BLASTX 7.6.2
Query= UN14169 /QuerySize=1201
(1200 letters)
Database: GenBank nr;
15,229,318 sequences; 5,219,829,378 total letters
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gi|1351030|sp|P21239.2|RUB1_BRANA RecName: Full=RuBisCO large su... 474 2e-131
gi|15226314|ref|NP_180367.1| chaperonin-60alpha [Arabidopsis tha... 469 5e-130
gi|21554572|gb|AAM63618.1| putative rubisco subunit binding-prot... 469 5e-130
gi|62321579|dbj|BAD95121.1| putative rubisco subunit binding-pro... 466 3e-129
gi|297826149|ref|XP_002880957.1| CPN60A [Arabidopsis lyrata subs... 466 3e-129
gi|1710807|sp|P08926.2|RUBA_PEA RecName: Full=RuBisCO large subu... 444 2e-122
gi|224104681|ref|XP_002313525.1| predicted protein [Populus tric... 438 9e-121
gi|84468442|dbj|BAE71304.1| putative rubisco subunit binding-pro... 438 1e-120
gi|84468296|dbj|BAE71231.1| putative rubisco subunit binding-pro... 438 1e-120
gi|84468456|dbj|BAE71311.1| putative rubisco subunit binding-pro... 438 1e-120
gi|84468288|dbj|BAE71227.1| putative rubisco subunit binding-pro... 438 1e-120
gi|84468438|dbj|BAE71302.1| putative rubisco subunit binding-pro... 436 4e-120
gi|224132004|ref|XP_002328161.1| predicted protein [Populus tric... 436 6e-120
gi|217074850|gb|ACJ85785.1| unknown [Medicago truncatula] 434 1e-119
gi|225436538|ref|XP_002277357.1| PREDICTED: hypothetical protein... 424 2e-116
gi|134102|sp|P08823.1|RUBA_WHEAT RecName: Full=RuBisCO large sub... 412 7e-113
gi|242032147|ref|XP_002463468.1| hypothetical protein SORBIDRAFT... 411 1e-112
gi|226493235|ref|NP_001148093.1| LOC100281701 [Zea mays] 411 2e-112
gi|219886233|gb|ACL53491.1| unknown [Zea mays] 411 2e-112
gi|115488160|ref|NP_001066567.1| Os12g0277500 [Oryza sativa Japo... 410 3e-112
>gi|1351030|sp|P21239.2|RUB1_BRANA RecName: Full=RuBisCO large subunit-binding
protein subunit alpha, chloroplastic; AltName: Full=60 kDa chaperonin
subunit alpha; AltName: Full=CPN-60 alpha; Flags: Precursor
Length = 546
Score = 474 bits (1218), Expect = 2e-131
Identities = 251/260 (96%), Positives = 254/260 (97%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL
Sbjct: 287 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 346
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QARISQLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKL+GGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 347 QARISQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLAGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 406
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKE EDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI
Sbjct: 407 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 466
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKIMFSEWE+GYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 467 EGEVVVEKIMFSEWEIGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 526
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VVDKPKPKA AA P+GLMV
Sbjct: 527 VVDKPKPKAPTAAPPQGLMV 546
>gi|15226314|ref|NP_180367.1| chaperonin-60alpha [Arabidopsis thaliana]
Length = 586
Score = 469 bits (1206), Expect = 5e-130
Identities = 247/260 (95%), Positives = 253/260 (97%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKAMLQDIAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL
Sbjct: 327 ERRKAMLQDIAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 386
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QARI+QLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 387 QARIAQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 446
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALIAQNAG+
Sbjct: 447 TFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALIAQNAGV 506
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKIMFS+WE GYNAMTDTYENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 507 EGEVVVEKIMFSDWENGYNAMTDTYENLFEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 566
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VVDKPKPKA AAAAPEGLMV
Sbjct: 567 VVDKPKPKAPAAAAPEGLMV 586
>gi|21554572|gb|AAM63618.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Arabidopsis thaliana]
Length = 586
Score = 469 bits (1206), Expect = 5e-130
Identities = 247/260 (95%), Positives = 253/260 (97%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKAMLQDIAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL
Sbjct: 327 ERRKAMLQDIAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 386
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QARI+QLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 387 QARIAQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 446
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALIAQNAG+
Sbjct: 447 TFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALIAQNAGV 506
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKIMFS+WE GYNAMTDTYENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 507 EGEVVVEKIMFSDWENGYNAMTDTYENLFEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 566
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VVDKPKPKA AAAAPEGLMV
Sbjct: 567 VVDKPKPKAPAAAAPEGLMV 586
>gi|62321579|dbj|BAD95121.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Arabidopsis thaliana]
Length = 333
Score = 466 bits (1199), Expect = 3e-129
Identities = 246/260 (94%), Positives = 252/260 (96%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKAMLQDIAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL
Sbjct: 74 ERRKAMLQDIAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 133
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QARI+QLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 134 QARIAQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 193
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALIAQNAG+
Sbjct: 194 TFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALIAQNAGV 253
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKIMFS+WE GYNAMTDTYENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 254 EGEVVVEKIMFSDWENGYNAMTDTYENLFEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 313
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VV KPKPKA AAAAPEGLMV
Sbjct: 314 VVGKPKPKAPAAAAPEGLMV 333
>gi|297826149|ref|XP_002880957.1| CPN60A [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata]
Length = 587
Score = 466 bits (1199), Expect = 3e-129
Identities = 249/261 (95%), Positives = 254/261 (97%), Gaps = 1/261 (0%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKAMLQDIAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL
Sbjct: 327 ERRKAMLQDIAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 386
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QARI+QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 387 QARIAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 446
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALIAQNAG+
Sbjct: 447 TFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALIAQNAGV 506
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKIMFSEWE GYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 507 EGEVVVEKIMFSEWEQGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 566
Query: 950 VVDKPKPKA-AAAAAPEGLMV 1009
VVDKPKPKA AAAAAPEGLMV
Sbjct: 567 VVDKPKPKAPAAAAAPEGLMV 587
>gi|1710807|sp|P08926.2|RUBA_PEA RecName: Full=RuBisCO large subunit-binding
protein subunit alpha, chloroplastic; AltName: Full=60 kDa chaperonin
subunit alpha; AltName: Full=CPN-60 alpha; Flags: Precursor
Length = 587
Score = 444 bits (1140), Expect = 2e-122
Identities = 230/260 (88%), Positives = 247/260 (95%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAILTGAE+QA D+GLLVENTTI+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDEL
Sbjct: 328 ERRKALLQDIAILTGAEFQASDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDEL 387
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
Q+R++QLKKEL ETDS+YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 388 QSRVAQLKKELSETDSIYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 447
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI
Sbjct: 448 TFAAIEEGIVPGGGTALVHLSGYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 507
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 508 EGEVVVEKIKNGEWEVGYNAMTDTYENLVESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 567
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VV+KPKPKAA AAAP+GL +
Sbjct: 568 VVEKPKPKAAVAAAPQGLTI 587
>gi|224104681|ref|XP_002313525.1| predicted protein [Populus trichocarpa]
Length = 586
Score = 438 bits (1126), Expect = 9e-121
Identities = 228/260 (87%), Positives = 247/260 (95%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKAMLQDIAILTGAE+QA D+GL +ENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDEL
Sbjct: 327 ERRKAMLQDIAILTGAEFQASDLGLSIENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDEL 386
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QARI+QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 387 QARIAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 446
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGGA LVHLST +PAIKE +DADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGI
Sbjct: 447 TFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTHVPAIKEKIKDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGI 506
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEK+ SEWE+GYNAMTD YENL+EAGVIDPAKVTRCALQN+ASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 507 EGEVVVEKLKESEWEMGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNSASVAGMVLTTQAI 566
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VV+KPKP+ AAA+P+GL V
Sbjct: 567 VVEKPKPRTPAAASPQGLTV 586
>gi|84468442|dbj|BAE71304.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 461
Score = 438 bits (1125), Expect = 1e-120
Identities = 227/260 (87%), Positives = 244/260 (93%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDEL
Sbjct: 202 ERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDEL 261
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
Q+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 262 QSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 321
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGI
Sbjct: 322 TFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGI 381
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 382 EGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 441
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VV+KPKP+A AP+GL V
Sbjct: 442 VVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 461
>gi|84468296|dbj|BAE71231.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 588
Score = 438 bits (1125), Expect = 1e-120
Identities = 227/260 (87%), Positives = 244/260 (93%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDEL
Sbjct: 329 ERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDEL 388
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
Q+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 389 QSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 448
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGI
Sbjct: 449 TFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGI 508
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 509 EGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 568
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VV+KPKP+A AP+GL V
Sbjct: 569 VVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 588
>gi|84468456|dbj|BAE71311.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 588
Score = 438 bits (1125), Expect = 1e-120
Identities = 227/260 (87%), Positives = 244/260 (93%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDEL
Sbjct: 329 ERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDEL 388
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
Q+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 389 QSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 448
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGI
Sbjct: 449 TFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGI 508
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 509 EGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 568
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VV+KPKP+A AP+GL V
Sbjct: 569 VVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 588
>gi|84468288|dbj|BAE71227.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 578
Score = 438 bits (1125), Expect = 1e-120
Identities = 227/260 (87%), Positives = 244/260 (93%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDEL
Sbjct: 319 ERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDEL 378
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
Q+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 379 QSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 438
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGI
Sbjct: 439 TFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGI 498
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 499 EGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 558
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VV+KPKP+A AP+GL V
Sbjct: 559 VVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 578
>gi|84468438|dbj|BAE71302.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 588
Score = 436 bits (1120), Expect = 4e-120
Identities = 226/260 (86%), Positives = 243/260 (93%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDEL
Sbjct: 329 ERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDEL 388
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
Q+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 389 QSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 448
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGI
Sbjct: 449 TFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGI 508
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQA
Sbjct: 509 EGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAT 568
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VV+KPKP+A AP+GL V
Sbjct: 569 VVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 588
>gi|224132004|ref|XP_002328161.1| predicted protein [Populus trichocarpa]
Length = 587
Score = 436 bits (1119), Expect = 6e-120
Identities = 226/257 (87%), Positives = 244/257 (94%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKAMLQDIAILTGAE+QA D+GL +ENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDEL
Sbjct: 327 ERRKAMLQDIAILTGAEFQASDLGLSIENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDEL 386
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QARI+QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 387 QARIAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 446
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGGA LVHLST +PAIK+ EDADERLGADIVQKALV+PA+LIAQNAGI
Sbjct: 447 TFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTCVPAIKDKIEDADERLGADIVQKALVSPASLIAQNAGI 506
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEK+ SEWE+GYNAMTD YENL+EAGVIDPAKVTRCALQN+ASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 507 EGEVVVEKLKASEWEIGYNAMTDKYENLMEAGVIDPAKVTRCALQNSASVAGMVLTTQAI 566
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEG 1000
VV+KPKPK AAAA +G
Sbjct: 567 VVEKPKPKTPAAAATQG 583
>gi|217074850|gb|ACJ85785.1| unknown [Medicago truncatula]
Length = 587
Score = 434 bits (1116), Expect = 1e-119
Identities = 227/260 (87%), Positives = 244/260 (93%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAILTGAE+QA D+GLLVE+T I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADAASKDEL
Sbjct: 328 ERRKALLQDIAILTGAEFQASDLGLLVESTPIEQLGLARKVTISKDSTTIIADAASKDEL 387
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
Q+R++QLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 388 QSRVAQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 447
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGI PGGG LVHL +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LIAQNAGI
Sbjct: 448 TFAAIEEGIAPGGGTALVHLFAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAQNAGI 507
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E GVIDPAKVTR ALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 508 EGEVVVEKIRSGEWEVGYNAMTDTYENLIEFGVIDPAKVTRRALQNAASVAGMVLTTQAI 567
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VV+KPKP+AAAAAAP+GL V
Sbjct: 568 VVEKPKPRAAAAAAPQGLTV 587
>gi|225436538|ref|XP_002277357.1| PREDICTED: hypothetical protein [Vitis
vinifera]
Length = 585
Score = 424 bits (1089), Expect = 2e-116
Identities = 217/260 (83%), Positives = 241/260 (92%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAI+TGAE+QA D+GLL+ENT+++QLG+ARKVTI+KDSTT+IADAASKDE+
Sbjct: 326 ERRKALLQDIAIMTGAEFQANDLGLLIENTSVEQLGLARKVTITKDSTTIIADAASKDEI 385
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QARI+Q+KKEL ETDSVYD+EKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 386 QARIAQIKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 445
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGGA VHLST +PAIK+ EDADERLGADIVQKALVAPA+LIA NAG+
Sbjct: 446 TFAAIEEGIVPGGGAAFVHLSTYVPAIKDKLEDADERLGADIVQKALVAPASLIAHNAGV 505
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKI EW +GYNAMTD YENL+EAGVIDPAKV RCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 506 EGEVVVEKIKACEWAVGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVARCALQNAASVAGMVLTTQAI 565
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 1009
VV+K KPKA AA P+GL +
Sbjct: 566 VVEKAKPKAPVAAPPQGLTI 585
>gi|134102|sp|P08823.1|RUBA_WHEAT RecName: Full=RuBisCO large subunit-binding
protein subunit alpha, chloroplastic; AltName: Full=60 kDa chaperonin
subunit alpha; AltName: Full=CPN-60 alpha; Flags: Precursor
Length = 543
Score = 412 bits (1058), Expect = 7e-113
Identities = 211/257 (82%), Positives = 233/257 (90%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAI+TGAEY A D+GLLVEN T+DQLG ARK+TI + +TTLIADAASKDE+
Sbjct: 283 ERRKAVLQDIAIVTGAEYLAKDLGLLVENATVDQLGTARKITIHQTTTTLIADAASKDEI 342
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QAR++QLKKEL ETDS+YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGA TETELEDR+LRIEDAKNA
Sbjct: 343 QARVAQLKKELSETDSIYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGATTETELEDRQLRIEDAKNA 402
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGGA VHLST +PAIKET ED DERLGADI+QKAL APA+LIA NAG+
Sbjct: 403 TFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSTYVPAIKETIEDHDERLGADIIQKALQAPASLIANNAGV 462
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVV+EKI SEWE+GYNAMTD YENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASV+GMVLTTQAI
Sbjct: 463 EGEVVIEKIKESEWEMGYNAMTDKYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVSGMVLTTQAI 522
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEG 1000
VV+KPKPK A EG
Sbjct: 523 VVEKPKPKPKVAEPAEG 539
>gi|242032147|ref|XP_002463468.1| hypothetical protein SORBIDRAFT_01g000380
[Sorghum bicolor]
Length = 580
Score = 411 bits (1056), Expect = 1e-112
Identities = 211/255 (82%), Positives = 235/255 (92%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAI+TGAEYQ+ D+GLLVENTT++QLGIARKVTIS STT+IADAASKD++
Sbjct: 326 ERRKALLQDIAIVTGAEYQSKDLGLLVENTTVEQLGIARKVTISSSSTTIIADAASKDDI 385
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGA+TE ELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 386 QARIAQLKRELSQTDSAYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGASTEAELEDRKLRIEDAKNA 445
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGGA VHLST +PAIKET +D +ERLGADI+QKALVAPAALIA NAG+
Sbjct: 446 TFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSTFVPAIKETLDDPEERLGADIIQKALVAPAALIAHNAGV 505
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEV+V+KI SEWE GYNAM D +ENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 506 EGEVIVDKIRESEWEFGYNAMADKHENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 565
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAP 994
VV+KP+ AAAAAP
Sbjct: 566 VVEKPQKAPAAAAAP 580
>gi|226493235|ref|NP_001148093.1| LOC100281701 [Zea mays]
Length = 584
Score = 411 bits (1054), Expect = 2e-112
Identities = 212/257 (82%), Positives = 237/257 (92%), Gaps = 2/257 (0%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAI+TGAEYQ+ D+GLLVE+TT++QLGIARKVTIS STT+IADAASKD++
Sbjct: 328 ERRKALLQDIAIVTGAEYQSKDLGLLVEDTTVEQLGIARKVTISSSSTTIIADAASKDDI 387
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAV+KVGA+TE ELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 388 QARIAQLKRELSQTDSTYDSEKLAERIAKLSGGVAVVKVGASTEAELEDRKLRIEDAKNA 447
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGGA VHLST +PAIKET +D +ERLGADI+QKALVAPAALIA NAG+
Sbjct: 448 TFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSTFVPAIKETLDDPEERLGADIIQKALVAPAALIAHNAGV 507
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEV+V+KI SEWE GYNAM D +ENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 508 EGEVIVDKIRESEWEFGYNAMADKHENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 567
Query: 950 VVDKPK--PKAAAAAAP 994
VV+KPK P AAAAAAP
Sbjct: 568 VVEKPKKAPAAAAAAAP 584
>gi|219886233|gb|ACL53491.1| unknown [Zea mays]
Length = 474
Score = 411 bits (1054), Expect = 2e-112
Identities = 212/257 (82%), Positives = 237/257 (92%), Gaps = 2/257 (0%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAI+TGAEYQ+ D+GLLVE+TT++QLGIARKVTIS STT+IADAASKD++
Sbjct: 218 ERRKALLQDIAIVTGAEYQSKDLGLLVEDTTVEQLGIARKVTISSSSTTIIADAASKDDI 277
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAV+KVGA+TE ELEDRKLRIEDAKNA
Sbjct: 278 QARIAQLKRELSQTDSTYDSEKLAERIAKLSGGVAVVKVGASTEAELEDRKLRIEDAKNA 337
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGGA VHLST +PAIKET +D +ERLGADI+QKALVAPAALIA NAG+
Sbjct: 338 TFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSTFVPAIKETLDDPEERLGADIIQKALVAPAALIAHNAGV 397
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEV+V+KI SEWE GYNAM D +ENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 398 EGEVIVDKIRESEWEFGYNAMADKHENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 457
Query: 950 VVDKPK--PKAAAAAAP 994
VV+KPK P AAAAAAP
Sbjct: 458 VVEKPKKAPAAAAAAAP 474
>gi|115488160|ref|NP_001066567.1| Os12g0277500 [Oryza sativa Japonica Group]
Length = 578
Score = 410 bits (1052), Expect = 3e-112
Identities = 212/259 (81%), Positives = 233/259 (89%)
Frame = +2
Query: 230 ERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADAASKDEL 409
ERRKA+LQDIAI+TGAE+ A D+GLLVEN T +QLG ARKVTI + +TTLIADAASKDE+
Sbjct: 318 ERRKAVLQDIAIVTGAEFLAKDLGLLVENATEEQLGTARKVTIHQTTTTLIADAASKDEI 377
Query: 410 QARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRIEDAKNA 589
QAR++QLKKEL ETDS+YD+EKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDR+LRIEDAKNA
Sbjct: 378 QARVAQLKKELSETDSIYDTEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRQLRIEDAKNA 437
Query: 590 TFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALIAQNAGI 769
TFAAIEEGIVPGGG VHLST +PAIKET ED DERLGADI+QKALVAPA+LIA NAG+
Sbjct: 438 TFAAIEEGIVPGGGTAYVHLSTTVPAIKETIEDHDERLGADIIQKALVAPASLIAHNAGV 497
Query: 770 EGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 949
EGEVVVEKI EWE+GYNAM D YENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI
Sbjct: 498 EGEVVVEKIKDGEWEVGYNAMNDKYENLIEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMVLTTQAI 557
Query: 950 VVDKPKPKAAAAAAPEGLM 1006
VV+KPKPKA A EG +
Sbjct: 558 VVEKPKPKAPVAEPAEGTL 576
Database: GenBank nr
Posted date: Thu Sep 08 23:06:31 2011
Number of letters in database: 5,219,829,378
Number of sequences in database: 15,229,318
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Gapped
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Matrix: blosum62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 1,687,995,622,555
Number of Sequences: 15229318
Number of Extensions: 1687995622555
Number of Successful Extensions: 433925934
Number of sequences better than 0.0: 0
|
