BLASTX 7.6.2
Query= RU05716 /QuerySize=258
(257 letters)
Database: GenBank nr;
7,387,702 sequences; 2,551,671,255 total letters
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gi|60701768|gb|AAX31127.1| SJCHGC09842 protein [Schistosoma japo... 57 3e-007
gi|76162433|gb|AAX30253.2| SJCHGC02429 protein [Schistosoma japo... 57 4e-007
gi|76162184|gb|ABA40774.1| SJCHGC01971 protein [Schistosoma japo... 55 1e-006
gi|60687724|gb|AAX30195.1| SJCHGC01967 protein [Schistosoma japo... 55 1e-006
>gi|60701768|gb|AAX31127.1| SJCHGC09842 protein [Schistosoma japonicum]
Length = 89
Score = 57 bits (137), Expect = 3e-007
Identities = 26/31 (83%), Positives = 27/31 (87%)
Frame = +1
Query: 118 EGLYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYITISLLK 210
E +YIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYI I LK
Sbjct: 51 EDIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIKCLK 81
>gi|76162433|gb|AAX30253.2| SJCHGC02429 protein [Schistosoma japonicum]
Length = 79
Score = 57 bits (136), Expect = 4e-007
Identities = 26/32 (81%), Positives = 27/32 (84%)
Frame = -1
Query: 221 TSIGFNRLIVIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIY 126
TS+ N I IYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 35 TSVTTNSYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIY 66
Score = 55 bits (131), Expect = 1e-006
Identities = 24/24 (100%)
Frame = -3
Query: 198 NSYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYI 127
NSYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 40 NSYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYI 63
>gi|76162184|gb|ABA40774.1| SJCHGC01971 protein [Schistosoma japonicum]
Length = 54
Score = 55 bits (132), Expect = 1e-006
Identities = 27/37 (72%)
Frame = +3
Query: 126 IYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYNY*PIEAYRSLI*QH 236
IYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIY Y P Y L H
Sbjct: 18 IYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIPAITYDLLFIFH 54
>gi|60687724|gb|AAX30195.1| SJCHGC01967 protein [Schistosoma japonicum]
Length = 72
Score = 55 bits (131), Expect = 1e-006
Identities = 24/32 (75%), Positives = 28/32 (87%)
Frame = -2
Query: 193 LYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIALPLRDHFL 98
+YIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYI + + + FL
Sbjct: 15 IYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYNQFL 46
Database: GenBank nr
Posted date: Wed Dec 03 02:04:20 2008
Number of letters in database: 2,551,671,255
Number of sequences in database: 7,387,702
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Gapped
Lambda K H
0.267 0.041 0.140
Matrix: blosum62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 168,862,090,769
Number of Sequences: 7387702
Number of Extensions: 168862090769
Number of Successful Extensions: 83690393
Number of sequences better than 0.0: 0
|