Library    |     Search    |     Batch query    |     SNP    |     SSR  

GenBank blast output of UN50659


BLASTX 7.6.2

Query= UN50659 /QuerySize=984
        (983 letters)

Database: GenBank nr;
          15,229,318 sequences; 5,219,829,378 total letters
                                                                  Score    E
Sequences producing significant alignments:                       (bits) Value

gi|1351030|sp|P21239.2|RUB1_BRANA RecName: Full=RuBisCO large su...    485   6e-135
gi|15226314|ref|NP_180367.1| chaperonin-60alpha [Arabidopsis tha...    480   1e-133
gi|21554572|gb|AAM63618.1| putative rubisco subunit binding-prot...    480   1e-133
gi|62321579|dbj|BAD95121.1| putative rubisco subunit binding-pro...    478   1e-132
gi|297826149|ref|XP_002880957.1| CPN60A [Arabidopsis lyrata subs...    478   1e-132
gi|1710807|sp|P08926.2|RUBA_PEA RecName: Full=RuBisCO large subu...    455   7e-126
gi|224104681|ref|XP_002313525.1| predicted protein [Populus tric...    450   3e-124
gi|84468442|dbj|BAE71304.1| putative rubisco subunit binding-pro...    449   4e-124
gi|84468296|dbj|BAE71231.1| putative rubisco subunit binding-pro...    449   4e-124
gi|84468456|dbj|BAE71311.1| putative rubisco subunit binding-pro...    449   4e-124
gi|84468288|dbj|BAE71227.1| putative rubisco subunit binding-pro...    449   4e-124
gi|84468438|dbj|BAE71302.1| putative rubisco subunit binding-pro...    447   1e-123
gi|224132004|ref|XP_002328161.1| predicted protein [Populus tric...    447   2e-123
gi|217074850|gb|ACJ85785.1| unknown [Medicago truncatula]              446   4e-123
gi|225436538|ref|XP_002277357.1| PREDICTED: hypothetical protein...    435   5e-120
gi|242032147|ref|XP_002463468.1| hypothetical protein SORBIDRAFT...    423   4e-116
gi|31193919|gb|AAP44754.1| putative rubisco subunit binding-prot...    422   5e-116
gi|108712217|gb|ABG00012.1| RuBisCO subunit binding-protein alph...    422   5e-116
gi|125546535|gb|EAY92674.1| hypothetical protein OsI_14427 [Oryz...    422   5e-116
gi|226493235|ref|NP_001148093.1| LOC100281701 [Zea mays]               422   6e-116

>gi|1351030|sp|P21239.2|RUB1_BRANA RecName: Full=RuBisCO large subunit-binding
        protein subunit alpha, chloroplastic; AltName: Full=60 kDa chaperonin
        subunit alpha; AltName: Full=CPN-60 alpha; Flags: Precursor

          Length = 546

 Score =  485 bits (1247), Expect = 6e-135
 Identities = 256/266 (96%), Positives = 259/266 (97%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA
Sbjct: 281 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 340

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQARISQLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKL+GGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 341 ASKDELQARISQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLAGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 400

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKE  EDADERLGADIVQKALVAPAALI
Sbjct: 401 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPAALI 460

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWE+GYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 461 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWEIGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 520

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVVDKPKPKA  AA P+GLMV
Sbjct: 521 LTTQAIVVDKPKPKAPTAAPPQGLMV 546

>gi|15226314|ref|NP_180367.1| chaperonin-60alpha [Arabidopsis thaliana]

          Length = 586

 Score =  480 bits (1235), Expect = 1e-133
 Identities = 252/266 (94%), Positives = 258/266 (96%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA
Sbjct: 321 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 380

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQARI+QLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 381 ASKDELQARIAQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 440

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALI
Sbjct: 441 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALI 500

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAG+EGEVVVEKIMFS+WE GYNAMTDTYENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 501 AQNAGVEGEVVVEKIMFSDWENGYNAMTDTYENLFEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 560

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVVDKPKPKA AAAAPEGLMV
Sbjct: 561 LTTQAIVVDKPKPKAPAAAAPEGLMV 586

>gi|21554572|gb|AAM63618.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
        subunit [Arabidopsis thaliana]

          Length = 586

 Score =  480 bits (1235), Expect = 1e-133
 Identities = 252/266 (94%), Positives = 258/266 (96%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA
Sbjct: 321 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 380

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQARI+QLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 381 ASKDELQARIAQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 440

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALI
Sbjct: 441 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALI 500

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAG+EGEVVVEKIMFS+WE GYNAMTDTYENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 501 AQNAGVEGEVVVEKIMFSDWENGYNAMTDTYENLFEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 560

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVVDKPKPKA AAAAPEGLMV
Sbjct: 561 LTTQAIVVDKPKPKAPAAAAPEGLMV 586

>gi|62321579|dbj|BAD95121.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
        subunit [Arabidopsis thaliana]

          Length = 333

 Score =  478 bits (1228), Expect = 1e-132
 Identities = 251/266 (94%), Positives = 257/266 (96%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA
Sbjct:  68 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 127

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQARI+QLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 128 ASKDELQARIAQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 187

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALI
Sbjct: 188 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALI 247

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAG+EGEVVVEKIMFS+WE GYNAMTDTYENL EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 248 AQNAGVEGEVVVEKIMFSDWENGYNAMTDTYENLFEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 307

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVV KPKPKA AAAAPEGLMV
Sbjct: 308 LTTQAIVVGKPKPKAPAAAAPEGLMV 333

>gi|297826149|ref|XP_002880957.1| CPN60A [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata]

          Length = 587

 Score =  478 bits (1228), Expect = 1e-132
 Identities = 254/267 (95%), Positives = 259/267 (97%), Gaps = 1/267 (0%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEY A+DM LLVEN TIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA
Sbjct: 321 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYLAMDMSLLVENATIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 380

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQARI+QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 381 ASKDELQARIAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 440

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKAL++PAALI
Sbjct: 441 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALLSPAALI 500

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAG+EGEVVVEKIMFSEWE GYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 501 AQNAGVEGEVVVEKIMFSEWEQGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 560

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKA-AAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVVDKPKPKA AAAAAPEGLMV
Sbjct: 561 LTTQAIVVDKPKPKAPAAAAAPEGLMV 587

>gi|1710807|sp|P08926.2|RUBA_PEA RecName: Full=RuBisCO large subunit-binding
        protein subunit alpha, chloroplastic; AltName: Full=60 kDa chaperonin
        subunit alpha; AltName: Full=CPN-60 alpha; Flags: Precursor

          Length = 587

 Score =  455 bits (1169), Expect = 7e-126
 Identities = 235/266 (88%), Positives = 252/266 (94%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAE+QA D+GLLVENTTI+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 322 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEFQASDLGLLVENTTIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 381

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQ+R++QLKKEL ETDS+YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 382 ASKDELQSRVAQLKKELSETDSIYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 441

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGG  LVHLS  +PAIKE  EDADERLGADIVQKALVAPAALI
Sbjct: 442 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGTALVHLSGYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPAALI 501

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAGIEGEVVVEKI   EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 502 AQNAGIEGEVVVEKIKNGEWEVGYNAMTDTYENLVESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 561

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVV+KPKPKAA AAAP+GL +
Sbjct: 562 LTTQAIVVEKPKPKAAVAAAPQGLTI 587

>gi|224104681|ref|XP_002313525.1| predicted protein [Populus trichocarpa]

          Length = 586

 Score =  450 bits (1155), Expect = 3e-124
 Identities = 233/266 (87%), Positives = 252/266 (94%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAE+QA D+GL +ENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 321 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEFQASDLGLSIENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 380

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQARI+QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 381 ASKDELQARIAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 440

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLST +PAIKE  +DADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 441 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTHVPAIKEKIKDADERLGADIVQKALVAPASLI 500

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAGIEGEVVVEK+  SEWE+GYNAMTD YENL+EAGVIDPAKVTRCALQN+ASVAGMV
Sbjct: 501 AQNAGIEGEVVVEKLKESEWEMGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVTRCALQNSASVAGMV 560

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVV+KPKP+  AAA+P+GL V
Sbjct: 561 LTTQAIVVEKPKPRTPAAASPQGLTV 586

>gi|84468442|dbj|BAE71304.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
        subunit [Trifolium pratense]

          Length = 461

 Score =  449 bits (1154), Expect = 4e-124
 Identities = 232/266 (87%), Positives = 249/266 (93%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 196 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 255

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQ+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 256 ASKDELQSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 315

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGG  LVHLS  +PAIKE  EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 316 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 375

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAGIEGEVVVEKI   EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 376 AQNAGIEGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 435

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVV+KPKP+A    AP+GL V
Sbjct: 436 LTTQAIVVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 461

>gi|84468296|dbj|BAE71231.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
        subunit [Trifolium pratense]

          Length = 588

 Score =  449 bits (1154), Expect = 4e-124
 Identities = 232/266 (87%), Positives = 249/266 (93%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 323 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 382

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQ+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 383 ASKDELQSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 442

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGG  LVHLS  +PAIKE  EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 443 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 502

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAGIEGEVVVEKI   EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 503 AQNAGIEGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 562

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVV+KPKP+A    AP+GL V
Sbjct: 563 LTTQAIVVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 588

>gi|84468456|dbj|BAE71311.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
        subunit [Trifolium pratense]

          Length = 588

 Score =  449 bits (1154), Expect = 4e-124
 Identities = 232/266 (87%), Positives = 249/266 (93%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 323 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 382

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQ+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 383 ASKDELQSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 442

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGG  LVHLS  +PAIKE  EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 443 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 502

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAGIEGEVVVEKI   EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 503 AQNAGIEGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 562

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVV+KPKP+A    AP+GL V
Sbjct: 563 LTTQAIVVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 588

>gi|84468288|dbj|BAE71227.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
        subunit [Trifolium pratense]

          Length = 578

 Score =  449 bits (1154), Expect = 4e-124
 Identities = 232/266 (87%), Positives = 249/266 (93%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 313 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 372

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQ+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 373 ASKDELQSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 432

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGG  LVHLS  +PAIKE  EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 433 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 492

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAGIEGEVVVEKI   EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 493 AQNAGIEGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 552

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVV+KPKP+A    AP+GL V
Sbjct: 553 LTTQAIVVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 578

>gi|84468438|dbj|BAE71302.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
        subunit [Trifolium pratense]

          Length = 588

 Score =  447 bits (1149), Expect = 1e-123
 Identities = 231/266 (86%), Positives = 248/266 (93%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAEYQA D+GLLVENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 323 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEYQASDLGLLVENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 382

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQ+R++QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 383 ASKDELQSRVAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 442

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGG  LVHLS  +PAIKE  EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 443 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGTALVHLSAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 502

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAGIEGEVVVEKI   EWE+GYNAMTDTYENL+E+GVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 503 AQNAGIEGEVVVEKIRNGEWEVGYNAMTDTYENLIESGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 562

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQA VV+KPKP+A    AP+GL V
Sbjct: 563 LTTQATVVEKPKPRAPVPGAPQGLTV 588

>gi|224132004|ref|XP_002328161.1| predicted protein [Populus trichocarpa]

          Length = 587

 Score =  447 bits (1148), Expect = 2e-123
 Identities = 231/263 (87%), Positives = 249/263 (94%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAE+QA D+GL +ENT+I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 321 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEFQASDLGLSIENTSIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 380

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQARI+QLKKEL ETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 381 ASKDELQARIAQLKKELSETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 440

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA LVHLST +PAIK+  EDADERLGADIVQKALV+PA+LI
Sbjct: 441 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAALVHLSTCVPAIKDKIEDADERLGADIVQKALVSPASLI 500

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAGIEGEVVVEK+  SEWE+GYNAMTD YENL+EAGVIDPAKVTRCALQN+ASVAGMV
Sbjct: 501 AQNAGIEGEVVVEKLKASEWEIGYNAMTDKYENLMEAGVIDPAKVTRCALQNSASVAGMV 560

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEG 194
           LTTQAIVV+KPKPK  AAAA +G
Sbjct: 561 LTTQAIVVEKPKPKTPAAAATQG 583

>gi|217074850|gb|ACJ85785.1| unknown [Medicago truncatula]

          Length = 587

 Score =  446 bits (1145), Expect = 4e-123
 Identities = 232/266 (87%), Positives = 249/266 (93%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAILTGAE+QA D+GLLVE+T I+QLG+ARKVTISKDSTT+IADA
Sbjct: 322 KAPGFGERRKALLQDIAILTGAEFQASDLGLLVESTPIEQLGLARKVTISKDSTTIIADA 381

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDELQ+R++QLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 382 ASKDELQSRVAQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 441

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGI PGGG  LVHL   +PAIKE  EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 442 EDAKNATFAAIEEGIAPGGGTALVHLFAYVPAIKEKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 501

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           AQNAGIEGEVVVEKI   EWE+GYNAMTDTYENL+E GVIDPAKVTR ALQNAASVAGMV
Sbjct: 502 AQNAGIEGEVVVEKIRSGEWEVGYNAMTDTYENLIEFGVIDPAKVTRRALQNAASVAGMV 561

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVV+KPKP+AAAAAAP+GL V
Sbjct: 562 LTTQAIVVEKPKPRAAAAAAPQGLTV 587

>gi|225436538|ref|XP_002277357.1| PREDICTED: hypothetical protein [Vitis
        vinifera]

          Length = 585

 Score =  435 bits (1118), Expect = 5e-120
 Identities = 222/266 (83%), Positives = 246/266 (92%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAI+TGAE+QA D+GLL+ENT+++QLG+ARKVTI+KDSTT+IADA
Sbjct: 320 KAPGFGERRKALLQDIAIMTGAEFQANDLGLLIENTSVEQLGLARKVTITKDSTTIIADA 379

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDE+QARI+Q+KKEL ETDSVYD+EKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 380 ASKDEIQARIAQIKKELAETDSVYDTEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 439

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA  VHLST +PAIK+  EDADERLGADIVQKALVAPA+LI
Sbjct: 440 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAAFVHLSTYVPAIKDKLEDADERLGADIVQKALVAPASLI 499

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           A NAG+EGEVVVEKI   EW +GYNAMTD YENL+EAGVIDPAKV RCALQNAASVAGMV
Sbjct: 500 AHNAGVEGEVVVEKIKACEWAVGYNAMTDKYENLVEAGVIDPAKVARCALQNAASVAGMV 559

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAPEGLMV 185
           LTTQAIVV+K KPKA  AA P+GL +
Sbjct: 560 LTTQAIVVEKAKPKAPVAAPPQGLTI 585

>gi|242032147|ref|XP_002463468.1| hypothetical protein SORBIDRAFT_01g000380
        [Sorghum bicolor]

          Length = 580

 Score =  423 bits (1085), Expect = 4e-116
 Identities = 216/261 (82%), Positives = 240/261 (91%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAI+TGAEYQ+ D+GLLVENTT++QLGIARKVTIS  STT+IADA
Sbjct: 320 KAPGFGERRKALLQDIAIVTGAEYQSKDLGLLVENTTVEQLGIARKVTISSSSTTIIADA 379

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KD++QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGA+TE ELEDRKLRI
Sbjct: 380 ASKDDIQARIAQLKRELSQTDSAYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGASTEAELEDRKLRI 439

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA  VHLST +PAIKET +D +ERLGADI+QKALVAPAALI
Sbjct: 440 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSTFVPAIKETLDDPEERLGADIIQKALVAPAALI 499

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           A NAG+EGEV+V+KI  SEWE GYNAM D +ENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 500 AHNAGVEGEVIVDKIRESEWEFGYNAMADKHENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 559

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAAAP 200
           LTTQAIVV+KP+   AAAAAP
Sbjct: 560 LTTQAIVVEKPQKAPAAAAAP 580

>gi|31193919|gb|AAP44754.1| putative rubisco subunit binding-protein alpha
        subunit precursor (60 kDa chaperonin alpha subunit) [Oryza sativa
        Japonica Group]

          Length = 584

 Score =  422 bits (1084), Expect = 5e-116
 Identities = 218/264 (82%), Positives = 244/264 (92%), Gaps = 1/264 (0%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAI+TGAE+QA D+GLLVE+TT++QLGIARKVTIS+ STT+IAD 
Sbjct: 317 KAPGFGERRKALLQDIAIVTGAEFQAKDLGLLVESTTVEQLGIARKVTISQSSTTIIADV 376

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDE+QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 377 ATKDEIQARIAQLKRELSQTDSAYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 436

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA  VHLS  +PAIKE  +D +ERLGADI+QKALVAPAALI
Sbjct: 437 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSKFVPAIKEKLDDPEERLGADIIQKALVAPAALI 496

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           A NAG+EGEV+VEKI  SEWE+GYNAM D +ENL++AGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 497 AHNAGVEGEVIVEKIKESEWEVGYNAMADRHENLVQAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 556

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAA-APEG 194
           LTTQAIVV+KPK KA+AA+ APEG
Sbjct: 557 LTTQAIVVEKPKKKASAASGAPEG 580

>gi|108712217|gb|ABG00012.1| RuBisCO subunit binding-protein alpha subunit,
        chloroplast precursor, putative, expressed [Oryza sativa Japonica
        Group]

          Length = 479

 Score =  422 bits (1084), Expect = 5e-116
 Identities = 218/264 (82%), Positives = 244/264 (92%), Gaps = 1/264 (0%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAI+TGAE+QA D+GLLVE+TT++QLGIARKVTIS+ STT+IAD 
Sbjct: 212 KAPGFGERRKALLQDIAIVTGAEFQAKDLGLLVESTTVEQLGIARKVTISQSSTTIIADV 271

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDE+QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 272 ATKDEIQARIAQLKRELSQTDSAYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 331

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA  VHLS  +PAIKE  +D +ERLGADI+QKALVAPAALI
Sbjct: 332 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSKFVPAIKEKLDDPEERLGADIIQKALVAPAALI 391

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           A NAG+EGEV+VEKI  SEWE+GYNAM D +ENL++AGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 392 AHNAGVEGEVIVEKIKESEWEVGYNAMADRHENLVQAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 451

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAA-APEG 194
           LTTQAIVV+KPK KA+AA+ APEG
Sbjct: 452 LTTQAIVVEKPKKKASAASGAPEG 475

>gi|125546535|gb|EAY92674.1| hypothetical protein OsI_14427 [Oryza sativa Indica
        Group]

          Length = 584

 Score =  422 bits (1084), Expect = 5e-116
 Identities = 218/264 (82%), Positives = 244/264 (92%), Gaps = 1/264 (0%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAI+TGAE+QA D+GLLVE+TT++QLGIARKVTIS+ STT+IAD 
Sbjct: 317 KAPGFGERRKALLQDIAIVTGAEFQAKDLGLLVESTTVEQLGIARKVTISQSSTTIIADV 376

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KDE+QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI
Sbjct: 377 ATKDEIQARIAQLKRELSQTDSAYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 436

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA  VHLS  +PAIKE  +D +ERLGADI+QKALVAPAALI
Sbjct: 437 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSKFVPAIKEKLDDPEERLGADIIQKALVAPAALI 496

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           A NAG+EGEV+VEKI  SEWE+GYNAM D +ENL++AGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 497 AHNAGVEGEVIVEKIKESEWEVGYNAMADRHENLVQAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 556

Query: 262 LTTQAIVVDKPKPKAAAAA-APEG 194
           LTTQAIVV+KPK KA+AA+ APEG
Sbjct: 557 LTTQAIVVEKPKKKASAASGAPEG 580

>gi|226493235|ref|NP_001148093.1| LOC100281701 [Zea mays]

          Length = 584

 Score =  422 bits (1083), Expect = 6e-116
 Identities = 217/263 (82%), Positives = 242/263 (92%), Gaps = 2/263 (0%)
 Frame = -2

Query: 982 KAPGFGERRKAMLQDIAILTGAEYQALDMGLLVENTTIDQLGIARKVTISKDSTTLIADA 803
           KAPGFGERRKA+LQDIAI+TGAEYQ+ D+GLLVE+TT++QLGIARKVTIS  STT+IADA
Sbjct: 322 KAPGFGERRKALLQDIAIVTGAEYQSKDLGLLVEDTTVEQLGIARKVTISSSSTTIIADA 381

Query: 802 APKDELQARISQLKKELFETDSVYDSEKLAERIAKLSGGVAVIKVGAATETELEDRKLRI 623
           A KD++QARI+QLK+EL +TDS YDSEKLAERIAKLSGGVAV+KVGA+TE ELEDRKLRI
Sbjct: 382 ASKDDIQARIAQLKRELSQTDSTYDSEKLAERIAKLSGGVAVVKVGASTEAELEDRKLRI 441

Query: 622 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGATLVHLSTVIPAIKETFEDADERLGADIVQKALVAPAALI 443
           EDAKNATFAAIEEGIVPGGGA  VHLST +PAIKET +D +ERLGADI+QKALVAPAALI
Sbjct: 442 EDAKNATFAAIEEGIVPGGGAAYVHLSTFVPAIKETLDDPEERLGADIIQKALVAPAALI 501

Query: 442 AQNAGIEGEVVVEKIMFSEWELGYNAMTDTYENLLEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 263
           A NAG+EGEV+V+KI  SEWE GYNAM D +ENL+EAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV
Sbjct: 502 AHNAGVEGEVIVDKIRESEWEFGYNAMADKHENLVEAGVIDPAKVTRCALQNAASVAGMV 561

Query: 262 LTTQAIVVDKPK--PKAAAAAAP 200
           LTTQAIVV+KPK  P AAAAAAP
Sbjct: 562 LTTQAIVVEKPKKAPAAAAAAAP 584

  Database: GenBank nr
    Posted date:  Thu Sep 08 23:06:31 2011
  Number of letters in database: 5,219,829,378
  Number of sequences in database:  15,229,318

Lambda     K     H
   0.267   0.041    0.140
Gapped
Lambda     K     H
   0.267   0.041    0.140
Matrix: blosum62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 5,422,697,735,946
Number of Sequences: 15229318
Number of Extensions: 5422697735946
Number of Successful Extensions: 1278590328
Number of sequences better than 0.0: 0