BLASTX 7.6.2
Query= RU29189 /QuerySize=179
(178 letters)
Database: TAIR9 protein;
33,410 sequences; 13,468,323 total letters
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
TAIR9_protein||AT1G26240.1 | Symbols: | proline-rich extensin-l... 102 7e-023
TAIR9_protein||AT1G26250.1 | Symbols: | proline-rich extensin, ... 101 1e-022
>TAIR9_protein||AT1G26240.1 | Symbols: | proline-rich extensin-like family
protein | chr1:9078140-9079576 REVERSE
Length = 479
Score = 102 bits (252), Expect = 7e-023
Identities = 43/59 (72%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP YIYKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 54 PYVYSSPPPPP--YIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSP 110
Score = 102 bits (252), Expect = 7e-023
Identities = 43/59 (72%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP YIYKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 74 PYVYSSPPPPP--YIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 130
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 114 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 170
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 134 PYVYNSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 190
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 154 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 210
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 174 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 230
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 194 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 250
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 214 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 270
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 234 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 290
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 254 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 310
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 274 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 330
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 374 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 430
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 394 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 450
Score = 100 bits (248), Expect = 2e-022
Identities = 41/59 (69%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP + PPPPY YKSP
Sbjct: 94 PYVYSSPPPPP--YIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSP 150
Score = 100 bits (248), Expect = 2e-022
Identities = 41/59 (69%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP + PPPPY YKSP
Sbjct: 294 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSP 350
Score = 99 bits (244), Expect = 6e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 43/59 (72%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PYIYKSPPPPP Y Y SPPPP YIYKSPPPP Y+Y SPPPP PPPPY Y SP
Sbjct: 64 PYIYKSPPPPP--YVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSP 120
Score = 99 bits (244), Expect = 6e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 43/59 (72%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PYIYKSPPPPP Y Y SPPPP YIYKSPPPP Y+Y SPPPP PPPPY Y SP
Sbjct: 84 PYIYKSPPPPP--YVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSP 140
Score = 98 bits (243), Expect = 8e-022
Identities = 41/59 (69%), Positives = 44/59 (74%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PP PY YKSP
Sbjct: 314 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPSPYVYKSP 370
>TAIR9_protein||AT1G26250.1 | Symbols: | proline-rich extensin, putative |
chr1:9083903-9085234 FORWARD
Length = 444
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+YKSPPPPP Y Y SPPPP Y+YKSPPPP Y+Y SPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 104 PYVYKSPPPPP--YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 160
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 184 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 240
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 204 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 260
Score = 101 bits (251), Expect = 1e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 224 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 280
Score = 99 bits (246), Expect = 4e-022
Identities = 41/59 (69%), Positives = 44/59 (74%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y Y SPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 74 PYVYSSPPPPP--YVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 130
Score = 99 bits (246), Expect = 4e-022
Identities = 41/59 (69%), Positives = 44/59 (74%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY Y SP
Sbjct: 94 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSP 150
Score = 99 bits (246), Expect = 4e-022
Identities = 41/59 (69%), Positives = 45/59 (76%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+YKSPPPPP Y Y SPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY Y+SP
Sbjct: 124 PYVYKSPPPPP--YVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSPPPPPPYVYQSP 180
Score = 99 bits (246), Expect = 4e-022
Identities = 41/59 (69%), Positives = 44/59 (74%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY Y SP
Sbjct: 244 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSP 300
Score = 99 bits (246), Expect = 4e-022
Identities = 41/59 (69%), Positives = 44/59 (74%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+YKSPPPPP Y Y SPPPP Y+YKSPPPP Y+Y SPPPP S PPPPY Y SP
Sbjct: 254 PYVYKSPPPPP--YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSP 310
Score = 99 bits (246), Expect = 4e-022
Identities = 41/59 (69%), Positives = 44/59 (74%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y YKSPPPP Y+Y SPPPP Y+Y SPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 264 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 320
Score = 98 bits (243), Expect = 8e-022
Identities = 42/59 (71%), Positives = 46/59 (77%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPPP Y Y+SPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP S PPPPY YKSP
Sbjct: 164 PYVY-SPPPPPP-YVYQSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSP 220
Score = 98 bits (243), Expect = 8e-022
Identities = 40/59 (67%), Positives = 44/59 (74%), Gaps = 2/59 (3%)
Frame = +2
Query: 2 PYIYKSPPPPPPKYYYKSPPPPTYIYKSPPPPTYIYKSPPPPSPSPSHSPPPPYYYKSP 178
PY+Y SPPPPP Y Y SPPPP Y+Y SPPPP Y+YKSPPPP + PPPPY YKSP
Sbjct: 284 PYVYSSPPPPP--YVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYTSPPPPPYVYKSP 340
Database: TAIR9 protein
Posted date: Wed Jul 08 15:16:08 2009
Number of letters in database: 13,468,323
Number of sequences in database: 33,410
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Gapped
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Matrix: blosum62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 4,805,693,934
Number of Sequences: 33410
Number of Extensions: 4805693934
Number of Successful Extensions: 258754419
Number of sequences better than 0.0: 0
|