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Simple sequence repeat (SSR)
>UN51894
GGAGAACCCTTAAACCTTATCCCATCCCGAGAGAGAGAGAGCCATGTCTGCCTCCGCTTCTTCCGTTTCCCTCTCTTCCTTCAATCCCAAATCC
CTTCTTCCTCTCTGCCTTTCCCGCTCCGCCCTCAAATCCTCCTCCTCACCCGCCCAATTCCCATCTCTCTTCGTCACACACGTCGCCGTATCCT
CTGATTTCGAGGTTGAGGAAGACGACATGTTCGCTGACGACGATTCTCCGCCGCCGCAGGAGCGCAGCTCCTTCTCTGCTGACCTCAAACTCTT
CGTCGGTAACCTTTCCTTCGATGTCGAAAGCGCCCAGCTCGCTCAACTGTTCGATAGCGCCGGTAACGTTGAGATGGTTGAGGTTATCTATGAC
AAATTGACTGGCCGAAGCAGGGGTTTTGGGTTTGTCACTATGTCCTCTGCACCTGAAGCTGAGGCTGCAGCTCAACAGTTCAATGGCTATGAAT
TTGAAGGTAGACCCTTGAGGGTTAACGCTGGCCCTCCTCCACCTAAGGGGGAGGAATCATTCTCCAGGGGACCAAGGAGTGGTGGTTATGGTTC
TGAACGTTCAGGTTACAGTTCTGAACGTTCCGGTTACGGGTCTCAACGTTCAGGACGTTCTGGTTACGGTTCTGAGCGTTCTAGCTACGGTTCT
GGGTCTGGTTCGGGCTCGGGCTCATCAGACCGTGTTTATGTGGGTAACCTTTCTTGGGGTGTGGATGACATGGCTCTTGAGAGCTTGTTTAGTG
AGCAAGG |
Primers for UN51894 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
1 |
GAGAACCCTTAAACCTTATCCCA |
59.74 |
23 |
CGAACATGTCGTCTTCCTCA |
59.831 |
20 |
220 |
2 |
221 |
2 |
GAGAACCCTTAAACCTTATCCCA |
59.74 |
23 |
GAAATCAGAGGATACGGCGA |
60.177 |
20 |
195 |
2 |
196 |
3 |
GAGAACCCTTAAACCTTATCCCA |
59.74 |
23 |
TCGAAATCAGAGGATACGGC |
60.177 |
20 |
197 |
2 |
198 |
|
|