BLASTX 7.6.2
Query= UN00674 /QuerySize=714
(713 letters)
Database: GenBank nr;
15,229,318 sequences; 5,219,829,378 total letters
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gi|344240329|gb|EGV96432.1| DNA topoisomerase 1 [Cricetulus gris... 136 4e-030
gi|170594750|ref|XP_001902117.1| cyclophilin-RNA interacting pro... 134 1e-029
gi|224050349|ref|XP_002188974.1| PREDICTED: similar to circumspo... 134 1e-029
gi|224083107|ref|XP_002188890.1| PREDICTED: hypothetical protein... 134 1e-029
>gi|344240329|gb|EGV96432.1| DNA topoisomerase 1 [Cricetulus griseus]
Length = 142
Score = 136 bits (341), Expect = 4e-030
Identities = 72/99 (72%), Positives = 77/99 (77%)
Frame = -3
Query: 492 KEEVEDLAAKLNAAGGVAVVEEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKE 313
+EE E+ K A EE + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKE
Sbjct: 16 EEEEEEEEKKEEAEEQEEEEEEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 75
Query: 312 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENENENENEKEKEKEKEE 196
KEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E E E E EKEKEKEKE+
Sbjct: 76 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 114
>gi|170594750|ref|XP_001902117.1| cyclophilin-RNA interacting protein [Brugia
malayi]
Length = 237
Score = 134 bits (336), Expect = 1e-029
Identities = 67/79 (84%), Positives = 70/79 (88%)
Frame = -3
Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
+E + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 90 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 149
Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
E E E E EKEKEKEKEE
Sbjct: 150 KEKEKEKEKEKEKEKEKEE 168
Score = 134 bits (336), Expect = 1e-029
Identities = 69/91 (75%), Positives = 74/91 (81%)
Frame = -3
Query: 468 AKLNAAGGVAVVEEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKE 289
A L+ G +E + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 64 ASLSERGEKKEKKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 123
Query: 288 KEKEKEKEKEKENENENENENEKEKEKEKEE 196
KEKEKEKEKEKE E E E E EKEKEKEKE+
Sbjct: 124 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 154
Score = 132 bits (332), Expect = 4e-029
Identities = 66/79 (83%), Positives = 70/79 (88%)
Frame = -3
Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
+E + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 100 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 159
Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
E E E E EKEKEKEKE+
Sbjct: 160 KEKEKEKEEEKEKEKEKEK 178
Score = 132 bits (332), Expect = 4e-029
Identities = 66/79 (83%), Positives = 70/79 (88%)
Frame = -3
Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
+E + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 102 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 161
Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
E E E E EKEKEKEKE+
Sbjct: 162 KEKEKEEEKEKEKEKEKEK 180
Score = 132 bits (332), Expect = 4e-029
Identities = 66/79 (83%), Positives = 70/79 (88%)
Frame = -3
Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
+E + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKE+EKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 122 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEEEKEKEKEKEKEKE 181
Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
E E E E EKEKEKEKEE
Sbjct: 182 KEKEKEKEKEKEKEKEKEE 200
>gi|224050349|ref|XP_002188974.1| PREDICTED: similar to circumsporozoite protein
[Taeniopygia guttata]
Length = 868
Score = 134 bits (336), Expect = 1e-029
Identities = 67/79 (84%), Positives = 70/79 (88%)
Frame = -3
Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
+E + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 784 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 843
Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
E E E E EKEKEKEKEE
Sbjct: 844 KEKEKEKEKEKEKEKEKEE 862
>gi|224083107|ref|XP_002188890.1| PREDICTED: hypothetical protein [Taeniopygia
guttata]
Length = 138
Score = 134 bits (336), Expect = 1e-029
Identities = 67/79 (84%), Positives = 70/79 (88%)
Frame = -3
Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
EE + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 34 EEEEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 93
Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
E E E E EKEKEKEKE+
Sbjct: 94 KEKEKEKEKEKEKEKEKEK 112
Score = 134 bits (336), Expect = 1e-029
Identities = 67/79 (84%), Positives = 70/79 (88%)
Frame = -3
Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
EE + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 36 EEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 95
Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
E E E E EKEKEKEKE+
Sbjct: 96 KEKEKEKEKEKEKEKEKEK 114
Database: GenBank nr
Posted date: Thu Sep 08 23:06:31 2011
Number of letters in database: 5,219,829,378
Number of sequences in database: 15,229,318
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Gapped
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Matrix: blosum62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 86,476,451,186
Number of Sequences: 15229318
Number of Extensions: 86476451186
Number of Successful Extensions: 51710519
Number of sequences better than 0.0: 0
|