BLASTX 7.6.2
Query= UN50659 /QuerySize=984
(983 letters)
Database: GenBank nr;
15,229,318 sequences; 5,219,829,378 total letters
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gi|1351030|sp|P21239.2|RUB1_BRANA RecName: Full=RuBisCO large su... 485 6e-135
gi|15226314|ref|NP_180367.1| chaperonin-60alpha [Arabidopsis tha... 480 1e-133
gi|21554572|gb|AAM63618.1| putative rubisco subunit binding-prot... 480 1e-133
gi|62321579|dbj|BAD95121.1| putative rubisco subunit binding-pro... 478 1e-132
gi|297826149|ref|XP_002880957.1| CPN60A [Arabidopsis lyrata subs... 478 1e-132
gi|1710807|sp|P08926.2|RUBA_PEA RecName: Full=RuBisCO large subu... 455 7e-126
gi|224104681|ref|XP_002313525.1| predicted protein [Populus tric... 450 3e-124
gi|84468442|dbj|BAE71304.1| putative rubisco subunit binding-pro... 449 4e-124
gi|84468296|dbj|BAE71231.1| putative rubisco subunit binding-pro... 449 4e-124
gi|84468456|dbj|BAE71311.1| putative rubisco subunit binding-pro... 449 4e-124
gi|84468288|dbj|BAE71227.1| putative rubisco subunit binding-pro... 449 4e-124
gi|84468438|dbj|BAE71302.1| putative rubisco subunit binding-pro... 447 1e-123
gi|224132004|ref|XP_002328161.1| predicted protein [Populus tric... 447 2e-123
gi|217074850|gb|ACJ85785.1| unknown [Medicago truncatula] 446 4e-123
gi|225436538|ref|XP_002277357.1| PREDICTED: hypothetical protein... 435 5e-120
gi|242032147|ref|XP_002463468.1| hypothetical protein SORBIDRAFT... 423 4e-116
gi|31193919|gb|AAP44754.1| putative rubisco subunit binding-prot... 422 5e-116
gi|108712217|gb|ABG00012.1| RuBisCO subunit binding-protein alph... 422 5e-116
gi|125546535|gb|EAY92674.1| hypothetical protein OsI_14427 [Oryz... 422 5e-116
gi|226493235|ref|NP_001148093.1| LOC100281701 [Zea mays] 422 6e-116
>gi|1351030|sp|P21239.2|RUB1_BRANA RecName: Full=RuBisCO large subunit-binding
protein subunit alpha, chloroplastic; AltName: Full=60 kDa chaperonin
subunit alpha; AltName: Full=CPN-60 alpha; Flags: Precursor
Length = 546
Score = 485 bits (1247), Expect = 6e-135
Identities = 256/266 (96%), Positives = 259/266 (97%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA
Sbjct: 281 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 340
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQARISQLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKL+GGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 341 ASKDELQARISQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLAGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 400
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKE EDADERLGADIVQKALVAPAALI
Sbjct: 401 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPAALI 460
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWE+GYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 461 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWEIGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 520
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVVDKPKPKA AA P+GLMV
Sbjct: 521 LTTQAIVVDKPKPKAPTAAPPQGLMV 546
>gi|15226314|ref|NP_180367.1| chaperonin-60alpha [Arabidopsis thaliana]
Length = 586
Score = 480 bits (1235), Expect = 1e-133
Identities = 252/266 (94%), Positives = 258/266 (96%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA
Sbjct: 321 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 380
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQARI+QLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 381 ASKDELQARIAQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 440
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALI
Sbjct: 441 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALI 500
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAG+EGEVVVEKIMFS+WE GYNAMTDTYENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 501 AQNAGVEGEVVVEKIMFSDWENGYNAMTDTYENLFEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 560
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVVDKPKPKA AAAAPEGLMV
Sbjct: 561 LTTQAIVVDKPKPKAPAAAAPEGLMV 586
>gi|21554572|gb|AAM63618.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Arabidopsis thaliana]
Length = 586
Score = 480 bits (1235), Expect = 1e-133
Identities = 252/266 (94%), Positives = 258/266 (96%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA
Sbjct: 321 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 380
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQARI+QLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 381 ASKDELQARIAQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 440
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALI
Sbjct: 441 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALI 500
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAG+EGEVVVEKIMFS+WE GYNAMTDTYENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 501 AQNAGVEGEVVVEKIMFSDWENGYNAMTDTYENLFEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 560
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVVDKPKPKA AAAAPEGLMV
Sbjct: 561 LTTQAIVVDKPKPKAPAAAAPEGLMV 586
>gi|62321579|dbj|BAD95121.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Arabidopsis thaliana]
Length = 333
Score = 478 bits (1228), Expect = 1e-132
Identities = 251/266 (94%), Positives = 257/266 (96%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA
Sbjct: 68 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 127
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQARI+QLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 128 ASKDELQARIAQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 187
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALI
Sbjct: 188 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALI 247
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAG+EGEVVVEKIMFS+WE GYNAMTDTYENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 248 AQNAGVEGEVVVEKIMFSDWENGYNAMTDTYENLFEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 307
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVV KPKPKA AAAAPEGLMV
Sbjct: 308 LTTQAIVVGKPKPKAPAAAAPEGLMV 333
>gi|297826149|ref|XP_002880957.1| CPN60A [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata]
Length = 587
Score = 478 bits (1228), Expect = 1e-132
Identities = 254/267 (95%), Positives = 259/267 (97%), Gaps = 1/267 (0%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA
Sbjct: 321 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 380
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQARI+QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 381 ASKDELQARIAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 440
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALI
Sbjct: 441 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALI 500
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAG+EGEVVVEKIMFSEWE GYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 501 AQNAGVEGEVVVEKIMFSEWEQGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 560
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKA-AAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVVDKPKPKA AAAAAPEGLMV
Sbjct: 561 LTTQAIVVDKPKPKAPAAAAAPEGLMV 587
>gi|1710807|sp|P08926.2|RUBA_PEA RecName: Full=RuBisCO large subunit-binding
protein subunit alpha, chloroplastic; AltName: Full=60 kDa chaperonin
subunit alpha; AltName: Full=CPN-60 alpha; Flags: Precursor
Length = 587
Score = 455 bits (1169), Expect = 7e-126
Identities = 235/266 (88%), Positives = 252/266 (94%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAE+QA D+GLLVENTTI+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 322 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEFQASDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 381
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQ+R++QLKKEL ETDS+YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 382 ASKDELQSRVAQLKKELSETDSIYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 441
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPAALI
Sbjct: 442 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGTALVHLSGYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPAALI 501
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAGIEGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 502 AQNAGIEGEVVVEKIKNGEWEVGYNAMTDTYENLVESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 561
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVV+KPKPKAA AAAP+GL +
Sbjct: 562 LTTQAIVVEKPKPKAAVAAAPQGLTI 587
>gi|224104681|ref|XP_002313525.1| predicted protein [Populus trichocarpa]
Length = 586
Score = 450 bits (1155), Expect = 3e-124
Identities = 233/266 (87%), Positives = 252/266 (94%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAE+QA D+GL +ENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 321 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEFQASDLGLSIENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 380
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQARI+QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 381 ASKDELQARIAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 440
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLST +PAIKE +DADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 441 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTHVPAIKEKIKDADERLGADIVQKALVAPASLI 500
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAGIEGEVVVEK+ SEWE+GYNAMTD YENL+EAGVIDPAKVTRCALQN+ASVAGMV
Sbjct: 501 AQNAGIEGEVVVEKLKESEWEMGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNSASVAGMV 560
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVV+KPKP+ AAA+P+GL V
Sbjct: 561 LTTQAIVVEKPKPRTPAAASPQGLTV 586
>gi|84468442|dbj|BAE71304.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 461
Score = 449 bits (1154), Expect = 4e-124
Identities = 232/266 (87%), Positives = 249/266 (93%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 196 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 255
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQ+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 256 ASKDELQSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 315
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 316 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 375
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAGIEGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 376 AQNAGIEGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 435
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVV+KPKP+A AP+GL V
Sbjct: 436 LTTQAIVVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 461
>gi|84468296|dbj|BAE71231.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 588
Score = 449 bits (1154), Expect = 4e-124
Identities = 232/266 (87%), Positives = 249/266 (93%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 323 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 382
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQ+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 383 ASKDELQSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 442
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 443 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 502
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAGIEGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 503 AQNAGIEGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 562
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVV+KPKP+A AP+GL V
Sbjct: 563 LTTQAIVVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 588
>gi|84468456|dbj|BAE71311.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 588
Score = 449 bits (1154), Expect = 4e-124
Identities = 232/266 (87%), Positives = 249/266 (93%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 323 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 382
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQ+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 383 ASKDELQSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 442
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 443 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 502
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAGIEGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 503 AQNAGIEGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 562
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVV+KPKP+A AP+GL V
Sbjct: 563 LTTQAIVVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 588
>gi|84468288|dbj|BAE71227.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 578
Score = 449 bits (1154), Expect = 4e-124
Identities = 232/266 (87%), Positives = 249/266 (93%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 313 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 372
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQ+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 373 ASKDELQSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 432
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 433 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 492
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAGIEGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 493 AQNAGIEGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 552
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVV+KPKP+A AP+GL V
Sbjct: 553 LTTQAIVVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 578
>gi|84468438|dbj|BAE71302.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit [Trifolium pratense]
Length = 588
Score = 447 bits (1149), Expect = 1e-123
Identities = 231/266 (86%), Positives = 248/266 (93%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 323 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 382
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQ+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 383 ASKDELQSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 442
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGG LVHLS +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 443 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 502
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAGIEGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 503 AQNAGIEGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 562
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQA VV+KPKP+A AP+GL V
Sbjct: 563 LTTQATVVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 588
>gi|224132004|ref|XP_002328161.1| predicted protein [Populus trichocarpa]
Length = 587
Score = 447 bits (1148), Expect = 2e-123
Identities = 231/263 (87%), Positives = 249/263 (94%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAE+QA D+GL +ENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 321 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEFQASDLGLSIENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 380
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQARI+QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 381 ASKDELQARIAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 440
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLST +PAIK+ EDADERLGADIVQKALV+PA+LI
Sbjct: 441 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTCVPAIKDKIEDADERLGADIVQKALVSPASLI 500
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAGIEGEVVVEK+ SEWE+GYNAMTD YENL+EAGVIDPAKVTRCALQN+ASVAGMV
Sbjct: 501 AQNAGIEGEVVVEKLKASEWEIGYNAMTDKYENLMEAGVIDPAKVTRCALQNSASVAGMV 560
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEG 194
LTTQAIVV+KPKPK AAAA +G
Sbjct: 561 LTTQAIVVEKPKPKTPAAAATQG 583
>gi|217074850|gb|ACJ85785.1| unknown [Medicago truncatula]
Length = 587
Score = 446 bits (1145), Expect = 4e-123
Identities = 232/266 (87%), Positives = 249/266 (93%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAE+QA D+GLLVE+T I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 322 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEFQASDLGLLVESTPIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 381
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDELQ+R++QLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 382 ASKDELQSRVAQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 441
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGI PGGG LVHL +PAIKE EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 442 EDAKNATFAAIEEGIAPGGGTALVHLFAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 501
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
AQNAGIEGEVVVEKI EWE+GYNAMTDTYENL+E GVIDPAKVTR ALQNAASVAGMV
Sbjct: 502 AQNAGIEGEVVVEKIRSGEWEVGYNAMTDTYENLIEFGVIDPAKVTRRALQNAASVAGMV 561
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVV+KPKP+AAAAAAP+GL V
Sbjct: 562 LTTQAIVVEKPKPRAAAAAAPQGLTV 587
>gi|225436538|ref|XP_002277357.1| PREDICTED: hypothetical protein [Vitis
vinifera]
Length = 585
Score = 435 bits (1118), Expect = 5e-120
Identities = 222/266 (83%), Positives = 246/266 (92%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAI+TGAE+QA D+GLL+ENT+++QLG+ARKVTI+KDSTT+IADA
Sbjct: 320 KAPGFGERRKALLQDIAIMTGAEFQANDLGLLIENTSVEQLGLARKVTITKDSTTIIADA 379
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDE+QARI+Q+KKEL ETDSVYD+EKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 380 ASKDEIQARIAQIKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 439
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA VHLST +PAIK+ EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 440 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAAFVHLSTYVPAIKDKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 499
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
A NAG+EGEVVVEKI EW +GYNAMTD YENL+EAGVIDPAKV RCALQNAASVAGMV
Sbjct: 500 AHNAGVEGEVVVEKIKACEWAVGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVARCALQNAASVAGMV 559
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
LTTQAIVV+K KPKA AA P+GL +
Sbjct: 560 LTTQAIVVEKAKPKAPVAAPPQGLTI 585
>gi|242032147|ref|XP_002463468.1| hypothetical protein SORBIDRAFT_01g000380
[Sorghum bicolor]
Length = 580
Score = 423 bits (1085), Expect = 4e-116
Identities = 216/261 (82%), Positives = 240/261 (91%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAI+TGAEYQ+ D+GLLVENTT++QLGIARKVTIS STT+IADA
Sbjct: 320 KAPGFGERRKALLQDIAIVTGAEYQSKDLGLLVENTTVEQLGIARKVTISSSSTTIIADA 379
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KD++QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGA+TE ELEDRKLRI
Sbjct: 380 ASKDDIQARIAQLKRELSQTDSAYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGASTEAELEDRKLRI 439
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA VHLST +PAIKET +D +ERLGADI+QKALVAPAALI
Sbjct: 440 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSTFVPAIKETLDDPEERLGADIIQKALVAPAALI 499
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
A NAG+EGEV+V+KI SEWE GYNAM D +ENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 500 AHNAGVEGEVIVDKIRESEWEFGYNAMADKHENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 559
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAP 200
LTTQAIVV+KP+ AAAAAP
Sbjct: 560 LTTQAIVVEKPQKAPAAAAAP 580
>gi|31193919|gb|AAP44754.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
subunit precursor (60 kDa chaperonin alpha subunit) [Oryza sativa
Japonica Group]
Length = 584
Score = 422 bits (1084), Expect = 5e-116
Identities = 218/264 (82%), Positives = 244/264 (92%), Gaps = 1/264 (0%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAI+TGAE+QA D+GLLVE+TT++QLGIARKVTIS+ STT+IAD
Sbjct: 317 KAPGFGERRKALLQDIAIVTGAEFQAKDLGLLVESTTVEQLGIARKVTISQSSTTIIADV 376
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDE+QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 377 ATKDEIQARIAQLKRELSQTDSAYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 436
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA VHLS +PAIKE +D +ERLGADI+QKALVAPAALI
Sbjct: 437 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSKFVPAIKEKLDDPEERLGADIIQKALVAPAALI 496
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
A NAG+EGEV+VEKI SEWE+GYNAM D +ENL++AGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 497 AHNAGVEGEVIVEKIKESEWEVGYNAMADRHENLVQAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 556
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAA-APEG 194
LTTQAIVV+KPK KA+AA+ APEG
Sbjct: 557 LTTQAIVVEKPKKKASAASGAPEG 580
>gi|108712217|gb|ABG00012.1| RuBisCO subunit binding-protein alpha subunit,
chloroplast precursor, putative, expressed [Oryza sativa Japonica
Group]
Length = 479
Score = 422 bits (1084), Expect = 5e-116
Identities = 218/264 (82%), Positives = 244/264 (92%), Gaps = 1/264 (0%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAI+TGAE+QA D+GLLVE+TT++QLGIARKVTIS+ STT+IAD
Sbjct: 212 KAPGFGERRKALLQDIAIVTGAEFQAKDLGLLVESTTVEQLGIARKVTISQSSTTIIADV 271
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDE+QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 272 ATKDEIQARIAQLKRELSQTDSAYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 331
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA VHLS +PAIKE +D +ERLGADI+QKALVAPAALI
Sbjct: 332 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSKFVPAIKEKLDDPEERLGADIIQKALVAPAALI 391
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
A NAG+EGEV+VEKI SEWE+GYNAM D +ENL++AGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 392 AHNAGVEGEVIVEKIKESEWEVGYNAMADRHENLVQAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 451
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAA-APEG 194
LTTQAIVV+KPK KA+AA+ APEG
Sbjct: 452 LTTQAIVVEKPKKKASAASGAPEG 475
>gi|125546535|gb|EAY92674.1| hypothetical protein OsI_14427 [Oryza sativa Indica
Group]
Length = 584
Score = 422 bits (1084), Expect = 5e-116
Identities = 218/264 (82%), Positives = 244/264 (92%), Gaps = 1/264 (0%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAI+TGAE+QA D+GLLVE+TT++QLGIARKVTIS+ STT+IAD
Sbjct: 317 KAPGFGERRKALLQDIAIVTGAEFQAKDLGLLVESTTVEQLGIARKVTISQSSTTIIADV 376
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KDE+QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 377 ATKDEIQARIAQLKRELSQTDSAYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 436
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA VHLS +PAIKE +D +ERLGADI+QKALVAPAALI
Sbjct: 437 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSKFVPAIKEKLDDPEERLGADIIQKALVAPAALI 496
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
A NAG+EGEV+VEKI SEWE+GYNAM D +ENL++AGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 497 AHNAGVEGEVIVEKIKESEWEVGYNAMADRHENLVQAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 556
Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAA-APEG 194
LTTQAIVV+KPK KA+AA+ APEG
Sbjct: 557 LTTQAIVVEKPKKKASAASGAPEG 580
>gi|226493235|ref|NP_001148093.1| LOC100281701 [Zea mays]
Length = 584
Score = 422 bits (1083), Expect = 6e-116
Identities = 217/263 (82%), Positives = 242/263 (92%), Gaps = 2/263 (0%)
Frame = -2
Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
KAPGFGERRKA+LQDIAI+TGAEYQ+ D+GLLVE+TT++QLGIARKVTIS STT+IADA
Sbjct: 322 KAPGFGERRKALLQDIAIVTGAEYQSKDLGLLVEDTTVEQLGIARKVTISSSSTTIIADA 381
Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
A KD++QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAV+KVGA+TE ELEDRKLRI
Sbjct: 382 ASKDDIQARIAQLKRELSQTDSTYDSEKLAERIAKLSGGVAVVKVGASTEAELEDRKLRI 441
Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA VHLST +PAIKET +D +ERLGADI+QKALVAPAALI
Sbjct: 442 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSTFVPAIKETLDDPEERLGADIIQKALVAPAALI 501
Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
A NAG+EGEV+V+KI SEWE GYNAM D +ENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 502 AHNAGVEGEVIVDKIRESEWEFGYNAMADKHENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 561
Query: 262 LTTQAIVVDKPK--PKAAAAAAP 200
LTTQAIVV+KPK P AAAAAAP
Sbjct: 562 LTTQAIVVEKPKKAPAAAAAAAP 584
Database: GenBank nr
Posted date: Thu Sep 08 23:06:31 2011
Number of letters in database: 5,219,829,378
Number of sequences in database: 15,229,318
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Gapped
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Matrix: blosum62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 5,422,697,735,946
Number of Sequences: 15229318
Number of Extensions: 5422697735946
Number of Successful Extensions: 1278590328
Number of sequences better than 0.0: 0
|