Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

GenBank blast output of UN00674


BLASTX 7.6.2

Query= UN00674 /QuerySize=714
        (713 letters)

Database: GenBank nr;
          15,229,318 sequences; 5,219,829,378 total letters
                                                                  Score    E
Sequences producing significant alignments:                       (bits) Value

gi|344240329|gb|EGV96432.1| DNA topoisomerase 1 [Cricetulus gris...    136   4e-030
gi|170594750|ref|XP_001902117.1| cyclophilin-RNA interacting pro...    134   1e-029
gi|224050349|ref|XP_002188974.1| PREDICTED: similar to circumspo...    134   1e-029
gi|224083107|ref|XP_002188890.1| PREDICTED: hypothetical protein...    134   1e-029

>gi|344240329|gb|EGV96432.1| DNA topoisomerase 1 [Cricetulus griseus]

          Length = 142

 Score =  136 bits (341), Expect = 4e-030
 Identities = 72/99 (72%), Positives = 77/99 (77%)
 Frame = -3

Query: 492 KEEVEDLAAKLNAAGGVAVVEEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKE 313
           +EE E+   K  A       EE + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKE
Sbjct:  16 EEEEEEEEKKEEAEEQEEEEEEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 75

Query: 312 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENENENENEKEKEKEKEE 196
           KEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E E E E EKEKEKEKE+
Sbjct:  76 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 114

>gi|170594750|ref|XP_001902117.1| cyclophilin-RNA interacting protein [Brugia
        malayi]

          Length = 237

 Score =  134 bits (336), Expect = 1e-029
 Identities = 67/79 (84%), Positives = 70/79 (88%)
 Frame = -3

Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
           +E + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct:  90 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 149

Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
            E E E E EKEKEKEKEE
Sbjct: 150 KEKEKEKEKEKEKEKEKEE 168


 Score =  134 bits (336), Expect = 1e-029
 Identities = 69/91 (75%), Positives = 74/91 (81%)
 Frame = -3

Query: 468 AKLNAAGGVAVVEEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKE 289
           A L+  G     +E + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKE
Sbjct:  64 ASLSERGEKKEKKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 123

Query: 288 KEKEKEKEKEKENENENENENEKEKEKEKEE 196
           KEKEKEKEKEKE E E E E EKEKEKEKE+
Sbjct: 124 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEK 154


 Score =  132 bits (332), Expect = 4e-029
 Identities = 66/79 (83%), Positives = 70/79 (88%)
 Frame = -3

Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
           +E + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 100 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 159

Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
            E E E E EKEKEKEKE+
Sbjct: 160 KEKEKEKEEEKEKEKEKEK 178


 Score =  132 bits (332), Expect = 4e-029
 Identities = 66/79 (83%), Positives = 70/79 (88%)
 Frame = -3

Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
           +E + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 102 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 161

Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
            E E E E EKEKEKEKE+
Sbjct: 162 KEKEKEEEKEKEKEKEKEK 180


 Score =  132 bits (332), Expect = 4e-029
 Identities = 66/79 (83%), Positives = 70/79 (88%)
 Frame = -3

Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
           +E + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKE+EKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 122 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEEEKEKEKEKEKEKE 181

Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
            E E E E EKEKEKEKEE
Sbjct: 182 KEKEKEKEKEKEKEKEKEE 200

>gi|224050349|ref|XP_002188974.1| PREDICTED: similar to circumsporozoite protein
        [Taeniopygia guttata]

          Length = 868

 Score =  134 bits (336), Expect = 1e-029
 Identities = 67/79 (84%), Positives = 70/79 (88%)
 Frame = -3

Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
           +E + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct: 784 KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 843

Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
            E E E E EKEKEKEKEE
Sbjct: 844 KEKEKEKEKEKEKEKEKEE 862

>gi|224083107|ref|XP_002188890.1| PREDICTED: hypothetical protein [Taeniopygia
        guttata]

          Length = 138

 Score =  134 bits (336), Expect = 1e-029
 Identities = 67/79 (84%), Positives = 70/79 (88%)
 Frame = -3

Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
           EE + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct:  34 EEEEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 93

Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
            E E E E EKEKEKEKE+
Sbjct:  94 KEKEKEKEKEKEKEKEKEK 112


 Score =  134 bits (336), Expect = 1e-029
 Identities = 67/79 (84%), Positives = 70/79 (88%)
 Frame = -3

Query: 432 EEVDGEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKENENDKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 253
           EE + EKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE E +KEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE
Sbjct:  36 EEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKEKE 95

Query: 252 NENENENENEKEKEKEKEE 196
            E E E E EKEKEKEKE+
Sbjct:  96 KEKEKEKEKEKEKEKEKEK 114

  Database: GenBank nr
    Posted date:  Thu Sep 08 23:06:31 2011
  Number of letters in database: 5,219,829,378
  Number of sequences in database:  15,229,318

Lambda     K     H
   0.267   0.041    0.140
Gapped
Lambda     K     H
   0.267   0.041    0.140
Matrix: blosum62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 86,476,451,186
Number of Sequences: 15229318
Number of Extensions: 86476451186
Number of Successful Extensions: 51710519
Number of sequences better than 0.0: 0