Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

SwissProt blast output of UN30429


BLASTX 7.6.2

Query= UN30429 /QuerySize=1161
        (1160 letters)

Database: UniProt/SwissProt;
          518,415 sequences; 182,829,261 total letters
                                                                  Score    E
Sequences producing significant alignments:                       (bits) Value

sp|Q6S6W0|GP2_EHV1V Glycoprotein gp2 OS=Equine herpesvirus 1 (st...     75   6e-013
sp|P28968|GP2_EHV1B Glycoprotein gp2 OS=Equine herpesvirus 1 (st...     74   2e-012
sp|Q05049|MUC1_XENLA Integumentary mucin C.1 (Fragment) OS=Xenop...     64   2e-009

>sp|Q6S6W0|GP2_EHV1V Glycoprotein gp2 OS=Equine herpesvirus 1 (strain V592)
        GN=71 PE=3 SV=1

          Length = 866

 Score =  75 bits (184), Expect = 6e-013
 Identities = 45/102 (44%), Positives = 62/102 (60%), Gaps = 1/102 (0%)
 Frame = +2

Query:  23 TTTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTA-TSPAPAFGFTTSTS 199
           TTT  TTT+ +T AAT+  +++ AA+TT   +    ++AA TT A TS A     T+ST+
Sbjct: 194 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTSSATTAATTSSTT 253

Query: 200 AAATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVAAPLA 325
            AATTT A   AA+TTA TT  +   A+T+  +TTT A   A
Sbjct: 254 TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 295


 Score =  74 bits (181), Expect = 1e-012
 Identities = 44/106 (41%), Positives = 61/106 (57%), Gaps = 3/106 (2%)
 Frame = +2

Query:  17 TTT---TTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPAPAFGFT 187
           TTT   TT  TTT+ +T A+TSA +++A A+ T+ P+    +S   TT  T+       T
Sbjct: 122 TTTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPTTASTT 181

Query: 188 TSTSAAATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVAAPLA 325
           T T+ AATTT A   AA+TTA TT  +   A+T+  +TTT A   A
Sbjct: 182 TDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 227


 Score =  74 bits (180), Expect = 2e-012
 Identities = 50/118 (42%), Positives = 68/118 (57%), Gaps = 4/118 (3%)
 Frame = +2

Query:   2 TVLYCTTTTTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPAPAFG 181
           T    T  TTT  TTS +T AAT++ S++ AA+TT   +    ++AA TT AT+ A    
Sbjct: 226 TAATTTAATTTAATTSSATTAATTS-STTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAAT-- 282

Query: 182 FTTSTSAAATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVAAPLAGAPKLPSEIT 355
            T +T+ AATTT A   AA+TTA TT  +   A+T+ T+ TT AA   G+P   S  T
Sbjct: 283 TTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT-TAATTTAATTTGSPTSGSTST 339


 Score =  74 bits (180), Expect = 2e-012
 Identities = 49/118 (41%), Positives = 68/118 (57%), Gaps = 5/118 (4%)
 Frame = +2

Query:  17 TTTTTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPAPAFGFTTST 196
           T+TTTTT TT+  T A+T+   ++ AA+TT   +    ++AA TT AT+ A     T +T
Sbjct: 163 TSTTTTTATTTVPTTASTTT-DTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAAT--TTAAT 219

Query: 197 SAAATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTST--TTVAAPLAGAPKLPSEITGKT 364
           + AATTT A   AA+TTA TT ++   A+TS T+T  TT AA    A    +  T  T
Sbjct: 220 TTAATTTAATTTAATTTAATTSSATTAATTSSTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAAT 277


 Score =  74 bits (180), Expect = 2e-012
 Identities = 47/132 (35%), Positives = 68/132 (51%), Gaps = 1/132 (0%)
 Frame = +2

Query:  23 TTTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPAPAFGFTT-STS 199
           TTT  TTT+ +T AAT+  +++ AA+TT   +    ++AA T++AT+ A     TT +T+
Sbjct: 199 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTSSATTAATTSSTTTAATT 258

Query: 200 AAATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVAAPLAGAPKLPSEITGKTVEEII 379
            AATTT A   AA+TTA TT  +   A+T+  +TTT A   A      +     T     
Sbjct: 259 TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 318

Query: 380 KEWNTELEERTG 415
               T     TG
Sbjct: 319 TAATTTAATTTG 330


 Score =  72 bits (174), Expect = 9e-012
 Identities = 41/102 (40%), Positives = 57/102 (55%)
 Frame = +2

Query:  20 TTTTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPAPAFGFTTSTS 199
           TTT  TTT + +T A T+A +++AA +T    +    SSA    T +S   A   T +T+
Sbjct: 204 TTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTSSATTAATTSSTTTAATTTAATT 263

Query: 200 AAATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVAAPLA 325
            AATTT A   AA+TTA TT  +   A+T+  +TTT A   A
Sbjct: 264 TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 305


 Score =  71 bits (172), Expect = 2e-011
 Identities = 49/120 (40%), Positives = 69/120 (57%), Gaps = 6/120 (5%)
 Frame = +2

Query:  20 TTTTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAA--ASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPA---PAFGF 184
           TTT  TTT + +T A T+A ++S+A  A+TT+  +    ++AA TT AT+ A    A   
Sbjct: 219 TTTAATTTAATTTAATTTAATTSSATTAATTSSTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT 278

Query: 185 TTSTSAAATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVAAPLAGAPKLPSEITGKT 364
           T +T+ AATTT A   AA+TTA TT  +   A+T+ T+ TT AA    A    S  +G T
Sbjct: 279 TAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATT-TAATTTAATTTAATTTGSPTSGST 337


 Score =  69 bits (167), Expect = 6e-011
 Identities = 43/105 (40%), Positives = 60/105 (57%), Gaps = 5/105 (4%)
 Frame = +2

Query:  17 TTTTTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPAPAFGFTTST 196
           T TTTTT T S +TP  T+A  ++AA +T    +    S++A TTTAT+ A +   TT+ 
Sbjct: 106 TETTTTTPTASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTA---ASTSAETTTATATATSTPTTTTP 162

Query: 197 SAAATT--TFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVAAPLA 325
           ++  TT  T  VP  ASTT  TT  +   A+T+  +TTT A   A
Sbjct: 163 TSTTTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 207


 Score =  67 bits (163), Expect = 2e-010
 Identities = 42/106 (39%), Positives = 60/106 (56%), Gaps = 3/106 (2%)
 Frame = +2

Query:  17 TTTTTTTT---TTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPAPAFGFT 187
           TTT TTTT   TT+ +T A T+A S+SA  +T T  +    ++   T+T T+ A     T
Sbjct: 117 TTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPT 176

Query: 188 TSTSAAATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVAAPLA 325
           T+++   TTT A   AA+TTA TT  +   A+T+  +TTT A   A
Sbjct: 177 TASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 222


 Score =  65 bits (157), Expect = 8e-010
 Identities = 43/124 (34%), Positives = 67/124 (54%), Gaps = 8/124 (6%)
 Frame = +2

Query:  17 TTTTTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPS-----FGVGSSAANTTTATSPAPAFG 181
           TT+++  T+T  S+P++TS  SSS AA++++ PS       + +S +  TT T+P  +  
Sbjct:  59 TTSSSPPTSTHTSSPSSTSTQSSSTAATSSSAPSTASSTTSIPTSTSTETTTTTPTASTT 118

Query: 182 FTTSTSAA---ATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVAAPLAGAPKLPSEI 352
             T+T+AA   A TT AV  AAST+A TT  +    ST  T+T T          +P+  
Sbjct: 119 TPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPTTA 178

Query: 353 TGKT 364
           +  T
Sbjct: 179 STTT 182

>sp|P28968|GP2_EHV1B Glycoprotein gp2 OS=Equine herpesvirus 1 (strain Ab4p)
        GN=EUs4 PE=4 SV=1

          Length = 797

 Score =  74 bits (179), Expect = 2e-012
 Identities = 43/102 (42%), Positives = 60/102 (58%), Gaps = 3/102 (2%)
 Frame = +2

Query:  17 TTT---TTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPAPAFGFT 187
           TTT   TT  TTT+ +T A+TSA +++A A+ T+ P+    +S   TT  T+       T
Sbjct: 122 TTTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPTTASTT 181

Query: 188 TSTSAAATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVA 313
           T T+ AATTT A   AA+TTA TT  +   A+T+  +TTT A
Sbjct: 182 TDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAA 223


 Score =  72 bits (174), Expect = 9e-012
 Identities = 48/119 (40%), Positives = 64/119 (53%), Gaps = 6/119 (5%)
 Frame = +2

Query:  17 TTTTTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPA---PAFGFT 187
           T T+T TTTT  ST   T+  +    ASTTT  +    ++AA TT AT+ A    A   T
Sbjct: 152 TATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTT 211

Query: 188 TSTSAAATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSG---TSTTTVAAPLAGAPKLPSEIT 355
            +T+ AATTT A   +A+T ATTT  +   A+T+    T+ TT AA   G+P   S  T
Sbjct: 212 AATTTAATTTAATTSSATTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTGSPTSGSTST 270


 Score =  69 bits (167), Expect = 6e-011
 Identities = 43/105 (40%), Positives = 60/105 (57%), Gaps = 5/105 (4%)
 Frame = +2

Query:  17 TTTTTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPAPAFGFTTST 196
           T TTTTT T S +TP  T+A  ++AA +T    +    S++A TTTAT+ A +   TT+ 
Sbjct: 106 TETTTTTPTASTTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTA---ASTSAETTTATATATSTPTTTTP 162

Query: 197 SAAATT--TFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVAAPLA 325
           ++  TT  T  VP  ASTT  TT  +   A+T+  +TTT A   A
Sbjct: 163 TSTTTTTATTTVPTTASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 207


 Score =  67 bits (163), Expect = 2e-010
 Identities = 42/106 (39%), Positives = 60/106 (56%), Gaps = 3/106 (2%)
 Frame = +2

Query:  17 TTTTTTTT---TTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPAPAFGFT 187
           TTT TTTT   TT+ +T A T+A S+SA  +T T  +    ++   T+T T+ A     T
Sbjct: 117 TTTPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPT 176

Query: 188 TSTSAAATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVAAPLA 325
           T+++   TTT A   AA+TTA TT  +   A+T+  +TTT A   A
Sbjct: 177 TASTTTDTTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTA 222


 Score =  65 bits (157), Expect = 8e-010
 Identities = 43/124 (34%), Positives = 67/124 (54%), Gaps = 8/124 (6%)
 Frame = +2

Query:  17 TTTTTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPS-----FGVGSSAANTTTATSPAPAFG 181
           TT+++  T+T  S+P++TS  SSS AA++++ PS       + +S +  TT T+P  +  
Sbjct:  59 TTSSSPPTSTHTSSPSSTSTQSSSTAATSSSAPSTASSTTSIPTSTSTETTTTTPTASTT 118

Query: 182 FTTSTSAA---ATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTTVAAPLAGAPKLPSEI 352
             T+T+AA   A TT AV  AAST+A TT  +    ST  T+T T          +P+  
Sbjct: 119 TPTTTTAAPTTAATTTAVTTAASTSAETTTATATATSTPTTTTPTSTTTTTATTTVPTTA 178

Query: 353 TGKT 364
           +  T
Sbjct: 179 STTT 182

>sp|Q05049|MUC1_XENLA Integumentary mucin C.1 (Fragment) OS=Xenopus laevis PE=2
        SV=1

          Length = 662

 Score =  64 bits (154), Expect = 2e-009
 Identities = 34/97 (35%), Positives = 47/97 (48%)
 Frame = +2

Query:  17 TTTTTTTTTTSFSTPAATSAPSSSAAASTTTFPSFGVGSSAANTTTATSPAPAFGFTTST 196
           TTT TTTTTT  +T   T+   ++    TTT P+     +   T T T+  P    T +T
Sbjct: 423 TTTPTTTTTTPTTTTTTTTTTKATTTTPTTTTPTTTTTKATTTTPTTTTTTPTTTTTKAT 482

Query: 197 SAAATTTFAVPQAASTTATTTQTSLVVASTSGTSTTT 307
           +   TTT   P   +T ATTT  +    +T+ T  TT
Sbjct: 483 TTTPTTTTTTPTTTTTKATTTTPTTTTTTTTTTKATT 519

  Database: UniProt/SwissProt
    Posted date:  Sat Aug 07 14:36:18 2010
  Number of letters in database: 182,829,261
  Number of sequences in database:  518,415

Lambda     K     H
   0.267   0.041    0.140
Gapped
Lambda     K     H
   0.267   0.041    0.140
Matrix: blosum62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 123,186,536,322
Number of Sequences: 518415
Number of Extensions: 123186536322
Number of Successful Extensions: 781180378
Number of sequences better than 0.0: 0