BLASTX 7.6.2
Query= UN09304 /QuerySize=936
(935 letters)
Database: GenBank nr;
15,229,318 sequences; 5,219,829,378 total letters
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gi|1351030|sp|P21239.2|RUB1_BRANA RecName: Full=RuBisCO large su... 457 2e-126
gi|15226314|ref|NP_180367.1| chaperonin-60alpha [Arabidopsis tha... 452 4e-125
gi|21554572|gb|AAM63618.1| putative rubisco subunit binding-prot... 452 4e-125
gi|62321579|dbj|BAD95121.1| putative rubisco subunit binding-pro... 450 3e-124
gi|297826149|ref|XP_002880957.1| CPN60A [Arabidopsis lyrata subs... 450 3e-124
gi|1710807|sp|P08926.2|RUBA_PEA RecName: Full=RuBisCO large subu... 428 8e-118
gi|84468442|dbj|BAE71304.1| putative rubisco subunit binding-pro... 422 4e-116
gi|84468296|dbj|BAE71231.1| putative rubisco subunit binding-pro... 422 4e-116
gi|84468456|dbj|BAE71311.1| putative rubisco subunit binding-pro... 422 4e-116
gi|84468288|dbj|BAE71227.1| putative rubisco subunit binding-pro... 422 4e-116
gi|224104681|ref|XP_002313525.1| predicted protein [Populus tric... 421 7e-116
gi|84468438|dbj|BAE71302.1| putative rubisco subunit binding-pro... 420 2e-115
gi|217074850|gb|ACJ85785.1| unknown [Medicago truncatula] 419 5e-115
gi|224132004|ref|XP_002328161.1| predicted protein [Populus tric... 419 5e-115
gi|225436538|ref|XP_002277357.1| PREDICTED: hypothetical protein... 408 7e-112
gi|134102|sp|P08823.1|RUBA_WHEAT RecName: Full=RuBisCO large sub... 397 2e-108
gi|242032147|ref|XP_002463468.1| hypothetical protein SORBIDRAFT... 396 4e-108
gi|226493235|ref|NP_001148093.1| LOC100281701 [Zea mays] 395 8e-108
gi|219886233|gb|ACL53491.1| unknown [Zea mays] 395 8e-108
gi|115488160|ref|NP_001066567.1| Os12g0277500 [Oryza sativa Japo... 394 1e-107
>gi|1351030|sp|P21239.2|RUB1_BRANA RecName: Full=RuBisCO large subunit-binding
protein subunit alpha, chloroplastic; AltName: Full=60 kDa chaperonin
subunit alpha; AltName: Full=CPN-60 alpha; Flags: Precursor
Length = 546
Score = 457 bits (1174), Expect = 2e-126
Identities = 242/251 (96%), Positives = 245/251 (97%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK
Sbjct: 296 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 355
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDSVYDSEKLAERIAKL+GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 356 ELSETDSVYDSEKLAERIAKLAGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 415
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGGATLVHLSTVIPAIKE EDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI
Sbjct: 416 VPGGGATLVHLSTVIPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 475
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
MFSEWE+GYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA
Sbjct: 476 MFSEWEIGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 535
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
AA P+GLMV
Sbjct: 536 PTAAPPQGLMV 546
>gi|15226314|ref|NP_180367.1| chaperonin-60alpha [Arabidopsis thaliana]
Length = 586
Score = 452 bits (1162), Expect = 4e-125
Identities = 238/251 (94%), Positives = 244/251 (97%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARI+QLKK
Sbjct: 336 IAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARIAQLKK 395
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 396 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 455
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALIAQNAG+EGEVVVEKI
Sbjct: 456 VPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALIAQNAGVEGEVVVEKI 515
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
MFS+WE GYNAMTDTYENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA
Sbjct: 516 MFSDWENGYNAMTDTYENLFEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 575
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
AAAAPEGLMV
Sbjct: 576 PAAAAPEGLMV 586
>gi|21554572|gb|AAM63618.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Arabidopsis thaliana]
Length = 586
Score = 452 bits (1162), Expect = 4e-125
Identities = 238/251 (94%), Positives = 244/251 (97%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARI+QLKK
Sbjct: 336 IAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARIAQLKK 395
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 396 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 455
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALIAQNAG+EGEVVVEKI
Sbjct: 456 VPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALIAQNAGVEGEVVVEKI 515
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
MFS+WE GYNAMTDTYENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA
Sbjct: 516 MFSDWENGYNAMTDTYENLFEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 575
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
AAAAPEGLMV
Sbjct: 576 PAAAAPEGLMV 586
>gi|62321579|dbj|BAD95121.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Arabidopsis thaliana]
Length = 333
Score = 450 bits (1155), Expect = 3e-124
Identities = 237/251 (94%), Positives = 243/251 (96%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARI+QLKK
Sbjct: 83 IAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARIAQLKK 142
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 143 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 202
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALIAQNAG+EGEVVVEKI
Sbjct: 203 VPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALIAQNAGVEGEVVVEKI 262
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
MFS+WE GYNAMTDTYENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV KPKPKA
Sbjct: 263 MFSDWENGYNAMTDTYENLFEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVGKPKPKA 322
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
AAAAPEGLMV
Sbjct: 323 PAAAAPEGLMV 333
>gi|297826149|ref|XP_002880957.1| CPN60A [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata]
Length = 587
Score = 450 bits (1155), Expect = 3e-124
Identities = 240/252 (95%), Positives = 245/252 (97%), Gaps = 1/252 (0%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARI+QLKK
Sbjct: 336 IAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARIAQLKK 395
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 396 ELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 455
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALIAQNAG+EGEVVVEKI
Sbjct: 456 VPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALIAQNAGVEGEVVVEKI 515
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
MFSEWE GYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA
Sbjct: 516 MFSEWEQGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 575
Query: 214 -AAAAAPEGLMV 182
AAAAAPEGLMV
Sbjct: 576 PAAAAAPEGLMV 587
>gi|1710807|sp|P08926.2|RUBA_PEA RecName: Full=RuBisCO large subunit-binding
protein subunit alpha, chloroplastic; AltName: Full=60 kDa chaperonin
subunit alpha; AltName: Full=CPN-60 alpha; Flags: Precursor
Length = 587
Score = 428 bits (1099), Expect = 8e-118
Identities = 222/251 (88%), Positives = 238/251 (94%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAE+QA D+GLLVENTTI+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDELQ+R++QLKK
Sbjct: 337 IAILTGAEFQASDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDELQSRVAQLKK 396
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDS+YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 397 ELSETDSIYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 456
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI
Sbjct: 457 VPGGGTALVHLSGYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 516
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KPKPKA
Sbjct: 517 KNGEWEVGYNAMTDTYENLVESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKA 576
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
A AAAP+GL +
Sbjct: 577 AVAAAPQGLTI 587
>gi|84468442|dbj|BAE71304.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 461
Score = 422 bits (1084), Expect = 4e-116
Identities = 219/251 (87%), Positives = 235/251 (93%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDELQ+R++QLKK
Sbjct: 211 IAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDELQSRVAQLKK 270
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 271 ELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 330
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGIEGEVVVEKI
Sbjct: 331 VPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKI 390
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KPKP+A
Sbjct: 391 RNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPRA 450
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
AP+GL V
Sbjct: 451 PVPGAPQGLTV 461
>gi|84468296|dbj|BAE71231.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 588
Score = 422 bits (1084), Expect = 4e-116
Identities = 219/251 (87%), Positives = 235/251 (93%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDELQ+R++QLKK
Sbjct: 338 IAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDELQSRVAQLKK 397
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 398 ELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 457
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGIEGEVVVEKI
Sbjct: 458 VPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKI 517
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KPKP+A
Sbjct: 518 RNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPRA 577
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
AP+GL V
Sbjct: 578 PVPGAPQGLTV 588
>gi|84468456|dbj|BAE71311.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 588
Score = 422 bits (1084), Expect = 4e-116
Identities = 219/251 (87%), Positives = 235/251 (93%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDELQ+R++QLKK
Sbjct: 338 IAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDELQSRVAQLKK 397
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 398 ELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 457
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGIEGEVVVEKI
Sbjct: 458 VPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKI 517
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KPKP+A
Sbjct: 518 RNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPRA 577
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
AP+GL V
Sbjct: 578 PVPGAPQGLTV 588
>gi|84468288|dbj|BAE71227.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 578
Score = 422 bits (1084), Expect = 4e-116
Identities = 219/251 (87%), Positives = 235/251 (93%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDELQ+R++QLKK
Sbjct: 328 IAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDELQSRVAQLKK 387
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 388 ELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 447
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGIEGEVVVEKI
Sbjct: 448 VPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKI 507
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KPKP+A
Sbjct: 508 RNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPRA 567
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
AP+GL V
Sbjct: 568 PVPGAPQGLTV 578
>gi|224104681|ref|XP_002313525.1| predicted protein [Populus trichocarpa]
Length = 586
Score = 421 bits (1082), Expect = 7e-116
Identities = 219/251 (87%), Positives = 238/251 (94%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAE+QA D+GL +ENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDELQARI+QLKK
Sbjct: 336 IAILTGAEFQASDLGLSIENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDELQARIAQLKK 395
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 396 ELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 455
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGGA LVHLST +PAIKE +DADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGIEGEVVVEK+
Sbjct: 456 VPGGGAALVHLSTHVPAIKEKIKDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKL 515
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
SEWE+GYNAMTD YENL+EAGVIDPAKVTRCALQN+ASVAGMVLTTQAIVV+KPKP+
Sbjct: 516 KESEWEMGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNSASVAGMVLTTQAIVVEKPKPRT 575
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
AAA+P+GL V
Sbjct: 576 PAAASPQGLTV 586
>gi|84468438|dbj|BAE71302.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 588
Score = 420 bits (1079), Expect = 2e-115
Identities = 218/251 (86%), Positives = 234/251 (93%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDELQ+R++QLKK
Sbjct: 338 IAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDELQSRVAQLKK 397
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 398 ELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 457
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGIEGEVVVEKI
Sbjct: 458 VPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKI 517
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQA VV+KPKP+A
Sbjct: 518 RNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQATVVEKPKPRA 577
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
AP+GL V
Sbjct: 578 PVPGAPQGLTV 588
>gi|217074850|gb|ACJ85785.1| unknown [Medicago truncatula]
Length = 587
Score = 419 bits (1075), Expect = 5e-115
Identities = 219/251 (87%), Positives = 235/251 (93%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAE+QA D+GLLVE+T I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDELQ+R++QLKK
Sbjct: 337 IAILTGAEFQASDLGLLVESTPIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDELQSRVAQLKK 396
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 397 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 456
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
PGGG LVHL +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGIEGEVVVEKI
Sbjct: 457 APGGGTALVHLFAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGIEGEVVVEKI 516
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
EWE+GYNAMTDTYENL+E GVIDPAKVTR ALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KPKP+A
Sbjct: 517 RSGEWEVGYNAMTDTYENLIEFGVIDPAKVTRRALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPRA 576
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
AAAAAP+GL V
Sbjct: 577 AAAAAPQGLTV 587
>gi|224132004|ref|XP_002328161.1| predicted protein [Populus trichocarpa]
Length = 587
Score = 419 bits (1075), Expect = 5e-115
Identities = 217/248 (87%), Positives = 235/248 (94%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAILTGAE+QA D+GL +ENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDELQARI+QLKK
Sbjct: 336 IAILTGAEFQASDLGLSIENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDELQARIAQLKK 395
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 396 ELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 455
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGGA LVHLST +PAIK+ EDADERLGADIVQKALV+PA+LIAQNAGIEGEVVVEK+
Sbjct: 456 VPGGGAALVHLSTCVPAIKDKIEDADERLGADIVQKALVSPASLIAQNAGIEGEVVVEKL 515
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
SEWE+GYNAMTD YENL+EAGVIDPAKVTRCALQN+ASVAGMVLTTQAIVV+KPKPK
Sbjct: 516 KASEWEIGYNAMTDKYENLMEAGVIDPAKVTRCALQNSASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKT 575
Query: 214 AAAAAPEG 191
AAAA +G
Sbjct: 576 PAAAATQG 583
>gi|225436538|ref|XP_002277357.1| PREDICTED: hypothetical protein [Vitis
vinifera]
Length = 585
Score = 408 bits (1048), Expect = 7e-112
Identities = 209/251 (83%), Positives = 232/251 (92%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAI+TGAE+QA D+GLL+ENT+++QLG+ARKVTI+KDSTT+IADAASKDE+QARI+Q+KK
Sbjct: 335 IAIMTGAEFQANDLGLLIENTSVEQLGLARKVTITKDSTTIIADAASKDEIQARIAQIKK 394
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDSVYD+EKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 395 ELAETDSVYDTEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 454
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGGA VHLST +PAIK+ EDADERLGADIVQKALVAPA+LIA NAG+EGEVVVEKI
Sbjct: 455 VPGGGAAFVHLSTYVPAIKDKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAHNAGVEGEVVVEKI 514
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
EW +GYNAMTD YENL+EAGVIDPAKV RCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+K KPKA
Sbjct: 515 KACEWAVGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVARCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKAKPKA 574
Query: 214 AAAAAPEGLMV 182
AA P+GL +
Sbjct: 575 PVAAPPQGLTI 585
>gi|134102|sp|P08823.1|RUBA_WHEAT RecName: Full=RuBisCO large subunit-binding
protein subunit alpha, chloroplastic; AltName: Full=60 kDa chaperonin
subunit alpha; AltName: Full=CPN-60 alpha; Flags: Precursor
Length = 543
Score = 397 bits (1018), Expect = 2e-108
Identities = 203/248 (81%), Positives = 224/248 (90%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAI+TGAEY A D+GLLVEN T+DQLG ARK+TI + +TTLIADAASKDE+QAR++QLKK
Sbjct: 292 IAIVTGAEYLAKDLGLLVENATVDQLGTARKITIHQTTTTLIADAASKDEIQARVAQLKK 351
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDS+YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGA TETELEDR+LRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 352 ELSETDSIYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGATTETELEDRQLRIEDAKNATFAAIEEGI 411
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGGA VHLST +PAIKET ED DERLGADI+QKAL APA+LIA NAG+EGEVV+EKI
Sbjct: 412 VPGGGAAYVHLSTYVPAIKETIEDHDERLGADIIQKALQAPASLIANNAGVEGEVVIEKI 471
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
SEWE+GYNAMTD YENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASV+GMVLTTQAIVV+KPKPK
Sbjct: 472 KESEWEMGYNAMTDKYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVSGMVLTTQAIVVEKPKPKP 531
Query: 214 AAAAAPEG 191
A EG
Sbjct: 532 KVAEPAEG 539
>gi|242032147|ref|XP_002463468.1| hypothetical protein SORBIDRAFT_01g000380
[Sorghum bicolor]
Length = 580
Score = 396 bits (1015), Expect = 4e-108
Identities = 203/246 (82%), Positives = 226/246 (91%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAI+TGAEYQ+ D+GLLVENTT++QLGIARKVTIS STT+IADAASKD++QARI+QLK+
Sbjct: 335 IAIVTGAEYQSKDLGLLVENTTVEQLGIARKVTISSSSTTIIADAASKDDIQARIAQLKR 394
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGA+TE ELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 395 ELSQTDSAYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGASTEAELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 454
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGGA VHLST +PAIKET +D +ERLGADI+QKALVAPAALIA NAG+EGEV+V+KI
Sbjct: 455 VPGGGAAYVHLSTFVPAIKETLDDPEERLGADIIQKALVAPAALIAHNAGVEGEVIVDKI 514
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
SEWE GYNAM D +ENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KP+
Sbjct: 515 RESEWEFGYNAMADKHENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPQKAP 574
Query: 214 AAAAAP 197
AAAAAP
Sbjct: 575 AAAAAP 580
>gi|226493235|ref|NP_001148093.1| LOC100281701 [Zea mays]
Length = 584
Score = 395 bits (1013), Expect = 8e-108
Identities = 204/248 (82%), Positives = 228/248 (91%), Gaps = 2/248 (0%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAI+TGAEYQ+ D+GLLVE+TT++QLGIARKVTIS STT+IADAASKD++QARI+QLK+
Sbjct: 337 IAIVTGAEYQSKDLGLLVEDTTVEQLGIARKVTISSSSTTIIADAASKDDIQARIAQLKR 396
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAV+KVGA+TE ELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 397 ELSQTDSTYDSEKLAERIAKLSGGVAVVKVGASTEAELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 456
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGGA VHLST +PAIKET +D +ERLGADI+QKALVAPAALIA NAG+EGEV+V+KI
Sbjct: 457 VPGGGAAYVHLSTFVPAIKETLDDPEERLGADIIQKALVAPAALIAHNAGVEGEVIVDKI 516
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPK--P 221
SEWE GYNAM D +ENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KPK P
Sbjct: 517 RESEWEFGYNAMADKHENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKKAP 576
Query: 220 KAAAAAAP 197
AAAAAAP
Sbjct: 577 AAAAAAAP 584
>gi|219886233|gb|ACL53491.1| unknown [Zea mays]
Length = 474
Score = 395 bits (1013), Expect = 8e-108
Identities = 204/248 (82%), Positives = 228/248 (91%), Gaps = 2/248 (0%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAI+TGAEYQ+ D+GLLVE+TT++QLGIARKVTIS STT+IADAASKD++QARI+QLK+
Sbjct: 227 IAIVTGAEYQSKDLGLLVEDTTVEQLGIARKVTISSSSTTIIADAASKDDIQARIAQLKR 286
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAV+KVGA+TE ELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 287 ELSQTDSTYDSEKLAERIAKLSGGVAVVKVGASTEAELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 346
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGGA VHLST +PAIKET +D +ERLGADI+QKALVAPAALIA NAG+EGEV+V+KI
Sbjct: 347 VPGGGAAYVHLSTFVPAIKETLDDPEERLGADIIQKALVAPAALIAHNAGVEGEVIVDKI 406
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPK--P 221
SEWE GYNAM D +ENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KPK P
Sbjct: 407 RESEWEFGYNAMADKHENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKKAP 466
Query: 220 KAAAAAAP 197
AAAAAAP
Sbjct: 467 AAAAAAAP 474
>gi|115488160|ref|NP_001066567.1| Os12g0277500 [Oryza sativa Japonica Group]
Length = 578
Score = 394 bits (1012), Expect = 1e-107
Identities = 204/250 (81%), Positives = 224/250 (89%)
Frame = -2
Query: 934 IAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDELQARISQLKK 755
IAI+TGAE+ A D+GLLVEN T +QLG ARKVTI + +TTLIADAASKDE+QAR++QLKK
Sbjct: 327 IAIVTGAEFLAKDLGLLVENATEEQLGTARKVTIHQTTTTLIADAASKDEIQARVAQLKK 386
Query: 754 ELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNATFAAIEEGI 575
EL ETDS+YD+EKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDR+LRIEDAKNATFAAIEEGI
Sbjct: 387 ELSETDSIYDTEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRQLRIEDAKNATFAAIEEGI 446
Query: 574 VPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGIEGEVVVEKI 395
VPGGG VHLST +PAIKET ED DERLGADI+QKALVAPA+LIA NAG+EGEVVVEKI
Sbjct: 447 VPGGGTAYVHLSTTVPAIKETIEDHDERLGADIIQKALVAPASLIAHNAGVEGEVVVEKI 506
Query: 394 MFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVDKPKPKA 215
EWE+GYNAM D YENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVV+KPKPKA
Sbjct: 507 KDGEWEVGYNAMNDKYENLIEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAIVVEKPKPKA 566
Query: 214 AAAAAPEGLM 185
A EG +
Sbjct: 567 PVAEPAEGTL 576
Database: GenBank nr
Posted date: Thu Sep 08 23:06:31 2011
Number of letters in database: 5,219,829,378
Number of sequences in database: 15,229,318
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Gapped
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Matrix: blosum62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 1,067,508,043,730
Number of Sequences: 15229318
Number of Extensions: 1067508043730
Number of Successful Extensions: 309422742
Number of sequences better than 0.0: 0
|
