTGGTACTTGGAAGCGCTTGTAAGGAATCTTTGCTGATGTTTGTTGCTAAACTGTTAGGTCAAAGTCTTGTTCTCTTGATCA
AACTTGATCTTAATTAGATGTTTAGGGCTTTTTATTTTTTTGCGGCTCTTTTCATCTGAATGGTTTAGTTGCAGATGTTGATTGCAAATCCTTG
TAATCAGACCTTCATTATCTTGTTAATGATATTTACCCTTTAACAAAAAAAACTGGTTGGCCTTC |
Primers for UN51171 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
AAGCAATGTGTTCATGCTGC |
59.878 |
20 |
GGGTCGGTGATAGTGGCTAA |
59.955 |
20 |
224 |
112 |
335 |
| 2 |
AAGCAATGTGTTCATGCTGC |
59.878 |
20 |
GAAGGTTTAATGGCGGTTGA |
59.938 |
20 |
245 |
112 |
356 |
| 3 |
AAGCAATGTGTTCATGCTGC |
59.878 |
20 |
GAAGGTGTTGGTGGGAGAGA |
60.088 |
20 |
114 |
112 |
225 |
|
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