BLASTX 7.6.2
Query= UN26600 /QuerySize=1658
(1657 letters)
Database: UniProt/SwissProt;
518,415 sequences; 182,829,261 total letters
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
sp|Q9ZT42|RHF2A_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A OS=Arabi... 601 5e-171
sp|Q4TU14|RHF1A_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A OS=Arabi... 119 1e-025
sp|Q75JC9|Y8484_DICDI Uncharacterized protein DDB_G0271670 OS=Di... 64 2e-009
>sp|Q9ZT42|RHF2A_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A OS=Arabidopsis thaliana
GN=RHF2A PE=2 SV=1
Length = 375
Score = 601 bits (1549), Expect = 5e-171
Identities = 315/380 (82%), Positives = 330/380 (86%), Gaps = 16/380 (4%)
Frame = -3
Query: 1487 VEDTTTTTTSEGNMISAAAFVEGGIQEACDDACSICLDPFCDSDPSTLTSCKHEYHLQCI 1308
+E TTTSEG++ SAAAFVEGGIQ+ACDDACSICL+ FC+SDPSTLTSCKHEYHLQCI
Sbjct: 1 MEGAGETTTSEGHLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLESFCESDPSTLTSCKHEYHLQCI 60
Query: 1307 LEWCQRSSQCPMCWQSISLKDPTGHELLEAVVQERNLRFNPSRNATIFRHPTLGDFELQH 1128
LEWCQRSSQCPMCWQSISLKDPT ELLEAV QERN RFNP+RNATIFRHPTLGDFELQH
Sbjct: 61 LEWCQRSSQCPMCWQSISLKDPTSQELLEAVEQERNFRFNPTRNATIFRHPTLGDFELQH 120
Query: 1127 LPAGVDNAEIEERIIQHLAAAAAMGRARHGTRREGHRSRSSSTQGGHPQFMVFSPPP--- 957
LP GVDNAEIEERIIQHLAAAAAMGRARHG RREGHRSRSSS GH QFMVFS P
Sbjct: 121 LPVGVDNAEIEERIIQHLAAAAAMGRARHGVRREGHRSRSSSQ--GHQQFMVFSSQPNAS 178
Query: 956 -PSPPPPMLSSPSQRDESDTVTNLAHNASVGEGSLQSNMQPPAAASSHPRQVSPSASDSN 780
P P PPM SSPSQRDESDTV+NL HNA +GEGS QSN QPP SSHPRQVSPSASDSN
Sbjct: 179 SPPPHPPMPSSPSQRDESDTVSNLPHNA-LGEGSHQSNTQPP--TSSHPRQVSPSASDSN 235
Query: 779 SRSPNQSSPSDQDRAGPSELQSFSESLKSRLTSVSTRYKESITKNTRNWKDRFFSRNTSM 600
SR NQSSPS+QDRAGPSELQSFSESLKSRL +VSTRYKESI+KNTRNWKDR FSRNTSM
Sbjct: 236 SRPLNQSSPSEQDRAGPSELQSFSESLKSRLNAVSTRYKESISKNTRNWKDRLFSRNTSM 295
Query: 599 AELGSEVKREVSAGIATVSRMMERLETRENTSSSSRPGTASVSSSNGSENQTPAETNNER 420
A+LGSEVKREVSAGIATVSRMMERLETREN SRP TASV S+ SEN TP ETNNE
Sbjct: 296 ADLGSEVKREVSAGIATVSRMMERLETREN----SRPSTASV--SDVSENHTP-ETNNEH 348
Query: 419 NRSEAGDEHSSNERGVKGTC 360
NR+ AGDEHS NERGVK TC
Sbjct: 349 NRAAAGDEHSVNERGVKETC 368
>sp|Q4TU14|RHF1A_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A OS=Arabidopsis thaliana
GN=RHF1A PE=1 SV=1
Length = 371
Score = 119 bits (296), Expect = 1e-025
Identities = 61/128 (47%), Positives = 80/128 (62%), Gaps = 3/128 (2%)
Frame = -3
Query: 1442 SAAAFVEGGIQEACDDACSICLDPFCDSDPSTLTSCKHEYHLQCILEWCQRSSQCPMCWQ 1263
S+A V DDACSICL+PF DPST+TSCKHEYHLQCI+EW QRS +CP+CWQ
Sbjct: 29 SSALVVASDDDNNTDDACSICLEPFTLQDPSTVTSCKHEYHLQCIIEWSQRSKECPICWQ 88
Query: 1262 SISLKDPTGHELLEAVVQERNLRF-NPSRNATIFRHPTLGDFELQHLPAGVDNAEIEERI 1086
L+DP ELL AV +ER L+ N S ++ I H + DF + + + +E+
Sbjct: 89 LFVLRDPASQELLAAVEKERLLKTRNISSSSPISIHHSHDDFHSEEEES--QFSSFDEQF 146
Query: 1085 IQHLAAAA 1062
++HL AA
Sbjct: 147 LRHLTEAA 154
Score = 85 bits (209), Expect = 1e-015
Identities = 65/200 (32%), Positives = 104/200 (52%), Gaps = 12/200 (6%)
Frame = -3
Query: 932 SSPSQRDESDTVTNLAHNASVGEGSLQSNMQPPAAASSHPRQVS-----PSASDSNSRSP 768
S P+ +D V NL +++ Q++ P+ S P VS P+ S++ SR
Sbjct: 175 SDPTTIHPTDLV-NLYRLSAISHVEHQNSNPCPSPGSMTPSPVSGHSSIPADSNNGSRIS 233
Query: 767 NQSSPSDQDRAGPS-ELQSFSESLKSRLTSVSTRYKESITKNTRNWKDRFFSRNTSMAEL 591
SPS ++ S E S E++KS+L + S +YKESI+K+ + K++ +RN S+ EL
Sbjct: 234 PGPSPSRSSQSPKSPEASSLPEAIKSKLAAASAKYKESISKSKQGLKEKLLARNNSVKEL 293
Query: 590 GSEVKREVSAGIATVSRMMERLE---TRENTSSSSRPGTASVSSSNGSENQTPAETNNER 420
V+RE++AGIA V+RM+ER++ R S+ TA+ S N S E N++
Sbjct: 294 SKGVQREMNAGIAGVARMIERMDFSSKRFGGSAHVSTSTATASGFNFSFKGKRVEANSKS 353
Query: 419 NRSEAGDEHSSNERGVKGTC 360
N + GD+ + TC
Sbjct: 354 NNN--GDKTEPQKLQGGETC 371
>sp|Q75JC9|Y8484_DICDI Uncharacterized protein DDB_G0271670 OS=Dictyostelium
discoideum GN=DDB_G0271670 PE=4 SV=1
Length = 374
Score = 64 bits (155), Expect = 2e-009
Identities = 54/233 (23%), Positives = 99/233 (42%)
Frame = -3
Query: 1037 TRREGHRSRSSSTQGGHPQFMVFSPPPPSPPPPMLSSPSQRDESDTVTNLAHNASVGEGS 858
T S SSS+ S S SS S S + ++ + ++S S
Sbjct: 65 TSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 124
Query: 857 LQSNMQPPAAASSHPRQVSPSASDSNSRSPNQSSPSDQDRAGPSELQSFSESLKSRLTSV 678
S+ +++SS S S+S S+S S + SS S + S S S S S +S
Sbjct: 125 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 184
Query: 677 STRYKESITKNTRNWKDRFFSRNTSMAELGSEVKREVSAGIATVSRMMERLETRENTSSS 498
S+ S + ++ + S ++S + S S+ ++ S + ++SSS
Sbjct: 185 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 244
Query: 497 SRPGTASVSSSNGSENQTPAETNNERNRSEAGDEHSSNERGVKGTCAAGSSSS 339
S ++S SSS+ S + + + +++ + S + SS+ + ++ SSSS
Sbjct: 245 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 297
Score = 64 bits (154), Expect = 3e-009
Identities = 53/226 (23%), Positives = 98/226 (43%)
Frame = -3
Query: 1016 SRSSSTQGGHPQFMVFSPPPPSPPPPMLSSPSQRDESDTVTNLAHNASVGEGSLQSNMQP 837
S SSS+ S S SS S S + ++ + ++S S S+
Sbjct: 66 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 125
Query: 836 PAAASSHPRQVSPSASDSNSRSPNQSSPSDQDRAGPSELQSFSESLKSRLTSVSTRYKES 657
+++SS S S+S S+S S + SS S + S S S S S +S S+ S
Sbjct: 126 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 185
Query: 656 ITKNTRNWKDRFFSRNTSMAELGSEVKREVSAGIATVSRMMERLETRENTSSSSRPGTAS 477
+ ++ + S ++S + S S+ ++ S + ++SSSS ++S
Sbjct: 186 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 245
Query: 476 VSSSNGSENQTPAETNNERNRSEAGDEHSSNERGVKGTCAAGSSSS 339
SSS+ S + + + +++ + S + SS+ + ++ SSSS
Sbjct: 246 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 291
Score = 62 bits (150), Expect = 8e-009
Identities = 47/198 (23%), Positives = 91/198 (45%)
Frame = -3
Query: 932 SSPSQRDESDTVTNLAHNASVGEGSLQSNMQPPAAASSHPRQVSPSASDSNSRSPNQSSP 753
SS S S + ++ + ++S S S+ +++SS S S+S S+S S + SS
Sbjct: 66 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 125
Query: 752 SDQDRAGPSELQSFSESLKSRLTSVSTRYKESITKNTRNWKDRFFSRNTSMAELGSEVKR 573
S + S S S S S +S S+ S + ++ + S ++S + S
Sbjct: 126 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 185
Query: 572 EVSAGIATVSRMMERLETRENTSSSSRPGTASVSSSNGSENQTPAETNNERNRSEAGDEH 393
S+ ++ S + ++SSSS ++S SSS+ S + + + +++ + S +
Sbjct: 186 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 245
Query: 392 SSNERGVKGTCAAGSSSS 339
SS+ + ++ SSSS
Sbjct: 246 SSSSSSSSSSSSSSSSSS 263
Database: UniProt/SwissProt
Posted date: Sat Aug 07 14:36:18 2010
Number of letters in database: 182,829,261
Number of sequences in database: 518,415
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Gapped
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Matrix: blosum62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 109,753,696,895
Number of Sequences: 518415
Number of Extensions: 109753696895
Number of Successful Extensions: 688305551
Number of sequences better than 0.0: 0
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