BLASTX 7.6.2
Query= RU03685 /QuerySize=1604
(1603 letters)
Database: GenBank nr;
7,387,702 sequences; 2,551,671,255 total letters
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gi|76262500|gb|ABA41400.1| pherophorin-C2 protein precursor [Chl... 236 7e-060
gi|73852674|ref|YP_293958.1| hypothetical protein EhV204 [Emilia... 230 5e-058
gi|209968037|ref|YP_002296212.1| putative membrane protein [Emil... 230 5e-058
>gi|76262500|gb|ABA41400.1| pherophorin-C2 protein precursor [Chlamydomonas
reinhardtii]
Length = 853
Score = 236 bits (600), Expect = 7e-060
Identities = 120/218 (55%), Positives = 122/218 (55%), Gaps = 11/218 (5%)
Frame = -1
Query: 1510 PRKPRQNYPYSSPPPPASPPYHYKSPPPP-PPPVHYAPPHHPYYPPKSPPKPPVYS-PPP 1337
P P + P SPPPP+ PP SPPPP PPP PP P PP SPP PP S PPP
Sbjct: 290 PPPPPPSPPPPSPPPPSPPPPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPPPPSPPPPPPPSPPPP 349
Query: 1336 PPPSPPPPKVPYYYKSPPPPPPKKPYHYSSPPPPPPSPPPKKPYHYKSPPPPHKKPHYPP 1157
PPPSPPPP P PP PPP P S PPPPPPSPPP P PPPP P PP
Sbjct: 350 PPPSPPPPSPP-----PPSPPPPSPPPPSPPPPPPPSPPPPPPPSPPPPPPPSPPPPSPP 404
Query: 1156 KSPPKPPVYSPPKHPHYPPHYPPKSPPKPPVYHYKSPPPPPPSPPPPSPPPPKVPYHYKS 977
PP PP SPP PP PP SPP PP PPPPPPSPPPP PP P P
Sbjct: 405 --PPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPP--PPSPPPPPPPSPPPPPPPSPPPPPPPSP 460
Query: 976 PPPPPPHKKPYHPHHSPPPPKKPYHYSSPPPPPPSPPP 863
PPPPPP P P PPP P S PPPPPPSPPP
Sbjct: 461 PPPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPPPPSPPP 498
Score = 236 bits (600), Expect = 7e-060
Identities = 123/224 (54%), Positives = 125/224 (55%), Gaps = 17/224 (7%)
Frame = -1
Query: 1516 PSPRKPRQNYPYSSPPPPASPPYHYKSPPPPPPPVHYAPPHHPYYPPKSPPKPPVYSPP- 1340
P P P + P SPPPP+ PP P PPPPP PP P PP SPP PP SPP
Sbjct: 208 PPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPPPPSPPPPSP--PPPSPPPPPPPSPPP 265
Query: 1339 --PPPPSPPPPKVPYYYKSPPPPPPKKPYHYSSPPPPPPSPPPKKPYHYKSPPPPHKKPH 1166
PPPPSPPPP P SPPPPPP P PPPPPPSPPP P PPPP P
Sbjct: 266 PSPPPPSPPPPPPP----SPPPPPPPSP-----PPPPPPSPPPPSPPPPSPPPPPPPSPP 316
Query: 1165 YPPKSPPKPPVYS-PPKHPHYPPHYPPKSPPKPPVYHYKSPPPPPPSPPPPSPPPPK-VP 992
P PP PP S PP P PP PP SPP PP P PPPPSPPPPSPPPP P
Sbjct: 317 PPSPPPPSPPPPSPPPPPPPSPPPPPPPSPPPPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPP 376
Query: 991 YHYKSPPPPPPHKKPYHPHHSPPPPKKPYHYSSPP-PPPPSPPP 863
SPPPPPP P P SPPPP P PP PPPPSPPP
Sbjct: 377 PPPPSPPPPPPPSPPPPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPP 420
>gi|73852674|ref|YP_293958.1| hypothetical protein EhV204 [Emiliania huxleyi
virus 86]
Length = 621
Score = 230 bits (584), Expect = 5e-058
Identities = 131/304 (43%), Positives = 141/304 (46%), Gaps = 8/304 (2%)
Frame = -1
Query: 1519 SPSPRKPRQNYPYSSPPPPASPPYHYKSPPPPPPPVHYAPPHHPYYPPKSPPKPPVYSPP 1340
SP P +P + P SPPPP+ PP P PPPPP PP P PP SPP P P
Sbjct: 119 SPPPSQPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPPSPPPPPPPPSPPPPSPPPPSPPPPS 178
Query: 1339 PPPPSPPPPKVPYYYKSPPPPPPKKPYHYSSPP--PPPPSPPPKKPYHYKSPPPPHKKPH 1166
PPPPSPPPP P PP PPP P S PP PPPPSPPP P PPP P
Sbjct: 179 PPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPS 238
Query: 1165 YPPKSPP---KPPVYSPPKHPHYPPHYPPKSPPKPPVYHYKSPPPPPPSPPPPSPPPPKV 995
PP SPP PP PP P PP P PP PP P PPPPSPPPPSPPPP
Sbjct: 239 PPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSP 298
Query: 994 PYHYKSPPPP-PPHKKPYHPHHSPPPPKKPYHYSSPPPPPPSPPPKEAILLQVSTTTTTT 818
P SPPPP PP P P SPPP P P PPPPSPPP +
Sbjct: 299 P--PPSPPPPSPPPPSPPPPPPSPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPP 356
Query: 817 QEALPPTPLTTTTTNPITTKEAIPLQVSSTTNTSLLTTSPPLLPPQVTT*ATSLLTTQAP 638
PP+P + P + P S + + PP PP + S P
Sbjct: 357 PSPPPPSPPPPSPPPPPPSPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPP 416
Query: 637 PLPS 626
P PS
Sbjct: 417 PPPS 420
Score = 229 bits (582), Expect = 8e-058
Identities = 141/339 (41%), Positives = 154/339 (45%), Gaps = 17/339 (5%)
Frame = -1
Query: 1516 PSPRKPRQNYPYSSPPPPASPPYHYKSPPP--PPPPVHYAPPHHPYYPPKSPPKPPVYSP 1343
P P P + P SPPPP+ PP SPPP PPPP PP P PP SPP P P
Sbjct: 225 PPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPP---PSPPPPSPPPPSPPPPPPPPSPPPPSPPPPSPPPP 281
Query: 1342 PPPPPSPPPPKVPYYYKSPPPPPPKKPYHYSSPPPPPPSPPPKKPYHYKSPPPPHKKPHY 1163
PPPPSPPPP P PP PPP P SPPPPPPSPPP P SPPPP P
Sbjct: 282 SPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSP-PPPSPPPPPPSPPPSPP--PPSPPPPSPPPPS 338
Query: 1162 PP---KSPPKPPVYSPPKHPHYPPHYPPKSPPKPPVYHYKSPP---PPPPSPPPPSPPPP 1001
PP PP PP SPP PP PP SPP PP SPP PPPPSPPPPSPPPP
Sbjct: 339 PPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPPPSPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPP 398
Query: 1000 KVPYHYKSPPPPPPHKKPYHPHHSP--PPPKKPYHYSSPPPPPPSPPPKEAILLQVSTTT 827
P PP PPP P P P PPP P S P PPPPSPPP +
Sbjct: 399 SPPPPSPPPPSPPPPSPPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPS 458
Query: 826 TTTQEALPPTPLTTTTTNPITTKEAIPLQVSSTTNTSLLTTSPPLLPPQVTT*ATSLLTT 647
PP+P + P + P S + + PP PP + S
Sbjct: 459 PPPPSPPPPSP-PPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPP 517
Query: 646 QAPPLPSQVATLTNSTSVLTTQAPSLPSQVTTFPNTTSV 530
PP P ++ P LP +T N T +
Sbjct: 518 SPPPSPPPSHPPSHPPMHPPMHPPFLPPTTSTGLNKTQI 556
>gi|209968037|ref|YP_002296212.1| putative membrane protein [Emiliania huxleyi
virus 86]
Length = 605
Score = 230 bits (584), Expect = 5e-058
Identities = 131/304 (43%), Positives = 141/304 (46%), Gaps = 8/304 (2%)
Frame = -1
Query: 1519 SPSPRKPRQNYPYSSPPPPASPPYHYKSPPPPPPPVHYAPPHHPYYPPKSPPKPPVYSPP 1340
SP P +P + P SPPPP+ PP P PPPPP PP P PP SPP P P
Sbjct: 103 SPPPSQPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPPSPPPPPPPPSPPPPSPPPPSPPPPS 162
Query: 1339 PPPPSPPPPKVPYYYKSPPPPPPKKPYHYSSPP--PPPPSPPPKKPYHYKSPPPPHKKPH 1166
PPPPSPPPP P PP PPP P S PP PPPPSPPP P PPP P
Sbjct: 163 PPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPS 222
Query: 1165 YPPKSPP---KPPVYSPPKHPHYPPHYPPKSPPKPPVYHYKSPPPPPPSPPPPSPPPPKV 995
PP SPP PP PP P PP P PP PP P PPPPSPPPPSPPPP
Sbjct: 223 PPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSP 282
Query: 994 PYHYKSPPPP-PPHKKPYHPHHSPPPPKKPYHYSSPPPPPPSPPPKEAILLQVSTTTTTT 818
P SPPPP PP P P SPPP P P PPPPSPPP +
Sbjct: 283 P--PPSPPPPSPPPPSPPPPPPSPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPP 340
Query: 817 QEALPPTPLTTTTTNPITTKEAIPLQVSSTTNTSLLTTSPPLLPPQVTT*ATSLLTTQAP 638
PP+P + P + P S + + PP PP + S P
Sbjct: 341 PSPPPPSPPPPSPPPPPPSPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPPPPSPP 400
Query: 637 PLPS 626
P PS
Sbjct: 401 PPPS 404
Database: GenBank nr
Posted date: Wed Dec 03 02:04:20 2008
Number of letters in database: 2,551,671,255
Number of sequences in database: 7,387,702
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Gapped
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Matrix: blosum62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 121,122,045,638
Number of Sequences: 7387702
Number of Extensions: 121122045638
Number of Successful Extensions: 65962939
Number of sequences better than 0.0: 0
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